Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Gm5692-201ENSMUST00000187254 1057 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SbdsP70122 Gm37756-201ENSMUST00000191834 942 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SbdsP70122 Gm3143-201ENSMUST00000196308 580 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SbdsP70122 Gm36548-202ENSMUST00000200222 494 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SbdsP70122 Gm44312-201ENSMUST00000203536 469 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SbdsP70122 Samt3-201ENSMUST00000047945 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SbdsP70122 Aph1c-201ENSMUST00000057261 715 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SbdsP70122 Olfr356-201ENSMUST00000095021 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SbdsP70122 Olfr1262-202ENSMUST00000111508 6068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SbdsP70122 Olfr1217-204ENSMUST00000216592 3992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SbdsP70122 Eif2s2-205ENSMUST00000166171 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SbdsP70122 Nexn-201ENSMUST00000046045 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SbdsP70122 CT009733.2-202ENSMUST00000224171 4748 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SbdsP70122 AC166344.3-203ENSMUST00000228117 1466 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SbdsP70122 Olfr1357-202ENSMUST00000203305 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SbdsP70122 Rtl9-201ENSMUST00000165829 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SbdsP70122 Gm43359-201ENSMUST00000197944 2200 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SbdsP70122 Olfr1443-203ENSMUST00000215134 3995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SbdsP70122 Pkn2-210ENSMUST00000174422 2904 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SbdsP70122 Ehf-203ENSMUST00000111176 3696 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SbdsP70122 Nlrp4c-202ENSMUST00000121583 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SbdsP70122 Lrrc4c-202ENSMUST00000135431 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SbdsP70122 Ubtfl1-202ENSMUST00000164441 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SbdsP70122 Zfp287-206ENSMUST00000185656 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SbdsP70122 AC192616.2-201ENSMUST00000221482 3841 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SbdsP70122 AC151971.5-201ENSMUST00000214422 3254 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SbdsP70122 Fam126b-207ENSMUST00000161600 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SbdsP70122 Olfr390-202ENSMUST00000120081 3604 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SbdsP70122 Olfr1443-201ENSMUST00000049724 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SbdsP70122 Traj18-201ENSMUST00000103723 66 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SbdsP70122 Xlr-203ENSMUST00000114810 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SbdsP70122 Gm23839-201ENSMUST00000116957 109 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SbdsP70122 Gm15781-201ENSMUST00000120216 323 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SbdsP70122 Gm15331-201ENSMUST00000120225 385 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SbdsP70122 Gm7571-201ENSMUST00000120252 927 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SbdsP70122 Tmem150cos-201ENSMUST00000143245 1216 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SbdsP70122 4930519D14Rik-201ENSMUST00000151471 1137 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SbdsP70122 Gm25387-201ENSMUST00000157813 132 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SbdsP70122 Gm25439-201ENSMUST00000158280 131 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SbdsP70122 Gm6872-201ENSMUST00000165001 700 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SbdsP70122 Gm7271-201ENSMUST00000172369 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SbdsP70122 Gm8419-201ENSMUST00000189886 412 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SbdsP70122 Gm38122-201ENSMUST00000192679 885 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SbdsP70122 Gm40190-201ENSMUST00000196570 471 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SbdsP70122 Gm43348-201ENSMUST00000197867 530 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SbdsP70122 Gm42880-201ENSMUST00000198028 459 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SbdsP70122 Gm32754-202ENSMUST00000199504 480 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SbdsP70122 Gm44432-201ENSMUST00000203342 938 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SbdsP70122 1700051K13Rik-201ENSMUST00000204426 696 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SbdsP70122 4921513I08Rik-201ENSMUST00000206993 866 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SbdsP70122 Gm45722-201ENSMUST00000213075 466 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SbdsP70122 Gm5831-201ENSMUST00000216016 1209 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SbdsP70122 Emc2-201ENSMUST00000022962 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SbdsP70122 Xlr-201ENSMUST00000067763 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SbdsP70122 Mup14-202ENSMUST00000075206 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SbdsP70122 Nlrp4a-201ENSMUST00000068767 4259 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SbdsP70122 AC122769.3-201ENSMUST00000227739 3245 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SbdsP70122 R3hdm1-201ENSMUST00000036288 4795 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SbdsP70122 G6pd2-201ENSMUST00000053876 2348 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SbdsP70122 Gm11885-201ENSMUST00000118473 1428 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SbdsP70122 Cdh7-203ENSMUST00000129923 1409 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SbdsP70122 Dtna-206ENSMUST00000221880 4490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SbdsP70122 Mfn1-202ENSMUST00000118286 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SbdsP70122 Alg11-201ENSMUST00000072572 4960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SbdsP70122 Klrb1f-201ENSMUST00000032257 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SbdsP70122 Atp7a-201ENSMUST00000055941 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SbdsP70122 Mier1-202ENSMUST00000097945 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SbdsP70122 Gm26893-202ENSMUST00000180965 2079 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SbdsP70122 Gm26552-202ENSMUST00000180980 2079 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SbdsP70122 Gm13835-201ENSMUST00000118459 685 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SbdsP70122 Gm16423-201ENSMUST00000120078 947 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SbdsP70122 Gm14092-201ENSMUST00000136794 617 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SbdsP70122 Gm15775-201ENSMUST00000159796 538 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SbdsP70122 Gm16164-201ENSMUST00000160078 468 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SbdsP70122 Gm8582-201ENSMUST00000164061 789 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SbdsP70122 Gm23872-201ENSMUST00000175432 77 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SbdsP70122 Pkib-209ENSMUST00000177325 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SbdsP70122 Gm26579-201ENSMUST00000181656 918 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SbdsP70122 Gm26851-201ENSMUST00000181867 918 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SbdsP70122 Gm8581-201ENSMUST00000188636 890 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SbdsP70122 1700072G22Rik-201ENSMUST00000189460 548 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SbdsP70122 Gm2602-201ENSMUST00000202112 571 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SbdsP70122 Gm18467-201ENSMUST00000208805 434 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SbdsP70122 Gm18851-201ENSMUST00000210087 1058 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SbdsP70122 Gm20786-201ENSMUST00000212649 436 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SbdsP70122 Gm46102-201ENSMUST00000217005 731 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SbdsP70122 AC126554.2-201ENSMUST00000223259 400 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SbdsP70122 AC133598.3-204ENSMUST00000224260 767 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SbdsP70122 Magea4-201ENSMUST00000048675 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SbdsP70122 Olfr481-201ENSMUST00000067143 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SbdsP70122 Defb2-201ENSMUST00000006745 305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SbdsP70122 Olfr1254-201ENSMUST00000099764 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SbdsP70122 Cbx5-202ENSMUST00000118152 8803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SbdsP70122 Slfn4-201ENSMUST00000000208 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SbdsP70122 Vmn1r27-202ENSMUST00000226666 2969 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SbdsP70122 Amy2a5-201ENSMUST00000098673 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SbdsP70122 Gm37735-201ENSMUST00000193995 1406 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SbdsP70122 Cyp39a1-201ENSMUST00000170988 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SbdsP70122 Ccar1-201ENSMUST00000020268 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SbdsP70122 Atp1b4-202ENSMUST00000115134 4189 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.2 ms