Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Gm19060-201ENSMUST00000201959 421 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Gm44221-201ENSMUST00000203552 388 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Api5-ps-201ENSMUST00000206607 577 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Gm44683-201ENSMUST00000209088 484 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 BC024386-203ENSMUST00000209817 825 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Gm19073-201ENSMUST00000219978 555 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 CT030170.4-202ENSMUST00000221109 540 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Gm19189-201ENSMUST00000221689 754 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Ssxb1-201ENSMUST00000037297 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Tas2r108-201ENSMUST00000038750 1013 ntAPPRIS P1 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Nlrc4-201ENSMUST00000052124 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Olfr137-201ENSMUST00000057394 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Ctla4-202ENSMUST00000097720 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Dlg2-204ENSMUST00000107196 7490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Adgrg2-202ENSMUST00000112400 4682 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Gm6125-201ENSMUST00000217983 3472 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Iqca-207ENSMUST00000212394 2574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Tor1aip2-203ENSMUST00000097526 2589 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Cxcl15-201ENSMUST00000031322 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 AC155255.1-201ENSMUST00000218751 1428 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Tmem45a2-203ENSMUST00000227043 1447 ntAPPRIS P1 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Il1rapl2-201ENSMUST00000075471 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Olfr972-202ENSMUST00000215303 1641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Trp53bp1-202ENSMUST00000110648 9621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Vmn1r36-201ENSMUST00000226142 1770 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Erap1-201ENSMUST00000169114 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Foxp2-201ENSMUST00000031545 5647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Vmn1r36-204ENSMUST00000226829 1923 ntAPPRIS P2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Gm36936-201ENSMUST00000194508 2749 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Nsd1-207ENSMUST00000224973 9905 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Gm15337-201ENSMUST00000135378 3888 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Olfr453-202ENSMUST00000213997 3082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Prr14l-201ENSMUST00000120129 9959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Gm38062-201ENSMUST00000192541 1856 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Slc35a5-201ENSMUST00000023344 4233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Trbv13-2-201ENSMUST00000103270 340 ntAPPRIS P1 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 4930402F06Rik-201ENSMUST00000113009 1150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Eaf2-203ENSMUST00000114825 668 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Gm14382-201ENSMUST00000117374 437 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Cbx3-ps3-201ENSMUST00000118595 550 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Gm15233-201ENSMUST00000118747 400 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Gm14335-201ENSMUST00000119165 810 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 n-R5s30-201ENSMUST00000122624 122 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 5330429C05Rik-201ENSMUST00000154615 487 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Gm23669-201ENSMUST00000157470 128 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Olfr331-202ENSMUST00000170501 957 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Gm8298-201ENSMUST00000179799 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Gm28066-201ENSMUST00000188657 472 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Gm28357-201ENSMUST00000190256 622 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Gm28640-201ENSMUST00000190918 550 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 4931440P22Rik-205ENSMUST00000194448 474 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Gm43215-201ENSMUST00000199108 252 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Alox5ap-203ENSMUST00000200928 356 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Gm45596-201ENSMUST00000209279 434 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 LOC665443-201ENSMUST00000212284 796 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 AC123832.2-201ENSMUST00000215151 129 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 4930452L12Rik-201ENSMUST00000220158 785 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Gm18940-201ENSMUST00000222518 871 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 9230110F15Rik-201ENSMUST00000054175 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Olfr331-201ENSMUST00000081743 975 ntAPPRIS P1 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Gm23927-201ENSMUST00000082466 215 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Mir194-1-201ENSMUST00000083647 67 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Prl6a1-202ENSMUST00000091680 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Olfr441-201ENSMUST00000095954 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Olfr1016-201ENSMUST00000099915 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Rbpj-202ENSMUST00000087360 5252 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 AC132852.2-201ENSMUST00000216052 2794 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Olfr1392-203ENSMUST00000214170 3507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Olfr1392-205ENSMUST00000214598 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Cnot4-201ENSMUST00000044163 3337 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Klf7-202ENSMUST00000114086 7662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Nedd4-207ENSMUST00000184333 4034 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 4732496C06Rik-201ENSMUST00000206533 2500 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Cyp2j6-201ENSMUST00000030303 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Gm4991-201ENSMUST00000118899 1552 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Ipo11-205ENSMUST00000186033 4147 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Gm43887-201ENSMUST00000204727 3186 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Vmn1r208-202ENSMUST00000227136 3156 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 A330008L17Rik-202ENSMUST00000153366 2614 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Depdc1a-203ENSMUST00000120272 3323 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Tmem207-201ENSMUST00000165687 1538 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Acad11-202ENSMUST00000120854 3108 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Ipo5-201ENSMUST00000032898 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Enox2-209ENSMUST00000167659 3632 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Amz2-201ENSMUST00000020929 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Csrnp3-204ENSMUST00000122912 10672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 CT009480.3-201ENSMUST00000224051 3032 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Mmp13-201ENSMUST00000015394 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 AL670757.1-201ENSMUST00000223668 1959 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Myct1-201ENSMUST00000051809 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 AC110043.1-201ENSMUST00000220278 1627 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Olfr1181-202ENSMUST00000102619 1240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Defb45-201ENSMUST00000109834 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Gm12482-201ENSMUST00000120435 630 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Olfr1069-ps1-201ENSMUST00000120755 965 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Gm5401-201ENSMUST00000122444 365 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Gm12488-201ENSMUST00000122449 499 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Il2ra-202ENSMUST00000150890 1013 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Gm23954-201ENSMUST00000157213 353 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Gm26372-201ENSMUST00000157831 236 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
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