Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Gm15034-201ENSMUST00000120043 349 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm13531-201ENSMUST00000121893 543 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm12499-201ENSMUST00000121961 546 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1003-ps1-201ENSMUST00000122238 717 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Halr1-201ENSMUST00000125374 391 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm13411-201ENSMUST00000149429 414 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm26182-201ENSMUST00000157688 116 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm25861-201ENSMUST00000158251 109 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Skint1-204ENSMUST00000162158 1260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r57-201ENSMUST00000170780 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Srsx-201ENSMUST00000171714 1083 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm20454-201ENSMUST00000172713 221 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Mir3058-201ENSMUST00000175126 91 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Mir5617-201ENSMUST00000176786 57 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm27596-201ENSMUST00000185061 83 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1025-ps1-201ENSMUST00000188749 921 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm8419-201ENSMUST00000189886 412 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm40190-201ENSMUST00000196570 471 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm43269-201ENSMUST00000202075 518 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm7554-201ENSMUST00000202282 574 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm44219-201ENSMUST00000203005 273 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm19764-201ENSMUST00000203630 649 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Olrf445-ps1-201ENSMUST00000204960 314 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Fxyd1-212ENSMUST00000206305 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm19095-201ENSMUST00000220533 730 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm18591-201ENSMUST00000220568 763 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 4930448C13Rik-204ENSMUST00000221610 1044 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Selenok-ps8-201ENSMUST00000221926 280 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 4933412O06Rik-201ENSMUST00000222681 1123 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 AC139197.1-201ENSMUST00000228332 813 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r74-201ENSMUST00000050416 915 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1122-201ENSMUST00000056435 1080 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Timp1-201ENSMUST00000009530 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Uhmk1-203ENSMUST00000150821 7676 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm29112-201ENSMUST00000188962 3487 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm26893-202ENSMUST00000180965 2079 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm26552-202ENSMUST00000180980 2079 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm14896-201ENSMUST00000121311 1351 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Btbd35f15-201ENSMUST00000186329 1917 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r6-205ENSMUST00000227631 7805 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Fam169a-202ENSMUST00000169863 6013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 AC115970.1-201ENSMUST00000218910 1758 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r81-204ENSMUST00000228482 13495 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Abcb11-201ENSMUST00000102709 5025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Zfp37-207ENSMUST00000222748 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Il1rl2-204ENSMUST00000194296 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm5373-202ENSMUST00000212931 2964 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Ank2-207ENSMUST00000182064 12413 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Cbx5-202ENSMUST00000118152 8803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Uty-204ENSMUST00000139365 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm6288-201ENSMUST00000100778 1590 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm44220-201ENSMUST00000203784 2487 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Olfr344-202ENSMUST00000215879 7675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Ighv1-16-201ENSMUST00000103501 294 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Ighv1-24-201ENSMUST00000103509 294 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Casp8ap2-202ENSMUST00000108178 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Cetn2-202ENSMUST00000114550 1124 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm20815-201ENSMUST00000115496 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm6987-201ENSMUST00000119319 428 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm15967-201ENSMUST00000120027 1116 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm14110-201ENSMUST00000127688 758 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm16224-201ENSMUST00000127711 412 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 A330102I10Rik-201ENSMUST00000130109 501 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm24767-201ENSMUST00000158509 95 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm24130-201ENSMUST00000158536 151 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Vmn2r-ps32-201ENSMUST00000175794 757 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm9285-201ENSMUST00000177691 697 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm20767-201ENSMUST00000179071 510 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Scgb2b19-201ENSMUST00000179688 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Trav21-dv12-201ENSMUST00000180938 360 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm28080-201ENSMUST00000188552 722 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm21812-202ENSMUST00000188908 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm21524-201ENSMUST00000190499 696 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm21715-201ENSMUST00000191056 694 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm44494-201ENSMUST00000196760 129 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm31306-201ENSMUST00000197517 508 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm31579-201ENSMUST00000203306 966 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm44940-201ENSMUST00000206225 1247 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm45607-201ENSMUST00000211143 678 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Zfp429-203ENSMUST00000224684 524 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 AC154646.1-201ENSMUST00000225011 1092 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Cetn2-201ENSMUST00000033713 1026 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 1700102P08Rik-201ENSMUST00000035234 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 1810024B03Rik-201ENSMUST00000056146 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Olfr49-201ENSMUST00000059996 1030 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Ctsj-201ENSMUST00000071526 1271 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Olfr816-201ENSMUST00000071605 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Dph3b-ps-201ENSMUST00000076359 246 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Trmt2b-201ENSMUST00000087540 822 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Sprr2a3-201ENSMUST00000090872 682 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Defb46-201ENSMUST00000095436 174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 C130073E24Rik-202ENSMUST00000211313 14112 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Vmn2r42-204ENSMUST00000142934 3694 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Olfr733-204ENSMUST00000216195 3669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm8674-201ENSMUST00000179367 3047 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm37779-201ENSMUST00000194221 3380 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Anks1b-201ENSMUST00000099364 1383 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Ralyl-203ENSMUST00000171075 1459 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
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