Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Gm20815-201ENSMUST00000115496 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
RxraP28700 Gm8501-201ENSMUST00000117684 432 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RxraP28700 Gm4234-201ENSMUST00000119747 714 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RxraP28700 Rpl21-ps9-201ENSMUST00000119897 482 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RxraP28700 Gm15238-201ENSMUST00000119938 1296 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RxraP28700 Gm11609-201ENSMUST00000121926 793 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RxraP28700 Gm25047-201ENSMUST00000122667 104 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RxraP28700 Gm6938-201ENSMUST00000123014 771 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
RxraP28700 Gm21772-201ENSMUST00000169213 478 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RxraP28700 Gm3242-201ENSMUST00000171273 485 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RxraP28700 Gm17126-201ENSMUST00000172276 523 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RxraP28700 Odaph-201ENSMUST00000178614 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
RxraP28700 Mir6398-201ENSMUST00000184541 102 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RxraP28700 Gm28080-201ENSMUST00000188552 722 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RxraP28700 1700108F19Rik-203ENSMUST00000188798 619 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
RxraP28700 Gm21812-202ENSMUST00000188908 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
RxraP28700 Gm21524-201ENSMUST00000190499 696 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RxraP28700 Gm21715-201ENSMUST00000191056 694 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RxraP28700 Gm37604-201ENSMUST00000191749 1272 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RxraP28700 C030032O16Rik-201ENSMUST00000196427 716 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RxraP28700 Mark1-ps1-201ENSMUST00000198516 717 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RxraP28700 Gm5554-201ENSMUST00000199726 1206 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RxraP28700 Gm44374-201ENSMUST00000199821 140 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RxraP28700 Gm43126-201ENSMUST00000201546 429 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
RxraP28700 Gm18215-201ENSMUST00000204429 798 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RxraP28700 Gm44538-201ENSMUST00000205615 348 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RxraP28700 Gm34350-201ENSMUST00000208898 481 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
RxraP28700 Gm20586-201ENSMUST00000210122 547 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RxraP28700 Gm45823-201ENSMUST00000212714 515 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
RxraP28700 Gm32105-201ENSMUST00000218512 511 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
RxraP28700 CT030030.1-201ENSMUST00000218809 152 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RxraP28700 AC167202.1-201ENSMUST00000219027 331 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RxraP28700 AC151904.3-201ENSMUST00000219266 895 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RxraP28700 Rpl29-ps2-202ENSMUST00000220540 1165 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
RxraP28700 AC164302.1-201ENSMUST00000227036 433 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RxraP28700 Ssxb2-201ENSMUST00000023931 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
RxraP28700 Mcts1-201ENSMUST00000000365 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
RxraP28700 Olfr794-201ENSMUST00000059957 963 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
RxraP28700 Olfr1354-201ENSMUST00000075859 1095 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
RxraP28700 Olfr196-201ENSMUST00000077027 930 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
RxraP28700 Olfr640-201ENSMUST00000084799 945 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
RxraP28700 Cntn1-201ENSMUST00000000109 5646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
RxraP28700 Herc1-201ENSMUST00000042824 15153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
RxraP28700 Gm21778-202ENSMUST00000185926 1482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
RxraP28700 Sirpb1c-201ENSMUST00000050623 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
RxraP28700 Sri-202ENSMUST00000088786 2504 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
RxraP28700 Gm44102-201ENSMUST00000204031 1666 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RxraP28700 Vmn1r51-209ENSMUST00000227911 4021 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
RxraP28700 2700089I24Rik-201ENSMUST00000190204 1827 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
RxraP28700 Gm34639-201ENSMUST00000222648 2241 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
RxraP28700 Cav1-201ENSMUST00000007799 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
RxraP28700 Gm4070-201ENSMUST00000106766 8795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
RxraP28700 Gvin1-201ENSMUST00000006667 8795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
RxraP28700 Cntn3-202ENSMUST00000203619 5294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
RxraP28700 Cyp2j13-201ENSMUST00000030305 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
RxraP28700 Zfp287-206ENSMUST00000185656 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
RxraP28700 A330015K06Rik-202ENSMUST00000195685 2196 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
RxraP28700 Gm38335-201ENSMUST00000195727 1789 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
RxraP28700 Gm40649-201ENSMUST00000219795 1457 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
RxraP28700 Rptn-201ENSMUST00000045912 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
RxraP28700 Dnajb7-201ENSMUST00000057236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
RxraP28700 Snora35-201ENSMUST00000104579 128 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
RxraP28700 Eri2-203ENSMUST00000106523 973 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
RxraP28700 Cd47-202ENSMUST00000114496 867 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
RxraP28700 Gm13506-201ENSMUST00000120391 1083 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
RxraP28700 Fam229b-205ENSMUST00000135785 674 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
RxraP28700 Gm13373-201ENSMUST00000144634 655 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
RxraP28700 Gm15634-201ENSMUST00000147206 492 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
RxraP28700 Snora47-201ENSMUST00000157483 138 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
RxraP28700 1700071M16Rik-201ENSMUST00000164150 537 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
RxraP28700 Gm17198-201ENSMUST00000171792 1154 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
RxraP28700 Gm22701-201ENSMUST00000175371 291 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
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RxraP28700 1110008L16Rik-203ENSMUST00000183654 943 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
RxraP28700 Dlx6os1-204ENSMUST00000184182 146 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
RxraP28700 Gm29587-201ENSMUST00000189898 332 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
RxraP28700 Gm38330-201ENSMUST00000192743 959 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
RxraP28700 Gm37958-201ENSMUST00000193131 430 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
RxraP28700 4933436F18Rik-201ENSMUST00000193468 802 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
RxraP28700 4933401J01Rik-201ENSMUST00000193812 1070 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
RxraP28700 Il6-204ENSMUST00000199765 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
RxraP28700 Gm43531-201ENSMUST00000200676 1114 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
RxraP28700 1700051K13Rik-201ENSMUST00000204426 696 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
RxraP28700 Gm44200-201ENSMUST00000204883 662 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
RxraP28700 Gm44366-201ENSMUST00000204933 674 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
RxraP28700 Nxpe1-ps-203ENSMUST00000210879 822 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
RxraP28700 Gm7570-201ENSMUST00000215246 698 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
RxraP28700 AC122508.1-201ENSMUST00000218365 233 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
RxraP28700 Gm4928-201ENSMUST00000219622 850 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
RxraP28700 AC079644.3-201ENSMUST00000222452 357 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
RxraP28700 Gm18247-201ENSMUST00000222937 601 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
RxraP28700 AC154634.2-201ENSMUST00000225983 1184 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
RxraP28700 Scgb2b24-201ENSMUST00000055444 523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
RxraP28700 Eri2-202ENSMUST00000063902 1241 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
RxraP28700 Vmn1r52-201ENSMUST00000079832 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
RxraP28700 Ugt1a7c-202ENSMUST00000113135 3302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
RxraP28700 B530045E10Rik-204ENSMUST00000220146 3244 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
RxraP28700 Enpp3-201ENSMUST00000020169 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
RxraP28700 Lilra6-201ENSMUST00000038176 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
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