Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Gm14733-201ENSMUST00000117680 133 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Gm28047Q3US59 Gm12573-201ENSMUST00000118158 286 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Gm28047Q3US59 Gm14899-201ENSMUST00000118673 548 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Gm28047Q3US59 Gm11504-201ENSMUST00000120211 173 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Gm28047Q3US59 Gm12317-201ENSMUST00000122307 319 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Gm28047Q3US59 Gm25052-201ENSMUST00000122661 158 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Gm28047Q3US59 Gm17216-201ENSMUST00000130872 728 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Gm28047Q3US59 Gm14664-201ENSMUST00000142919 437 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Gm28047Q3US59 Gm25962-201ENSMUST00000157173 168 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Gm28047Q3US59 Gm24735-201ENSMUST00000158859 118 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Gm28047Q3US59 Gm16043-201ENSMUST00000160030 616 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Gm28047Q3US59 1110038B12Rik-201ENSMUST00000172501 579 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Gm28047Q3US59 Gm20690-201ENSMUST00000177341 315 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Gm28047Q3US59 Gm21839-201ENSMUST00000179536 378 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Gm28047Q3US59 4930445N18Rik-201ENSMUST00000180631 886 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Gm28047Q3US59 1810041H14Rik-203ENSMUST00000187773 416 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Gm28047Q3US59 2310008N11Rik-201ENSMUST00000189978 568 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
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Gm28047Q3US59 Gm37756-201ENSMUST00000191834 942 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Gm28047Q3US59 Gm37620-201ENSMUST00000192910 501 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Gm28047Q3US59 Gm34302-201ENSMUST00000192926 243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Gm28047Q3US59 Gm9236-201ENSMUST00000196892 587 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Gm28047Q3US59 Gm43967-201ENSMUST00000203787 301 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Gm28047Q3US59 Gm44234-201ENSMUST00000204246 900 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Gm28047Q3US59 2310008N11Rik-203ENSMUST00000210732 601 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Gm28047Q3US59 Olfr942-ps1-201ENSMUST00000215640 662 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Gm28047Q3US59 Gm18618-201ENSMUST00000222211 473 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Gm28047Q3US59 Gm9293-201ENSMUST00000223096 306 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Gm28047Q3US59 Gm34557-201ENSMUST00000223115 375 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Gm28047Q3US59 Olfr11-201ENSMUST00000043081 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
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Gm28047Q3US59 Olfr803-201ENSMUST00000056736 927 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Gm28047Q3US59 1700019A02Rik-201ENSMUST00000072235 646 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Gm28047Q3US59 Il21-201ENSMUST00000029273 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Gm28047Q3US59 Srsy-201ENSMUST00000179900 1618 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Gm28047Q3US59 Gm46430-206ENSMUST00000222064 1647 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Gm28047Q3US59 Vmn1r90-209ENSMUST00000227855 7362 ntAPPRIS P2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
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Gm28047Q3US59 Gla-201ENSMUST00000033621 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
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Gm28047Q3US59 Cyp2c50-201ENSMUST00000068094 1643 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
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Gm28047Q3US59 Gm6987-201ENSMUST00000119319 428 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
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Gm28047Q3US59 Spata19-201ENSMUST00000034473 697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
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Gm28047Q3US59 Gm10108-201ENSMUST00000078246 319 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
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Gm28047Q3US59 Klra3-201ENSMUST00000088017 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
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Gm28047Q3US59 Klkb1-201ENSMUST00000026907 5249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Gm28047Q3US59 Angptl1-201ENSMUST00000027885 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Gm28047Q3US59 Uevld-201ENSMUST00000094398 4616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
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Gm28047Q3US59 Gdap1-201ENSMUST00000026879 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
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Gm28047Q3US59 Utrn-201ENSMUST00000076817 12382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Gm28047Q3US59 Gm26523-201ENSMUST00000180713 1658 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Gm28047Q3US59 9330178D15Rik-201ENSMUST00000196033 3451 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Gm28047Q3US59 Gm12763-201ENSMUST00000151344 1939 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Gm28047Q3US59 Pde1c-206ENSMUST00000166890 4728 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
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Gm28047Q3US59 Osbpl9-216ENSMUST00000161363 2356 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Gm28047Q3US59 Gm44068-201ENSMUST00000204049 2128 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Gm28047Q3US59 Eif2s3x-201ENSMUST00000050328 3647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Gm28047Q3US59 Ndst3-201ENSMUST00000029602 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Gm28047Q3US59 Zgrf1-201ENSMUST00000043108 7046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Gm28047Q3US59 Olfr802-203ENSMUST00000217576 5297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.3 ms