Protein–RNA interactions for Protein: H3BKF4

Gm20708, Predicted gene 20708, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20708H3BKF4 Gm20916-202ENSMUST00000185338 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Gm20708H3BKF4 Gm28897-201ENSMUST00000185340 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Gm20708H3BKF4 Gm20736-202ENSMUST00000185550 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Gm20708H3BKF4 Gm20835-201ENSMUST00000185565 923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Gm20708H3BKF4 Gm29564-201ENSMUST00000185575 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Gm20708H3BKF4 Gm29299-201ENSMUST00000185609 923 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Gm20708H3BKF4 Gm21317-201ENSMUST00000185636 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Gm20708H3BKF4 Gm21858-202ENSMUST00000185713 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Gm20708H3BKF4 Gm28553-201ENSMUST00000185924 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Gm20708H3BKF4 Gm20908-201ENSMUST00000186004 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Gm20708H3BKF4 Gm21409-201ENSMUST00000186110 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Gm20708H3BKF4 Gm28998-201ENSMUST00000186194 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Gm20708H3BKF4 Gm21191-201ENSMUST00000186484 930 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Gm20708H3BKF4 Gm20906-201ENSMUST00000186493 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Gm20708H3BKF4 Gm28237-201ENSMUST00000186563 641 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Gm20708H3BKF4 Gm20929-201ENSMUST00000186578 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Gm20708H3BKF4 Gm20824-201ENSMUST00000186739 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Gm20708H3BKF4 Gm21518-202ENSMUST00000186938 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Gm20708H3BKF4 Gm20855-202ENSMUST00000186996 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Gm20708H3BKF4 Gm20911-201ENSMUST00000187135 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Gm20708H3BKF4 Gm28102-201ENSMUST00000187146 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Gm20708H3BKF4 Gm28827-201ENSMUST00000187165 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Gm20708H3BKF4 Gm20931-202ENSMUST00000187293 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Gm20708H3BKF4 Gm21760-202ENSMUST00000187433 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Gm20708H3BKF4 Gm20920-201ENSMUST00000187477 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Gm20708H3BKF4 Gm21627-201ENSMUST00000187768 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Gm20708H3BKF4 Gm28156-201ENSMUST00000187880 1136 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Gm20708H3BKF4 Gm28080-201ENSMUST00000188552 722 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Gm20708H3BKF4 1700111N16Rik-201ENSMUST00000188663 1133 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Gm20708H3BKF4 Gm20850-201ENSMUST00000188672 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Gm20708H3BKF4 Gm29600-201ENSMUST00000188687 377 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Gm20708H3BKF4 Gm21488-201ENSMUST00000188744 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Gm20708H3BKF4 Gm20820-201ENSMUST00000188754 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Gm20708H3BKF4 Gm20894-201ENSMUST00000188864 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Gm20708H3BKF4 Gm20869-201ENSMUST00000188958 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Gm20708H3BKF4 Gm28576-201ENSMUST00000189007 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Gm20708H3BKF4 Gm21173-201ENSMUST00000189238 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Gm20708H3BKF4 Gm20870-201ENSMUST00000189315 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Gm20708H3BKF4 Gm20903-201ENSMUST00000189346 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Gm20708H3BKF4 Gm21209-202ENSMUST00000189354 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Gm20708H3BKF4 Gm20937-203ENSMUST00000189422 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Gm20708H3BKF4 Gm21497-201ENSMUST00000189455 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Gm20708H3BKF4 Gm20890-201ENSMUST00000189518 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Gm20708H3BKF4 Gm21477-202ENSMUST00000189543 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Gm20708H3BKF4 Gm29110-201ENSMUST00000189924 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Gm20708H3BKF4 Gm28919-201ENSMUST00000190026 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Gm20708H3BKF4 Gm20814-201ENSMUST00000190173 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Gm20708H3BKF4 Gm29573-201ENSMUST00000190291 919 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Gm20708H3BKF4 Sly-202ENSMUST00000190292 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Gm20708H3BKF4 Gm21524-201ENSMUST00000190499 696 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Gm20708H3BKF4 Gm21650-202ENSMUST00000190551 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Gm20708H3BKF4 Gm28961-201ENSMUST00000190573 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Gm20708H3BKF4 Gm20905-201ENSMUST00000190782 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Gm20708H3BKF4 Gm29503-201ENSMUST00000191044 930 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Gm20708H3BKF4 Gm21715-201ENSMUST00000191056 694 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Gm20708H3BKF4 Gm20817-201ENSMUST00000191123 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Gm20708H3BKF4 Gm21865-202ENSMUST00000191443 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Gm20708H3BKF4 Gm21258-202ENSMUST00000191553 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Gm20708H3BKF4 Gm29866-201ENSMUST00000191675 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Gm20708H3BKF4 Gm31571-201ENSMUST00000192521 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Gm20708H3BKF4 Gm31942-201ENSMUST00000192534 827 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Gm20708H3BKF4 Gm30737-201ENSMUST00000192683 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Gm20708H3BKF4 Gm21366-201ENSMUST00000192892 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Gm20708H3BKF4 Gm35134-201ENSMUST00000194086 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Gm20708H3BKF4 Gm4859-201ENSMUST00000199625 787 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Gm20708H3BKF4 Gm43762-201ENSMUST00000201521 295 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Gm20708H3BKF4 4930528H21Rik-201ENSMUST00000204264 495 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Gm20708H3BKF4 1700126G02Rik-201ENSMUST00000204351 725 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Gm20708H3BKF4 Gm44984-201ENSMUST00000207802 394 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Gm20708H3BKF4 Olfr369-ps1-201ENSMUST00000212589 836 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Gm20708H3BKF4 Olfr643-202ENSMUST00000217217 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Gm20708H3BKF4 Gm32105-201ENSMUST00000218512 511 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Gm20708H3BKF4 4930520K02Rik-202ENSMUST00000219658 396 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Gm20708H3BKF4 AC166358.6-201ENSMUST00000221834 1206 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Gm20708H3BKF4 AC155305.1-201ENSMUST00000222207 319 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Gm20708H3BKF4 AC121137.1-201ENSMUST00000225272 602 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Gm20708H3BKF4 E330017A01Rik-201ENSMUST00000053249 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Gm20708H3BKF4 Olfr867-201ENSMUST00000060780 996 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Gm20708H3BKF4 Tas2r120-201ENSMUST00000071707 892 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Gm20708H3BKF4 Olfr504-201ENSMUST00000075595 958 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Gm20708H3BKF4 Vmn1r220-202ENSMUST00000226651 6252 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Gm20708H3BKF4 Clasp1-202ENSMUST00000070989 7767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Gm20708H3BKF4 Ndufaf4-201ENSMUST00000029925 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Gm20708H3BKF4 Scaper-202ENSMUST00000214747 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Gm20708H3BKF4 Trpm3-202ENSMUST00000074770 6710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Gm20708H3BKF4 9830132P13Rik-201ENSMUST00000198240 4187 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Gm20708H3BKF4 Gm37894-201ENSMUST00000195416 2599 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Gm20708H3BKF4 Hibch-201ENSMUST00000044478 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Gm20708H3BKF4 Gm42705-201ENSMUST00000200176 2465 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Gm20708H3BKF4 Ddx58-201ENSMUST00000037907 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Gm20708H3BKF4 Dnah11-201ENSMUST00000084806 14072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Gm20708H3BKF4 Vmn2r-ps21-201ENSMUST00000177115 2947 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Gm20708H3BKF4 4933406C10Rik-202ENSMUST00000181670 1633 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Gm20708H3BKF4 Slc17a4-201ENSMUST00000021769 1604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Gm20708H3BKF4 Mrps25-203ENSMUST00000140438 6073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Gm20708H3BKF4 Gm37106-201ENSMUST00000193760 1532 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Gm20708H3BKF4 Il5-201ENSMUST00000048605 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Gm20708H3BKF4 Gm36011-201ENSMUST00000208671 2719 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Gm20708H3BKF4 Gm37943-201ENSMUST00000194053 3944 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Gm20708H3BKF4 Pcdh15-237ENSMUST00000193361 7881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81 ms