Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Gm17206-201ENSMUST00000168123 577 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Gm20538F6Z9R1 Ctla2b-202ENSMUST00000171347 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Gm20538F6Z9R1 Gm18604-201ENSMUST00000172535 558 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Gm20538F6Z9R1 Gm16451-201ENSMUST00000173484 924 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Gm20538F6Z9R1 Vmn1r113-202ENSMUST00000173723 924 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Gm20538F6Z9R1 Gm20530-201ENSMUST00000174261 254 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Gm20538F6Z9R1 Gm8902-201ENSMUST00000174341 1096 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Gm20538F6Z9R1 Vmn1r158-201ENSMUST00000174643 924 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Gm20538F6Z9R1 Vmn2r-ps12-201ENSMUST00000175833 623 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Gm20538F6Z9R1 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Gm20538F6Z9R1 Gm5885-201ENSMUST00000178578 648 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Gm20538F6Z9R1 1500015L24Rik-202ENSMUST00000179640 780 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Gm20538F6Z9R1 Gm26532-201ENSMUST00000180630 690 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Gm20538F6Z9R1 C130060C02Rik-201ENSMUST00000181731 1142 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Gm20538F6Z9R1 Gm26972-201ENSMUST00000183218 344 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Gm20538F6Z9R1 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Gm20538F6Z9R1 E330020D12Rik-203ENSMUST00000188717 766 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Gm20538F6Z9R1 Gm28997-201ENSMUST00000188759 429 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Gm20538F6Z9R1 Gm28267-201ENSMUST00000191093 265 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Gm20538F6Z9R1 9430083B18Rik-201ENSMUST00000191908 863 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Gm20538F6Z9R1 Gm36398-201ENSMUST00000192255 696 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Gm20538F6Z9R1 Gm33206-201ENSMUST00000193544 454 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Gm20538F6Z9R1 Gm38163-201ENSMUST00000194112 482 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Gm20538F6Z9R1 Gm30312-201ENSMUST00000194516 696 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Gm20538F6Z9R1 Gm2474-201ENSMUST00000195162 559 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Gm20538F6Z9R1 Tmbim7-204ENSMUST00000198739 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Gm20538F6Z9R1 4930599N24Rik-201ENSMUST00000198822 1003 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Gm20538F6Z9R1 Gm43145-201ENSMUST00000198963 628 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Gm20538F6Z9R1 Oaz3-204ENSMUST00000199678 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Gm20538F6Z9R1 Olfr519-202ENSMUST00000202706 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Gm20538F6Z9R1 Gm43941-201ENSMUST00000203303 1073 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Gm20538F6Z9R1 Gm5318-201ENSMUST00000205249 406 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Gm20538F6Z9R1 Gm45227-201ENSMUST00000205585 169 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Gm20538F6Z9R1 Gm44738-201ENSMUST00000206393 371 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Gm20538F6Z9R1 Gm45135-201ENSMUST00000206787 1184 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Gm20538F6Z9R1 Gm45463-202ENSMUST00000210735 1188 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Gm20538F6Z9R1 Gm4924-205ENSMUST00000211099 490 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Gm20538F6Z9R1 Gm45409-201ENSMUST00000211486 252 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Gm20538F6Z9R1 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Gm20538F6Z9R1 Gm3889-201ENSMUST00000212467 612 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Gm20538F6Z9R1 Gm35024-201ENSMUST00000213359 972 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Gm20538F6Z9R1 Olfr1142-ps1-201ENSMUST00000213624 805 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Gm20538F6Z9R1 1700054O05Rik-201ENSMUST00000214107 555 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Gm20538F6Z9R1 Gm18252-201ENSMUST00000214814 527 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Gm20538F6Z9R1 Gm18252-202ENSMUST00000214886 409 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Gm20538F6Z9R1 Olfr228-201ENSMUST00000216534 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Gm20538F6Z9R1 Trdn-202ENSMUST00000217779 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Gm20538F6Z9R1 Gm40685-201ENSMUST00000217861 580 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Gm20538F6Z9R1 AC087891.1-201ENSMUST00000217867 318 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Gm20538F6Z9R1 AC166361.1-201ENSMUST00000218567 403 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Gm20538F6Z9R1 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Gm20538F6Z9R1 Gm35696-202ENSMUST00000220364 778 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Gm20538F6Z9R1 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Gm20538F6Z9R1 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Gm20538F6Z9R1 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Gm20538F6Z9R1 Gm18030-201ENSMUST00000222163 731 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Gm20538F6Z9R1 AC135377.1-201ENSMUST00000223692 463 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Gm20538F6Z9R1 AC154623.1-201ENSMUST00000224348 805 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Gm20538F6Z9R1 CT025618.1-201ENSMUST00000227409 1279 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Gm20538F6Z9R1 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Gm20538F6Z9R1 AC157772.2-201ENSMUST00000228202 259 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Gm20538F6Z9R1 AC137871.1-201ENSMUST00000228278 475 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Gm20538F6Z9R1 Rida-201ENSMUST00000022946 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Gm20538F6Z9R1 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Gm20538F6Z9R1 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Gm20538F6Z9R1 Ccr8-201ENSMUST00000048777 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Gm20538F6Z9R1 Olfr1437-201ENSMUST00000052558 1177 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Gm20538F6Z9R1 Olfr776-201ENSMUST00000073704 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Gm20538F6Z9R1 Rpl10-ps3-201ENSMUST00000076364 768 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Gm20538F6Z9R1 Gm16442-201ENSMUST00000079099 924 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Gm20538F6Z9R1 Olfr285-201ENSMUST00000079736 960 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Gm20538F6Z9R1 Mir3068-201ENSMUST00000083004 136 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Gm20538F6Z9R1 Olfr467-201ENSMUST00000084756 927 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Gm20538F6Z9R1 Olfr206-201ENSMUST00000084791 1005 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Gm20538F6Z9R1 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Gm20538F6Z9R1 Zfp995-201ENSMUST00000106026 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Gm20538F6Z9R1 Arl13a-201ENSMUST00000064476 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Gm20538F6Z9R1 March1-202ENSMUST00000072482 3953 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Gm20538F6Z9R1 Abcc2-202ENSMUST00000099413 1926 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Gm20538F6Z9R1 Anapc10-201ENSMUST00000048147 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Gm20538F6Z9R1 Zfp300-201ENSMUST00000040667 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Gm20538F6Z9R1 Vmn1r21-202ENSMUST00000203488 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Gm20538F6Z9R1 Senp8-207ENSMUST00000217093 1663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Gm20538F6Z9R1 Ghr-208ENSMUST00000161561 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Gm20538F6Z9R1 Elavl4-202ENSMUST00000102723 4024 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Gm20538F6Z9R1 Cylc2-201ENSMUST00000041392 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Gm20538F6Z9R1 Olfr1012-202ENSMUST00000214255 3115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Gm20538F6Z9R1 Gm45129-201ENSMUST00000208444 2224 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Gm20538F6Z9R1 Gm37100-201ENSMUST00000193344 1353 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Gm20538F6Z9R1 Vmn1r49-202ENSMUST00000203791 1356 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Gm20538F6Z9R1 Phf11a-201ENSMUST00000062307 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Gm20538F6Z9R1 Serpina1d-201ENSMUST00000078869 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Gm20538F6Z9R1 AC158921.1-201ENSMUST00000227861 3468 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Gm20538F6Z9R1 Gm6902-202ENSMUST00000191169 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Gm20538F6Z9R1 Gm6176-202ENSMUST00000207633 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Gm20538F6Z9R1 Gmnc-201ENSMUST00000089832 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Gm20538F6Z9R1 Gm11674-201ENSMUST00000124855 3005 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Gm20538F6Z9R1 Ralgapa1-211ENSMUST00000220367 7473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Gm20538F6Z9R1 Scml2-203ENSMUST00000077375 3550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Gm20538F6Z9R1 Myo1h-209ENSMUST00000199567 1307 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms