Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Rps4x-ps-201ENSMUST00000199852 793 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
VdrP48281 Iglc3-201ENSMUST00000200235 452 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
VdrP48281 Clec2f-202ENSMUST00000204981 657 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
VdrP48281 2610306O10Rik-201ENSMUST00000206512 612 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
VdrP48281 1700034P13Rik-206ENSMUST00000207445 1146 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
VdrP48281 Gm44919-201ENSMUST00000208587 1073 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
VdrP48281 Gm7789-201ENSMUST00000210473 701 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
VdrP48281 Gm19572-201ENSMUST00000214326 338 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
VdrP48281 Gm7392-201ENSMUST00000217815 345 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
VdrP48281 AC163041.1-201ENSMUST00000221984 133 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
VdrP48281 AC157571.1-201ENSMUST00000222014 520 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
VdrP48281 CR974485.1-201ENSMUST00000222408 402 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
VdrP48281 AC124569.4-201ENSMUST00000223830 1220 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
VdrP48281 AC166822.1-201ENSMUST00000227667 636 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
VdrP48281 AC107453.2-201ENSMUST00000227714 655 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
VdrP48281 Gm26130-201ENSMUST00000083171 138 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
VdrP48281 Olfr473-201ENSMUST00000084761 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
VdrP48281 Olfr753-ps1-203ENSMUST00000208970 2764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
VdrP48281 Gm21093-201ENSMUST00000084677 1710 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
VdrP48281 Pigb-201ENSMUST00000093819 2866 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
VdrP48281 Olfr550-202ENSMUST00000216524 4957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.28
VdrP48281 Gm26835-201ENSMUST00000181888 3274 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.28
VdrP48281 Pln-201ENSMUST00000046221 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
VdrP48281 Gm9496-201ENSMUST00000191295 1601 ntBASIC7.09□□□□□ -1.28
VdrP48281 Tshr-204ENSMUST00000221216 1638 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.28
VdrP48281 Gm38026-201ENSMUST00000193284 3880 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
VdrP48281 Gm44626-201ENSMUST00000207035 2715 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
VdrP48281 Sntg1-210ENSMUST00000191683 4510 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
VdrP48281 Gm44175-201ENSMUST00000204863 4256 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
VdrP48281 Gm45872-201ENSMUST00000209804 1584 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
VdrP48281 Olfr1015-203ENSMUST00000215945 2479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
VdrP48281 Zfand4-201ENSMUST00000036503 3123 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
VdrP48281 Foxp2-204ENSMUST00000115472 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
VdrP48281 Grik2-202ENSMUST00000105484 3992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
VdrP48281 Gm30329-201ENSMUST00000211572 3077 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
VdrP48281 Golga3-202ENSMUST00000112512 8132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
VdrP48281 A630072L19Rik-202ENSMUST00000221309 1519 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
VdrP48281 Zdhhc9-202ENSMUST00000088935 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
VdrP48281 Zcchc18-201ENSMUST00000033804 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
VdrP48281 C630043F03Rik-201ENSMUST00000122923 2581 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
VdrP48281 Gm38124-201ENSMUST00000191710 2581 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
VdrP48281 Gm42697-201ENSMUST00000198992 4092 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
VdrP48281 Gm25593-201ENSMUST00000102272 96 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
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VdrP48281 Igkv12-46-201ENSMUST00000103365 377 ntAPPRIS P1 BASIC7.08□□□□□ -1.28
VdrP48281 Gm25276-201ENSMUST00000104300 124 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
VdrP48281 Gm23527-201ENSMUST00000104570 130 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
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VdrP48281 Gm11758-201ENSMUST00000107326 936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
VdrP48281 Rps12-ps10-201ENSMUST00000117447 399 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
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VdrP48281 Gm14887-201ENSMUST00000119522 663 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
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VdrP48281 Gm7309-201ENSMUST00000121670 581 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
VdrP48281 Gm12358-201ENSMUST00000121842 520 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
VdrP48281 2810403D21Rik-201ENSMUST00000123040 601 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
VdrP48281 AI838599-201ENSMUST00000133960 2953 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
VdrP48281 Gm15792-201ENSMUST00000137099 769 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
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VdrP48281 Tecr-202ENSMUST00000163837 1272 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
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VdrP48281 Gm40292-201ENSMUST00000202383 553 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
VdrP48281 Gm42673-201ENSMUST00000202676 337 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
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VdrP48281 AC117688.1-201ENSMUST00000213142 832 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
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VdrP48281 Sfrp4-204ENSMUST00000222992 1062 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
VdrP48281 Ly6g-201ENSMUST00000023246 336 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
VdrP48281 Olfr109-201ENSMUST00000031086 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.08□□□□□ -1.28
VdrP48281 1110032A03Rik-202ENSMUST00000042576 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
VdrP48281 Olfr103-201ENSMUST00000058826 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.08□□□□□ -1.28
VdrP48281 Rps6-ps1-201ENSMUST00000074205 750 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
VdrP48281 Olfr1383-201ENSMUST00000077143 940 ntAPPRIS P1 BASIC7.08□□□□□ -1.28
VdrP48281 Olfr916-201ENSMUST00000081196 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.08□□□□□ -1.28
VdrP48281 Gm25135-201ENSMUST00000082648 143 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
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