Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Elavl4-201ENSMUST00000102722 4107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
TrioQ0KL02 Elavl4-203ENSMUST00000106597 4149 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
TrioQ0KL02 Gm43728-201ENSMUST00000198817 2622 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TrioQ0KL02 Olfr684-203ENSMUST00000215744 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TrioQ0KL02 Zfp661-202ENSMUST00000110366 4912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
TrioQ0KL02 Gm23594-201ENSMUST00000104307 134 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TrioQ0KL02 Gm2367-201ENSMUST00000192374 472 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TrioQ0KL02 Kcnmb2-206ENSMUST00000194796 338 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
TrioQ0KL02 Gm43569-201ENSMUST00000196200 559 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TrioQ0KL02 Gm40190-201ENSMUST00000196570 471 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TrioQ0KL02 Gm6260-202ENSMUST00000197170 921 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
TrioQ0KL02 Gm43418-201ENSMUST00000201334 428 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TrioQ0KL02 Gm18541-201ENSMUST00000215935 538 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TrioQ0KL02 AC109180.1-201ENSMUST00000218676 398 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TrioQ0KL02 Rbm44-201ENSMUST00000094698 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
TrioQ0KL02 Vmn2r85-201ENSMUST00000171811 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TrioQ0KL02 Mast4-212ENSMUST00000171791 7647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TrioQ0KL02 Trp63-208ENSMUST00000115310 5366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
TrioQ0KL02 Arid5b-204ENSMUST00000219238 7581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
TrioQ0KL02 Zp3r-203ENSMUST00000142416 1835 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TrioQ0KL02 Gm28394-201ENSMUST00000186805 1495 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TrioQ0KL02 Gm28570-201ENSMUST00000188300 1495 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TrioQ0KL02 Rapgef6-201ENSMUST00000094536 3372 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TrioQ0KL02 Kdm5a-201ENSMUST00000005108 10944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TrioQ0KL02 Bicral-201ENSMUST00000040624 6579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
TrioQ0KL02 Gm13103-202ENSMUST00000105768 994 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TrioQ0KL02 Gm7206-201ENSMUST00000117730 508 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TrioQ0KL02 Gm11990-201ENSMUST00000121505 897 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TrioQ0KL02 Zcchc10-201ENSMUST00000018383 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
TrioQ0KL02 4930567H12Rik-204ENSMUST00000213085 801 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
TrioQ0KL02 Smr3a-201ENSMUST00000031211 635 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
TrioQ0KL02 Sprr3-201ENSMUST00000058142 1222 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TrioQ0KL02 Baz2a-203ENSMUST00000217851 8385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TrioQ0KL02 Gria1-201ENSMUST00000036315 5546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
TrioQ0KL02 Gm26766-201ENSMUST00000181411 3677 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
TrioQ0KL02 Ccr9-204ENSMUST00000168910 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
TrioQ0KL02 Muc19-202ENSMUST00000160242 9104 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
TrioQ0KL02 Cyp2j12-201ENSMUST00000097972 1675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TrioQ0KL02 Gm12285-201ENSMUST00000117347 233 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TrioQ0KL02 Gm15828-201ENSMUST00000119911 522 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TrioQ0KL02 Gm23883-201ENSMUST00000122686 290 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TrioQ0KL02 Ssxb8-202ENSMUST00000185125 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TrioQ0KL02 Gm28685-201ENSMUST00000187545 1101 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TrioQ0KL02 Gm17847-201ENSMUST00000188261 1127 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TrioQ0KL02 1700047L14Rik-201ENSMUST00000189659 511 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
TrioQ0KL02 Gm37209-201ENSMUST00000194109 1276 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TrioQ0KL02 Gm8861-201ENSMUST00000196346 832 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TrioQ0KL02 Gm42542-201ENSMUST00000197978 268 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TrioQ0KL02 Gm8891-201ENSMUST00000198546 832 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TrioQ0KL02 Aebp2-201ENSMUST00000032359 5932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
TrioQ0KL02 Ugt2b37-201ENSMUST00000075858 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
TrioQ0KL02 Celsr3-201ENSMUST00000024238 11547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
TrioQ0KL02 Asap1-210ENSMUST00000176384 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
TrioQ0KL02 Cped1-202ENSMUST00000115383 5690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
TrioQ0KL02 5830444B04Rik-204ENSMUST00000166921 2870 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
TrioQ0KL02 Slc28a3-201ENSMUST00000022036 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
TrioQ0KL02 Eif2s2-205ENSMUST00000166171 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
TrioQ0KL02 Bmpr1b-201ENSMUST00000029948 5349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
TrioQ0KL02 Olfr25-202ENSMUST00000212354 1362 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TrioQ0KL02 Zfp763-201ENSMUST00000087654 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
TrioQ0KL02 Prom1-205ENSMUST00000165909 4089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
TrioQ0KL02 Abca8a-202ENSMUST00000100287 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TrioQ0KL02 4930509E16Rik-201ENSMUST00000181405 1191 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
TrioQ0KL02 Gm28363-201ENSMUST00000186341 673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TrioQ0KL02 Hmgn3-205ENSMUST00000187193 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TrioQ0KL02 Gm23925-202ENSMUST00000188429 132 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TrioQ0KL02 Ankrd42-207ENSMUST00000207131 1220 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
TrioQ0KL02 4930532I03Rik-201ENSMUST00000218463 1724 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
TrioQ0KL02 2310030G06Rik-201ENSMUST00000034564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
TrioQ0KL02 Gm5426-201ENSMUST00000074615 312 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TrioQ0KL02 Gm43437-201ENSMUST00000198535 3955 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TrioQ0KL02 Fastkd5-202ENSMUST00000179273 2424 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TrioQ0KL02 Ptgs2-201ENSMUST00000035065 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
TrioQ0KL02 Arhgap12-202ENSMUST00000077128 4431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
TrioQ0KL02 Olfr800-201ENSMUST00000104903 940 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TrioQ0KL02 Gm15812-201ENSMUST00000162331 748 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TrioQ0KL02 Gm5511-201ENSMUST00000189380 802 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TrioQ0KL02 Gm5734-201ENSMUST00000189787 913 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TrioQ0KL02 AC114573.1-201ENSMUST00000224120 1210 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TrioQ0KL02 Olfr1024-201ENSMUST00000099912 984 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TrioQ0KL02 Cpb2-201ENSMUST00000022576 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
TrioQ0KL02 Tbp-211ENSMUST00000162505 12794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
TrioQ0KL02 Gprin2-203ENSMUST00000226613 10354 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TrioQ0KL02 Vmn2r-ps120-201ENSMUST00000176341 2409 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TrioQ0KL02 Olfr55-203ENSMUST00000214891 4428 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TrioQ0KL02 Muc6-201ENSMUST00000062451 8650 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TrioQ0KL02 Trpm7-201ENSMUST00000028843 6985 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
TrioQ0KL02 Cyld-203ENSMUST00000109626 7945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TrioQ0KL02 Pcdh15-225ENSMUST00000149977 5843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TrioQ0KL02 Atp2b4-203ENSMUST00000125659 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
TrioQ0KL02 Gm23501-201ENSMUST00000157744 256 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TrioQ0KL02 Gm10784-201ENSMUST00000178715 238 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TrioQ0KL02 Gm28784-201ENSMUST00000187817 1011 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
TrioQ0KL02 Gm38046-201ENSMUST00000192733 550 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TrioQ0KL02 Gm6702-201ENSMUST00000208496 471 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TrioQ0KL02 Olfr123-201ENSMUST00000054748 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TrioQ0KL02 Ank3-215ENSMUST00000182269 4411 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TrioQ0KL02 Pln-206ENSMUST00000220197 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TrioQ0KL02 Sptbn1-201ENSMUST00000006629 8461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TrioQ0KL02 AC129208.1-201ENSMUST00000227474 2906 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.6 ms