Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Pramel7-201ENSMUST00000026957 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Myct1-201ENSMUST00000051809 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 AC154755.2-201ENSMUST00000224384 2857 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 AC174459.1-201ENSMUST00000224476 1943 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Stag3-209ENSMUST00000162245 4123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 4933406F09Rik-204ENSMUST00000181409 2078 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Slc35a5-201ENSMUST00000023344 4233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Samd12-201ENSMUST00000078673 9019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm43627-201ENSMUST00000197119 2299 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 1700019D03Rik-203ENSMUST00000114493 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Utp14b-201ENSMUST00000053760 7393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm14369-201ENSMUST00000121355 285 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm16126-201ENSMUST00000126025 589 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm12249-201ENSMUST00000132323 719 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gtsf1-205ENSMUST00000141364 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 5330429C05Rik-201ENSMUST00000154615 487 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm23669-201ENSMUST00000157470 128 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 1700003H04Rik-206ENSMUST00000180162 1086 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm1972-201ENSMUST00000181606 964 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm27193-201ENSMUST00000184217 586 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm3605-201ENSMUST00000185858 440 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm18444-201ENSMUST00000191239 629 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 9430037O13Rik-201ENSMUST00000192556 1008 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm18529-201ENSMUST00000193025 1257 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Ighv5-19-201ENSMUST00000193466 297 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 A330069K06Rik-201ENSMUST00000194077 917 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 4930562F17Rik-201ENSMUST00000195279 960 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Epgn-202ENSMUST00000202724 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm44412-201ENSMUST00000203018 294 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Olfr8-202ENSMUST00000203851 1009 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm36328-201ENSMUST00000204237 432 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm39090-202ENSMUST00000205992 508 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 AC132474.2-201ENSMUST00000217414 573 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 AC147615.1-201ENSMUST00000218914 441 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 AC154755.1-201ENSMUST00000225244 537 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 1700003H04Rik-201ENSMUST00000047110 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Samt3-201ENSMUST00000047945 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Vmn1r70-201ENSMUST00000055847 897 ntAPPRIS P2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm8412-201ENSMUST00000077493 440 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Pth-201ENSMUST00000079793 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 n-R5s204-201ENSMUST00000082972 119 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Mir365-2-201ENSMUST00000083555 112 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 n-R5s69-201ENSMUST00000083872 119 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 4930432M17Rik-201ENSMUST00000098646 525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm42781-201ENSMUST00000201317 2719 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm42715-201ENSMUST00000189629 12746 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm28432-201ENSMUST00000185237 1499 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm28081-201ENSMUST00000185321 1497 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm29473-201ENSMUST00000185588 1497 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm29662-201ENSMUST00000185620 1499 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm28082-201ENSMUST00000185683 1499 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm29061-201ENSMUST00000185900 1499 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm28679-201ENSMUST00000186013 1499 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm29565-202ENSMUST00000186260 1499 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm28338-202ENSMUST00000186269 1499 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm28668-202ENSMUST00000186549 1499 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm28673-201ENSMUST00000186562 1498 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm29321-201ENSMUST00000186727 1499 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm28135-201ENSMUST00000186847 1499 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm29158-201ENSMUST00000186883 1494 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm28291-202ENSMUST00000186921 1499 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm29393-201ENSMUST00000187002 1499 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm29219-201ENSMUST00000187224 1499 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm29547-201ENSMUST00000187258 1499 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm28260-201ENSMUST00000187337 1499 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm28225-201ENSMUST00000187730 1499 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm29569-202ENSMUST00000187955 1499 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm29625-201ENSMUST00000188079 1499 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm28735-202ENSMUST00000188159 1499 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm29297-202ENSMUST00000188186 1499 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm29457-201ENSMUST00000188224 1499 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm29190-201ENSMUST00000188255 1499 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm28236-203ENSMUST00000188311 1499 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm28197-203ENSMUST00000188434 1499 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm29070-202ENSMUST00000188541 1499 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm28545-201ENSMUST00000188667 1499 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm29265-201ENSMUST00000188697 1499 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm28947-203ENSMUST00000188701 1499 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm29616-201ENSMUST00000188777 1499 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm29162-202ENSMUST00000188893 1499 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm28606-201ENSMUST00000188938 1499 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm29338-201ENSMUST00000189318 1499 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm29425-202ENSMUST00000189421 1499 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm29271-203ENSMUST00000189943 1499 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm29381-201ENSMUST00000190168 1497 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm28454-203ENSMUST00000190183 1495 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm28842-202ENSMUST00000190289 1499 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm28259-201ENSMUST00000190319 1497 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm28318-203ENSMUST00000190347 1499 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm28633-202ENSMUST00000190867 1485 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm29182-202ENSMUST00000191008 1499 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm28632-202ENSMUST00000191193 1499 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm28245-203ENSMUST00000191551 1495 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm38370-201ENSMUST00000192545 1499 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm37462-201ENSMUST00000193386 1498 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm37344-203ENSMUST00000195490 1498 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm32114-203ENSMUST00000195759 1499 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm4954-201ENSMUST00000135069 1601 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm7155-201ENSMUST00000121143 1671 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Mapk10-212ENSMUST00000170792 7203 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
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