Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 Gm14093-201ENSMUST00000145579 364 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Samt1A2BED8 Gm14640-201ENSMUST00000145800 437 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Samt1A2BED8 Mir1953-201ENSMUST00000157866 89 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Samt1A2BED8 Gm8582-201ENSMUST00000164061 789 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Samt1A2BED8 Gm20545-201ENSMUST00000174739 210 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Samt1A2BED8 Gm5260-201ENSMUST00000186157 949 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Samt1A2BED8 Olfr1215-201ENSMUST00000188399 943 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Samt1A2BED8 Gm37503-201ENSMUST00000192088 319 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Samt1A2BED8 Gm2367-201ENSMUST00000192374 472 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Samt1A2BED8 Gm37341-201ENSMUST00000194680 371 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Samt1A2BED8 Slamf7-205ENSMUST00000194791 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Samt1A2BED8 Ighv1-73-201ENSMUST00000197435 352 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Samt1A2BED8 Gm43175-201ENSMUST00000198450 3810 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Samt1A2BED8 Gm4870-201ENSMUST00000198525 1251 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Samt1A2BED8 Gm43132-201ENSMUST00000199106 792 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Samt1A2BED8 Gm44277-201ENSMUST00000205128 649 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Samt1A2BED8 Olfr162-ps1-201ENSMUST00000206015 934 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Samt1A2BED8 Pttg1-202ENSMUST00000020687 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Samt1A2BED8 Olfr1476-ps1-201ENSMUST00000208572 367 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Samt1A2BED8 Gm34350-201ENSMUST00000208898 481 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Samt1A2BED8 Gm45259-201ENSMUST00000209217 1006 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Samt1A2BED8 Gm45750-201ENSMUST00000211966 354 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Samt1A2BED8 Gm40787-201ENSMUST00000218056 317 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Samt1A2BED8 AC121947.1-201ENSMUST00000221755 1145 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Samt1A2BED8 Zp4-ps-202ENSMUST00000222293 922 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Samt1A2BED8 Ssxb2-201ENSMUST00000023931 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Samt1A2BED8 Cox20-201ENSMUST00000027781 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Samt1A2BED8 1700028P14Rik-201ENSMUST00000035849 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Samt1A2BED8 Rps11-ps4-201ENSMUST00000062226 474 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Samt1A2BED8 Olfr1447-201ENSMUST00000071484 1113 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Samt1A2BED8 Ccdc7a-202ENSMUST00000108747 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Samt1A2BED8 Vmn1r51-209ENSMUST00000227911 4021 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Samt1A2BED8 Cftr-204ENSMUST00000129452 2835 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Samt1A2BED8 Pkn2-206ENSMUST00000173830 2808 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Samt1A2BED8 Dcdc2c-204ENSMUST00000189735 1434 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Samt1A2BED8 Vmn1r171-209ENSMUST00000228228 2863 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Samt1A2BED8 Slc19a3-201ENSMUST00000045560 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Samt1A2BED8 Slamf7-203ENSMUST00000192195 3975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Samt1A2BED8 Gm37311-201ENSMUST00000195541 2024 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Samt1A2BED8 Pum2-209ENSMUST00000168361 6226 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Samt1A2BED8 Mdm4-210ENSMUST00000188090 7105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Samt1A2BED8 Gm37250-201ENSMUST00000194919 2388 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Samt1A2BED8 Clec2g-203ENSMUST00000142388 2404 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Samt1A2BED8 Lrrc4c-203ENSMUST00000162807 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Samt1A2BED8 Steap2-209ENSMUST00000164219 10089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Samt1A2BED8 Piga-201ENSMUST00000033754 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Samt1A2BED8 Olfr670-202ENSMUST00000214216 3729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Samt1A2BED8 Gm15581-201ENSMUST00000131334 5640 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Samt1A2BED8 Gm13176-201ENSMUST00000117910 477 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Samt1A2BED8 Serpina1f-203ENSMUST00000118101 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Samt1A2BED8 Gm15078-201ENSMUST00000118371 782 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Samt1A2BED8 Gm7927-201ENSMUST00000118818 880 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Samt1A2BED8 Pramel-201ENSMUST00000118979 1383 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Samt1A2BED8 Gm15181-201ENSMUST00000120142 177 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Samt1A2BED8 Gm13162-201ENSMUST00000121481 454 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Samt1A2BED8 Gm11990-201ENSMUST00000121505 897 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Samt1A2BED8 Gm12438-201ENSMUST00000122034 336 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Samt1A2BED8 Astx4d-201ENSMUST00000123136 1149 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Samt1A2BED8 Astx3-201ENSMUST00000123508 1150 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Samt1A2BED8 Gm14135-201ENSMUST00000135438 591 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Samt1A2BED8 Med9os-202ENSMUST00000139794 446 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Samt1A2BED8 Gm11962-201ENSMUST00000145746 255 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Samt1A2BED8 Gm16297-201ENSMUST00000161466 459 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Samt1A2BED8 Wfdc15b-203ENSMUST00000164567 497 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Samt1A2BED8 1700024B05Rik-202ENSMUST00000168972 1573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Samt1A2BED8 Astx4a-201ENSMUST00000177683 1149 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Samt1A2BED8 Astx1c-201ENSMUST00000177724 1150 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Samt1A2BED8 Astx4c-201ENSMUST00000178390 1149 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Samt1A2BED8 Astx1b-201ENSMUST00000178608 1150 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Samt1A2BED8 Astx2-201ENSMUST00000179135 1150 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Samt1A2BED8 Astx4b-201ENSMUST00000179359 1149 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Samt1A2BED8 Astx1a-201ENSMUST00000179529 1150 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Samt1A2BED8 Astx5-201ENSMUST00000179723 1150 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Samt1A2BED8 Astx6-201ENSMUST00000180281 1150 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Samt1A2BED8 Gm4832-202ENSMUST00000183295 375 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Samt1A2BED8 Gm27004-201ENSMUST00000183300 727 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Samt1A2BED8 Gm29586-201ENSMUST00000185225 1104 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Samt1A2BED8 Vmn1r189-201ENSMUST00000186062 1137 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Samt1A2BED8 Gm28253-201ENSMUST00000186071 712 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Samt1A2BED8 Gm29178-203ENSMUST00000186312 1104 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Samt1A2BED8 Gm21761-202ENSMUST00000187530 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Samt1A2BED8 Gm29409-202ENSMUST00000189623 901 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Samt1A2BED8 Rd3l-203ENSMUST00000189759 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Samt1A2BED8 Gm29587-201ENSMUST00000189898 332 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Samt1A2BED8 Gm29624-202ENSMUST00000190185 1104 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Samt1A2BED8 Gm29179-209ENSMUST00000190621 1100 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Samt1A2BED8 Gm37135-201ENSMUST00000192652 534 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Samt1A2BED8 Gm4856-201ENSMUST00000192696 1091 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Samt1A2BED8 Ccdc144b-203ENSMUST00000200469 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Samt1A2BED8 Gm42646-201ENSMUST00000202233 914 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Samt1A2BED8 Gm44163-201ENSMUST00000205140 475 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Samt1A2BED8 Api5-ps-201ENSMUST00000206607 577 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Samt1A2BED8 Olfr712-ps1-201ENSMUST00000207690 950 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Samt1A2BED8 Olfr1195-202ENSMUST00000213545 2585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Samt1A2BED8 Olfr390-204ENSMUST00000215161 3740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Samt1A2BED8 AC122290.1-201ENSMUST00000225631 1078 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Samt1A2BED8 AC122459.2-201ENSMUST00000227099 638 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Samt1A2BED8 AC161383.1-201ENSMUST00000227356 527 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Samt1A2BED8 Cypt1-201ENSMUST00000024026 672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Samt1A2BED8 Scgb2b24-201ENSMUST00000055444 523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms