Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Gm24032-201ENSMUST00000083932 159 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Sspo-201ENSMUST00000043676 15148 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Gm45358-201ENSMUST00000209492 2305 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Vmn1r218-202ENSMUST00000226692 10430 ntAPPRIS P2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Olfr539-202ENSMUST00000218865 11486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 9830144P21Rik-202ENSMUST00000127525 3362 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 C630043F03Rik-201ENSMUST00000122923 2581 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Platr23-201ENSMUST00000180797 2439 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Gm45457-201ENSMUST00000209931 3089 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Olfr305-202ENSMUST00000213255 3749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Olfr305-204ENSMUST00000216700 3734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Hao2-201ENSMUST00000029464 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Lpin2-203ENSMUST00000126681 4167 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Olfr734-203ENSMUST00000217152 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Clec2g-201ENSMUST00000000254 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Olfr1250-202ENSMUST00000111527 4386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Gm4221-202ENSMUST00000181765 2988 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Gm21698-202ENSMUST00000191203 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Gramd2-203ENSMUST00000128944 3705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Gm4927-201ENSMUST00000219548 1318 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Olfr1465-202ENSMUST00000207340 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Klkb1-201ENSMUST00000026907 5249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Kdm5d-201ENSMUST00000055032 7974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Ceacam2-202ENSMUST00000064862 3087 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Gm4847-201ENSMUST00000046662 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Zfp607b-202ENSMUST00000120004 4612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Atp6v0d2-201ENSMUST00000029900 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Top2a-201ENSMUST00000068031 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Unc13c-202ENSMUST00000184666 8796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Slf1-201ENSMUST00000151524 3747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Ccdc7b-203ENSMUST00000108745 1047 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Cd200r3-204ENSMUST00000114612 731 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Gm12988-201ENSMUST00000119054 478 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Gm15149-201ENSMUST00000119370 360 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Gm15181-201ENSMUST00000120142 177 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Gm14979-201ENSMUST00000121561 1035 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Gm12630-201ENSMUST00000121575 784 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Ccdc34os-201ENSMUST00000123633 979 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Gm15178-201ENSMUST00000132100 472 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 AI847159-201ENSMUST00000137728 305 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Gm15471-201ENSMUST00000145893 625 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Gm11339-201ENSMUST00000154766 490 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Gm23903-201ENSMUST00000157566 131 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Gm15898-201ENSMUST00000162213 627 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Gm17521-201ENSMUST00000165345 468 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Gm26381-201ENSMUST00000174895 92 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 n-R5s109-201ENSMUST00000179195 119 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Gm27236-201ENSMUST00000184147 442 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 1700044C05Rik-201ENSMUST00000186060 898 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 1700120K04Rik-201ENSMUST00000191038 546 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Gm37756-201ENSMUST00000191834 942 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Gm43383-201ENSMUST00000195981 469 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Smr2-203ENSMUST00000196477 676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Gimd1-202ENSMUST00000196701 654 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Gm43576-201ENSMUST00000197937 871 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Fxyd4-204ENSMUST00000203433 670 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Olfr1452-ps1-201ENSMUST00000208396 925 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Olfr848-ps1-201ENSMUST00000212241 930 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Olfr897-ps1-201ENSMUST00000213589 935 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 1190001M18Rik-201ENSMUST00000215937 1270 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 AC163661.1-201ENSMUST00000216546 910 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Olfr790-204ENSMUST00000218901 1070 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Gm17849-201ENSMUST00000219788 853 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Gm36756-201ENSMUST00000222011 1214 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 CT030182.3-201ENSMUST00000225986 582 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 AC117202.3-201ENSMUST00000228532 310 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Olfr790-201ENSMUST00000056002 1070 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Plac1-201ENSMUST00000074861 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Vmn1r234-201ENSMUST00000079633 990 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 n-R5s56-201ENSMUST00000082521 105 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Gm24268-201ENSMUST00000082990 110 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Mir3068-201ENSMUST00000083004 136 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Smr2-201ENSMUST00000087043 676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Ssxb5-201ENSMUST00000089370 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Frmpd4-203ENSMUST00000112147 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 AC122887.2-201ENSMUST00000219465 1603 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Mef2c-223ENSMUST00000199105 4361 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Ttc41-202ENSMUST00000075632 4366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Gm12258-202ENSMUST00000139337 4100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Slamf7-202ENSMUST00000192024 1361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Dnah17-203ENSMUST00000106308 14973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Olfr691-202ENSMUST00000213290 2327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Olfr90-206ENSMUST00000217397 2680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Gm38029-201ENSMUST00000192669 2090 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Gm45297-201ENSMUST00000209893 3483 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Ktn1-202ENSMUST00000185343 3846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Ktn1-205ENSMUST00000186627 3840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Ktn1-213ENSMUST00000188330 3819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Add3-203ENSMUST00000111741 4520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Sntg1-210ENSMUST00000191683 4510 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Gm17173-201ENSMUST00000168000 2867 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Olfr193-203ENSMUST00000208455 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 BC064078-202ENSMUST00000131176 2299 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Prox1-202ENSMUST00000175916 7913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Gm37140-201ENSMUST00000192914 1684 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Mcmdc2-205ENSMUST00000171802 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Vmn2r84-201ENSMUST00000094502 3034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 AC131747.2-201ENSMUST00000226121 1895 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Wdr76-201ENSMUST00000028676 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Spocd1B1ASB6 Vangl1-202ENSMUST00000159388 3207 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.2 ms