Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Lrrc9-206ENSMUST00000162159 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
PtprbB2RU80 Vmn1r198-204ENSMUST00000227167 5990 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PtprbB2RU80 Gm37685-201ENSMUST00000193507 2177 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PtprbB2RU80 Gm37079-201ENSMUST00000194114 2135 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PtprbB2RU80 Gm43577-201ENSMUST00000197090 3344 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PtprbB2RU80 Gm5796-201ENSMUST00000096184 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
PtprbB2RU80 Gm37902-201ENSMUST00000192839 1683 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PtprbB2RU80 Trim2-204ENSMUST00000107692 7161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
PtprbB2RU80 Olfr1504-202ENSMUST00000209192 1514 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PtprbB2RU80 Gm37775-201ENSMUST00000194120 2313 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PtprbB2RU80 AC144733.2-201ENSMUST00000222552 2292 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PtprbB2RU80 Vmn1r124-201ENSMUST00000105200 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PtprbB2RU80 Gm5405-201ENSMUST00000120478 609 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PtprbB2RU80 C030037F17Rik-201ENSMUST00000155211 406 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
PtprbB2RU80 Gm5795-202ENSMUST00000166275 612 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PtprbB2RU80 Gm8279-203ENSMUST00000170040 612 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PtprbB2RU80 Gm22355-201ENSMUST00000175531 96 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PtprbB2RU80 Gm10413-202ENSMUST00000177913 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PtprbB2RU80 Gm9602-202ENSMUST00000177973 615 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PtprbB2RU80 Gm10338-202ENSMUST00000178623 612 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PtprbB2RU80 Gm3012-202ENSMUST00000179486 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PtprbB2RU80 2610203C20Rik-206ENSMUST00000181814 2996 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
PtprbB2RU80 Gm27855-201ENSMUST00000184122 128 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PtprbB2RU80 Gm28188-201ENSMUST00000190483 236 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PtprbB2RU80 Ighv1-19-1-201ENSMUST00000192823 351 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PtprbB2RU80 Ighv1-35-201ENSMUST00000195265 351 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PtprbB2RU80 1700065J11Rik-201ENSMUST00000201560 424 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
PtprbB2RU80 Gm15754-202ENSMUST00000202846 758 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PtprbB2RU80 AL607142.1-201ENSMUST00000226560 78 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PtprbB2RU80 Agr3-201ENSMUST00000042101 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
PtprbB2RU80 Zfp758-202ENSMUST00000088765 2973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
PtprbB2RU80 Spink13-201ENSMUST00000097557 796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
PtprbB2RU80 Olfr688-201ENSMUST00000098155 966 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PtprbB2RU80 AC121942.1-201ENSMUST00000224459 2891 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PtprbB2RU80 Pramel3-201ENSMUST00000113176 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
PtprbB2RU80 Gabra3-201ENSMUST00000055966 3662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
PtprbB2RU80 Gm18853-201ENSMUST00000183629 3596 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PtprbB2RU80 Rbm41-201ENSMUST00000033810 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
PtprbB2RU80 LOC102637012-201ENSMUST00000217248 2562 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PtprbB2RU80 Carf-209ENSMUST00000187978 5463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
PtprbB2RU80 Gm3182-201ENSMUST00000167902 1753 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PtprbB2RU80 Plch1-210ENSMUST00000162269 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
PtprbB2RU80 Gm14324-201ENSMUST00000121358 3051 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PtprbB2RU80 Slfn4-201ENSMUST00000000208 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
PtprbB2RU80 Olfr190-203ENSMUST00000216495 8240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PtprbB2RU80 Cnr1-202ENSMUST00000084736 5761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PtprbB2RU80 Olfr398-202ENSMUST00000117510 5135 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PtprbB2RU80 Plxna4os2-201ENSMUST00000152538 2044 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
PtprbB2RU80 Olfr1054-202ENSMUST00000213205 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PtprbB2RU80 Zbbx-203ENSMUST00000107776 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PtprbB2RU80 Gm44660-201ENSMUST00000207134 2465 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PtprbB2RU80 Ipo5-201ENSMUST00000032898 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
PtprbB2RU80 Gm37249-201ENSMUST00000195185 2869 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
PtprbB2RU80 Dtna-203ENSMUST00000220904 3860 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
PtprbB2RU80 Rpl36a-201ENSMUST00000113211 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
PtprbB2RU80 Gm16007-201ENSMUST00000117837 286 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
PtprbB2RU80 Gm11679-201ENSMUST00000121830 779 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
PtprbB2RU80 Hnf1aos2-201ENSMUST00000138108 442 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.6
PtprbB2RU80 Gm11507-201ENSMUST00000156462 412 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
PtprbB2RU80 Gm17511-201ENSMUST00000172206 342 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
PtprbB2RU80 Gm21917-201ENSMUST00000177831 666 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.6
PtprbB2RU80 Gm29474-201ENSMUST00000187688 379 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
PtprbB2RU80 Gm28429-201ENSMUST00000188521 363 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
PtprbB2RU80 Gm42716-201ENSMUST00000196003 680 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
PtprbB2RU80 Gm18007-201ENSMUST00000205019 844 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
PtprbB2RU80 Gm6702-201ENSMUST00000208496 471 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
PtprbB2RU80 Gm29521-203ENSMUST00000216148 805 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
PtprbB2RU80 Spata9-201ENSMUST00000022081 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
PtprbB2RU80 AC154636.1-201ENSMUST00000223226 126 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
PtprbB2RU80 Vmn1r39-202ENSMUST00000226783 918 ntAPPRIS P2 BASIC5.09□□□□□ -1.6
PtprbB2RU80 Olfr655-201ENSMUST00000057385 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.6
PtprbB2RU80 Gm5941-201ENSMUST00000096371 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
PtprbB2RU80 Dnah3-204ENSMUST00000209154 12265 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
PtprbB2RU80 Zfand6-201ENSMUST00000069537 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
PtprbB2RU80 Olfr527-202ENSMUST00000214143 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
PtprbB2RU80 Gm37773-201ENSMUST00000194141 2120 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
PtprbB2RU80 Olfr384-202ENSMUST00000214228 2576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
PtprbB2RU80 AC158605.3-201ENSMUST00000218999 2538 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
PtprbB2RU80 Gm15910-201ENSMUST00000127564 2971 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
PtprbB2RU80 Gm20789-201ENSMUST00000221002 4195 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PtprbB2RU80 Olfr132-202ENSMUST00000216804 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PtprbB2RU80 Cntnap5b-201ENSMUST00000086738 4027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PtprbB2RU80 Gsdme-202ENSMUST00000101405 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PtprbB2RU80 AC163731.1-201ENSMUST00000225696 3118 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PtprbB2RU80 Spata6-203ENSMUST00000084354 2239 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PtprbB2RU80 Gm42756-201ENSMUST00000196601 2614 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PtprbB2RU80 Ppp1r1c-202ENSMUST00000090760 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PtprbB2RU80 Zfp59-202ENSMUST00000205701 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PtprbB2RU80 Zfp933-201ENSMUST00000105718 4238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PtprbB2RU80 Gm42994-201ENSMUST00000195964 2549 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PtprbB2RU80 4930518I15Rik-201ENSMUST00000099141 1331 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PtprbB2RU80 Plch1-203ENSMUST00000084105 6245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PtprbB2RU80 Nlrp1b-202ENSMUST00000108514 3541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PtprbB2RU80 Vmn1r86-202ENSMUST00000226604 6378 ntAPPRIS P2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PtprbB2RU80 Mir1188-201ENSMUST00000116756 120 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PtprbB2RU80 Hbb-bh3-201ENSMUST00000118954 266 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PtprbB2RU80 Gm12074-201ENSMUST00000120189 219 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PtprbB2RU80 Gm12336-201ENSMUST00000125962 322 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PtprbB2RU80 Mageb6-ps-201ENSMUST00000126612 1032 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PtprbB2RU80 Gm11376-201ENSMUST00000144541 231 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.9 ms