Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Gm44997-202ENSMUST00000205970 425 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
Prpf39Q8K2Z2 Gm19900-201ENSMUST00000207285 576 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Prpf39Q8K2Z2 Axdnd1-210ENSMUST00000212747 1238 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Prpf39Q8K2Z2 Gm18252-202ENSMUST00000214886 409 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Prpf39Q8K2Z2 AC142113.2-201ENSMUST00000217425 748 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Prpf39Q8K2Z2 AC126554.4-201ENSMUST00000221055 409 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Prpf39Q8K2Z2 AC211878.6-201ENSMUST00000221896 358 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Prpf39Q8K2Z2 CT030195.1-201ENSMUST00000223887 378 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Prpf39Q8K2Z2 AC125405.1-201ENSMUST00000226406 589 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Prpf39Q8K2Z2 4931400O07Rik-201ENSMUST00000033537 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Prpf39Q8K2Z2 Gm5142-201ENSMUST00000066558 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Prpf39Q8K2Z2 Olfr441-202ENSMUST00000213649 2402 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
Prpf39Q8K2Z2 Serpinb6e-201ENSMUST00000110275 1494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Prpf39Q8K2Z2 Olfr432-202ENSMUST00000213211 4435 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Prpf39Q8K2Z2 Cbx5-201ENSMUST00000108813 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Prpf39Q8K2Z2 B230217J21Rik-201ENSMUST00000218349 3896 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Prpf39Q8K2Z2 Gria4-204ENSMUST00000212533 5207 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Prpf39Q8K2Z2 Tmc5-201ENSMUST00000057320 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Prpf39Q8K2Z2 Slc22a29-201ENSMUST00000113298 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Prpf39Q8K2Z2 AC153962.3-202ENSMUST00000217778 1412 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Prpf39Q8K2Z2 Zfp945-201ENSMUST00000088696 4285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Prpf39Q8K2Z2 Gm37082-201ENSMUST00000192629 1927 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Prpf39Q8K2Z2 Gm8979-201ENSMUST00000183386 7296 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Prpf39Q8K2Z2 9330159M07Rik-201ENSMUST00000180712 2702 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Prpf39Q8K2Z2 Nlgn1-203ENSMUST00000191835 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Prpf39Q8K2Z2 4930563J15Rik-201ENSMUST00000218306 3468 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Prpf39Q8K2Z2 Speer4a-201ENSMUST00000079447 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Prpf39Q8K2Z2 Gm37482-201ENSMUST00000194899 2791 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Prpf39Q8K2Z2 Toporsl-202ENSMUST00000107671 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Prpf39Q8K2Z2 Mme-205ENSMUST00000194134 8039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Prpf39Q8K2Z2 Vmn1r4-204ENSMUST00000227073 1695 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Prpf39Q8K2Z2 Ralgapa2-202ENSMUST00000109986 11030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Prpf39Q8K2Z2 Gm38372-201ENSMUST00000194854 4028 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Prpf39Q8K2Z2 Cldn34b4-201ENSMUST00000101419 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Prpf39Q8K2Z2 Gm14930-201ENSMUST00000118864 652 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Prpf39Q8K2Z2 Gm14712-201ENSMUST00000120195 772 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Prpf39Q8K2Z2 Gm12322-201ENSMUST00000121605 389 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Prpf39Q8K2Z2 Gimap4-205ENSMUST00000121957 775 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Prpf39Q8K2Z2 Gm12301-201ENSMUST00000152963 523 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Prpf39Q8K2Z2 Gm24687-201ENSMUST00000157758 241 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Prpf39Q8K2Z2 Gm9006-201ENSMUST00000165520 841 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Prpf39Q8K2Z2 Gm17711-201ENSMUST00000172028 237 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Prpf39Q8K2Z2 Mir7082-201ENSMUST00000183526 92 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Prpf39Q8K2Z2 Gm27208-201ENSMUST00000184323 604 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Prpf39Q8K2Z2 Gm28782-201ENSMUST00000185980 414 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Prpf39Q8K2Z2 Gm28923-201ENSMUST00000187755 322 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Prpf39Q8K2Z2 Gm18799-201ENSMUST00000189104 913 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Prpf39Q8K2Z2 Gm29137-201ENSMUST00000190301 520 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Prpf39Q8K2Z2 Gm37591-201ENSMUST00000193283 650 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Prpf39Q8K2Z2 Gm31306-201ENSMUST00000197517 508 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Prpf39Q8K2Z2 Gm45334-201ENSMUST00000211118 1227 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Prpf39Q8K2Z2 Gm31432-201ENSMUST00000214727 538 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Prpf39Q8K2Z2 AC124445.1-201ENSMUST00000218613 452 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Prpf39Q8K2Z2 4930549C15Rik-201ENSMUST00000221235 1260 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Prpf39Q8K2Z2 AC164618.3-201ENSMUST00000224863 681 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Prpf39Q8K2Z2 Olfr148-201ENSMUST00000050807 1017 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Prpf39Q8K2Z2 Skint10-202ENSMUST00000068851 493 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Prpf39Q8K2Z2 Gm8526-201ENSMUST00000079153 475 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Prpf39Q8K2Z2 Gm24919-201ENSMUST00000083020 106 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Prpf39Q8K2Z2 AC155634.1-201ENSMUST00000221687 2706 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Prpf39Q8K2Z2 Kcnma1-202ENSMUST00000074983 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Prpf39Q8K2Z2 1700019D03Rik-203ENSMUST00000114493 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Prpf39Q8K2Z2 Cyp2j6-201ENSMUST00000030303 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Prpf39Q8K2Z2 AC162908.1-201ENSMUST00000219164 4563 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Prpf39Q8K2Z2 Zfp280d-201ENSMUST00000098576 4387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Prpf39Q8K2Z2 4930554C24Rik-203ENSMUST00000216802 1346 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Prpf39Q8K2Z2 AC154755.2-201ENSMUST00000224384 2857 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Prpf39Q8K2Z2 Gm38118-201ENSMUST00000192052 2222 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Prpf39Q8K2Z2 Ppip5k2-205ENSMUST00000171129 3425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Prpf39Q8K2Z2 Kat6b-ps1-201ENSMUST00000187624 3433 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Prpf39Q8K2Z2 Iqcb1-202ENSMUST00000114819 2797 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Prpf39Q8K2Z2 Gm44901-201ENSMUST00000208157 3977 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Prpf39Q8K2Z2 AC153144.1-201ENSMUST00000221759 3139 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Prpf39Q8K2Z2 Olfr55-204ENSMUST00000216633 4758 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Prpf39Q8K2Z2 Gm2223-201ENSMUST00000112099 1350 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Prpf39Q8K2Z2 Naip5-201ENSMUST00000049789 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Prpf39Q8K2Z2 G930045G22Rik-201ENSMUST00000101402 480 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Prpf39Q8K2Z2 Zfp972-202ENSMUST00000108934 561 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Prpf39Q8K2Z2 Magea6-202ENSMUST00000112562 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Prpf39Q8K2Z2 Gm11911-201ENSMUST00000117938 1023 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Prpf39Q8K2Z2 Gm15238-201ENSMUST00000119938 1296 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Prpf39Q8K2Z2 Gm14808-201ENSMUST00000129259 361 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Prpf39Q8K2Z2 Mpc1-203ENSMUST00000130559 603 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Prpf39Q8K2Z2 Gm13261-201ENSMUST00000137351 1020 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Prpf39Q8K2Z2 Gm14742-201ENSMUST00000148284 381 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Prpf39Q8K2Z2 Fpr2-202ENSMUST00000149944 883 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Prpf39Q8K2Z2 Gm11528-201ENSMUST00000156822 914 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Prpf39Q8K2Z2 Gm25227-201ENSMUST00000158204 112 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Prpf39Q8K2Z2 Vmn2r-ps32-201ENSMUST00000175794 757 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Prpf39Q8K2Z2 Gm21959-201ENSMUST00000178439 452 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Prpf39Q8K2Z2 Gm2539-203ENSMUST00000181352 746 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Prpf39Q8K2Z2 1700124L16Rik-202ENSMUST00000189308 546 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Prpf39Q8K2Z2 Gm29592-201ENSMUST00000189434 370 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Prpf39Q8K2Z2 Rrh-205ENSMUST00000196902 1250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Prpf39Q8K2Z2 Gm43055-201ENSMUST00000198859 879 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Prpf39Q8K2Z2 B230112I24Rik-201ENSMUST00000203953 1229 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Prpf39Q8K2Z2 Gm45008-201ENSMUST00000206420 493 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Prpf39Q8K2Z2 Gm45596-201ENSMUST00000209279 434 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Prpf39Q8K2Z2 Gm31166-201ENSMUST00000209326 288 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Prpf39Q8K2Z2 Olfr562-ps1-201ENSMUST00000210779 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
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