Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

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Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 AL603745.1-201ENSMUST00000215473 532 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 AC160413.1-201ENSMUST00000217909 932 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 Gm5176-201ENSMUST00000218244 1227 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 3110043J17Rik-201ENSMUST00000219153 760 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 Gm18591-201ENSMUST00000220568 763 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 Gm19340-201ENSMUST00000221995 345 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 AC134860.4-201ENSMUST00000223592 978 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 AC158750.1-201ENSMUST00000226163 634 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 AC107757.1-201ENSMUST00000226780 357 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 Ear14-202ENSMUST00000228064 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 Cst12-201ENSMUST00000028932 644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 Olfr808-201ENSMUST00000060636 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 Olfr1205-201ENSMUST00000076438 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 Mir138-1-201ENSMUST00000083480 99 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 Olfr338-202ENSMUST00000091006 921 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 Gm38403-201ENSMUST00000219032 2357 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 Gm42727-201ENSMUST00000202446 2823 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 Gm16503-201ENSMUST00000104964 3283 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 Adam34-202ENSMUST00000212185 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 Zfp791-202ENSMUST00000211109 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 Naip5-201ENSMUST00000049789 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 Amd2-201ENSMUST00000080898 3218 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 Gm14896-201ENSMUST00000121311 1351 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 AC164297.2-201ENSMUST00000224388 1508 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 Ccp110-201ENSMUST00000038650 4716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 Gm44697-201ENSMUST00000207756 1679 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 Vmn1r39-201ENSMUST00000226217 2258 ntAPPRIS P2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 Vmn1r39-204ENSMUST00000227555 2297 ntAPPRIS P2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 Vmn1r39-205ENSMUST00000228008 2283 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 Pramel4-203ENSMUST00000094520 2297 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 Taf13-204ENSMUST00000143054 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 Vmn2r25-201ENSMUST00000162046 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 Gm5427-201ENSMUST00000217680 2591 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 Zfp35-201ENSMUST00000074941 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 Gm38377-201ENSMUST00000193253 3772 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 Adgrg2-202ENSMUST00000112400 4682 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 Adipor2-201ENSMUST00000032272 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 Cyp2c65-201ENSMUST00000087236 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 Gm9938-201ENSMUST00000067077 1756 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 Rpgr-201ENSMUST00000044598 3805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 Olfr527-202ENSMUST00000214143 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 Ampd1-202ENSMUST00000155034 2913 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 Scaper-204ENSMUST00000216595 2911 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 Gm37943-201ENSMUST00000194053 3944 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 Psg20-202ENSMUST00000108482 1871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 Gm43180-201ENSMUST00000197541 2886 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 Fam227b-204ENSMUST00000178118 1599 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 4931412I15Rik-201ENSMUST00000207844 1448 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 Tmem45a2-203ENSMUST00000227043 1447 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 Acad11-202ENSMUST00000120854 3108 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 Gm42892-201ENSMUST00000196227 3973 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 Igkv15-103-201ENSMUST00000103324 375 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 Myl2-202ENSMUST00000111750 729 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 Spink8-201ENSMUST00000118732 637 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 Gm2986-201ENSMUST00000121603 382 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 Tmem216-203ENSMUST00000123788 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 Gm15122-201ENSMUST00000135434 462 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 Sumo2-207ENSMUST00000153892 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 Gm25413-201ENSMUST00000158544 312 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 Gm16226-201ENSMUST00000159950 760 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 Gm7281-201ENSMUST00000160010 543 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 Gm16231-201ENSMUST00000160432 319 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 Gm8837-201ENSMUST00000161037 1107 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 Snrpe-204ENSMUST00000166915 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 Gm25675-201ENSMUST00000174979 118 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 Spata17-208ENSMUST00000184543 667 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
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Usp39Q3TIX9 Gm42513-201ENSMUST00000197831 2119 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 Igkv13-62-1-201ENSMUST00000198690 317 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 Gm44006-201ENSMUST00000204273 396 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
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Usp39Q3TIX9 Gm44930-201ENSMUST00000207545 489 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 Gm45044-201ENSMUST00000208078 396 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 BC024386-205ENSMUST00000210080 731 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 Olfr490-201ENSMUST00000210114 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 Gm45382-201ENSMUST00000210607 151 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 Gm2788-207ENSMUST00000211055 1078 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 4930542C16Rik-203ENSMUST00000212108 1207 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 Gm18160-201ENSMUST00000214279 827 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 Gm18863-201ENSMUST00000217004 1299 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 AC157017.2-201ENSMUST00000218354 777 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 Nkain2-204ENSMUST00000218645 703 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 AC122371.2-201ENSMUST00000220583 366 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 AC120383.1-201ENSMUST00000221123 573 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 Gm30239-202ENSMUST00000223193 631 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 Olfr902-201ENSMUST00000050733 1056 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 Olfr933-201ENSMUST00000075680 1003 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 Olfr282-201ENSMUST00000075851 928 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 Olfr1337-201ENSMUST00000077247 951 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 Gm15732-201ENSMUST00000079794 480 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 Gm5152-202ENSMUST00000088625 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 Olfr652-201ENSMUST00000098175 1061 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 Olfr74-201ENSMUST00000099840 957 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 Pirt-201ENSMUST00000123434 4200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 Hspa13-202ENSMUST00000114244 2674 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 Rasef-201ENSMUST00000058292 5183 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
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