Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 AC141642.1-201ENSMUST00000220598 229 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Gm31711-201ENSMUST00000220687 196 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 4932702P03Rik-203ENSMUST00000225028 670 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 AC122858.1-201ENSMUST00000226212 433 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 AC137871.2-201ENSMUST00000226482 289 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Olfr299-201ENSMUST00000057734 993 ntAPPRIS P1 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Tas2r144-201ENSMUST00000063489 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Eri2-202ENSMUST00000063902 1241 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Olfr1501-201ENSMUST00000073966 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Olfr818-201ENSMUST00000074308 957 ntAPPRIS P1 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Krtap6-1-201ENSMUST00000076906 594 ntAPPRIS P1 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Gm24921-201ENSMUST00000083024 107 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Gm22053-201ENSMUST00000083394 200 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Kat6a-202ENSMUST00000110696 9041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Gm15348-201ENSMUST00000151188 3655 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Zfp719-201ENSMUST00000058104 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Gm43788-201ENSMUST00000201539 2417 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Zim1-201ENSMUST00000002336 7693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Msantd4-202ENSMUST00000212075 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Aox1-201ENSMUST00000001027 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Cd36-204ENSMUST00000170051 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Gm31822-201ENSMUST00000216096 2572 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Kars-ps1-201ENSMUST00000122077 1767 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Cd180-204ENSMUST00000171267 1787 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r-ps21-201ENSMUST00000177115 2947 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Gm14988-201ENSMUST00000117224 1548 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 1700017N19Rik-203ENSMUST00000187119 1524 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Gm18537-202ENSMUST00000206215 1503 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Bnip3l-201ENSMUST00000022634 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Gm43588-201ENSMUST00000201862 2298 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Zbtb44-202ENSMUST00000167346 1308 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r34-207ENSMUST00000228647 2979 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Rap2c-201ENSMUST00000053593 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Olfr734-203ENSMUST00000217152 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r11-203ENSMUST00000228235 2376 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Ighv1-19-201ENSMUST00000103505 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Ighv1-26-201ENSMUST00000103510 351 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Rpl36a-201ENSMUST00000113211 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Rps12-ps10-201ENSMUST00000117447 399 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Gm15105-201ENSMUST00000117777 204 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Mgst1-202ENSMUST00000118091 1030 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Gm14794-201ENSMUST00000118181 192 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Gm12102-201ENSMUST00000118251 604 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Gm5319-201ENSMUST00000118965 873 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Gm11719-201ENSMUST00000119399 351 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Gm12994-201ENSMUST00000119601 447 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Mgst1-203ENSMUST00000120230 1027 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Gm11252-201ENSMUST00000120572 939 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Gm12880-201ENSMUST00000120652 494 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Speer3-201ENSMUST00000124677 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Gm23276-201ENSMUST00000157913 138 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Gm24682-201ENSMUST00000158764 137 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Gm16006-201ENSMUST00000160938 566 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Gm7316-201ENSMUST00000165395 445 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Crip3-206ENSMUST00000165993 735 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Arpp19-204ENSMUST00000167885 540 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Gm22642-201ENSMUST00000175352 252 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Gm20795-201ENSMUST00000178528 699 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Mir8094-201ENSMUST00000183361 117 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Gm8676-201ENSMUST00000184206 637 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Gm28580-201ENSMUST00000186767 88 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Scgb2b8-ps-201ENSMUST00000188661 327 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 C430002N11Rik-202ENSMUST00000189067 1029 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Scgb2b13-ps-201ENSMUST00000190420 328 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Gm37322-201ENSMUST00000193409 337 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Gm38102-202ENSMUST00000196428 174 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Gm18593-201ENSMUST00000200754 1139 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Gm8479-201ENSMUST00000203825 718 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Arl8b-202ENSMUST00000204483 695 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Gm39075-201ENSMUST00000206031 512 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 4933430N04Rik-202ENSMUST00000208031 1146 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Gm18562-201ENSMUST00000209949 915 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Gm31013-201ENSMUST00000213576 715 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Olfr966-ps1-201ENSMUST00000214875 577 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 AC154295.1-201ENSMUST00000217210 621 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Gm29154-253ENSMUST00000217229 1207 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Gm8275-201ENSMUST00000219732 424 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 AC133203.2-201ENSMUST00000226709 464 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Prr32-201ENSMUST00000040002 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Olfr914-201ENSMUST00000057755 951 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Olfr161-201ENSMUST00000061541 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Tas2r129-201ENSMUST00000070991 965 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Prl3d3-201ENSMUST00000073601 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Olfr1116-201ENSMUST00000090717 924 ntAPPRIS P2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Tmem267-201ENSMUST00000099147 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Gm45406-201ENSMUST00000210161 1637 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 AC161595.1-201ENSMUST00000216389 1993 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Gsdmc4-201ENSMUST00000063530 1988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Etl4-202ENSMUST00000066509 7197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Gm38322-201ENSMUST00000194074 2300 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Gm18310-201ENSMUST00000206494 3912 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Gm5949-201ENSMUST00000213468 1421 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Olfr488-202ENSMUST00000211508 4624 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Olfr488-203ENSMUST00000215173 4605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Cyp2j11-201ENSMUST00000015368 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Gm29461-201ENSMUST00000189232 4176 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 A4gnt-201ENSMUST00000042553 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Cdc42bpa-202ENSMUST00000097450 5160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Adar-201ENSMUST00000029563 3753 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Rabgef1Q9JM13 Grik2-207ENSMUST00000218823 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.9 ms