Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

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Length 1,113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Gm17987-201ENSMUST00000206902 603 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Hdac5Q9Z2V6 Gm6702-201ENSMUST00000208496 471 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Hdac5Q9Z2V6 Gm45432-201ENSMUST00000210391 416 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Hdac5Q9Z2V6 AC155929.4-201ENSMUST00000218493 491 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Hdac5Q9Z2V6 AC160970.1-201ENSMUST00000219311 475 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Hdac5Q9Z2V6 AC154755.1-201ENSMUST00000225244 537 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Hdac5Q9Z2V6 AC122858.1-201ENSMUST00000226212 433 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Hdac5Q9Z2V6 Olfr769-201ENSMUST00000050915 1084 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
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Hdac5Q9Z2V6 Olfr1046-201ENSMUST00000099902 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
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Hdac5Q9Z2V6 Cmtr2-201ENSMUST00000056972 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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Hdac5Q9Z2V6 AC164883.2-201ENSMUST00000227931 3815 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Hdac5Q9Z2V6 Pmfbp1-201ENSMUST00000034162 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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Hdac5Q9Z2V6 Gm5118-201ENSMUST00000184692 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hdac5Q9Z2V6 Tmcc1-203ENSMUST00000172510 2612 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hdac5Q9Z2V6 Mageb18-202ENSMUST00000113955 2163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
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Hdac5Q9Z2V6 Gm17841-201ENSMUST00000210711 2425 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
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Hdac5Q9Z2V6 Atp2b4-201ENSMUST00000048953 8292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hdac5Q9Z2V6 Dsc3-203ENSMUST00000225110 3123 ntAPPRIS P2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
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Hdac5Q9Z2V6 Gm25498-201ENSMUST00000104424 129 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Hdac5Q9Z2V6 Gm12322-201ENSMUST00000121605 389 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
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Hdac5Q9Z2V6 Gm11916-201ENSMUST00000132759 650 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
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Hdac5Q9Z2V6 5430401F13Rik-202ENSMUST00000161385 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
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Hdac5Q9Z2V6 AC149586.1-201ENSMUST00000222647 645 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hdac5Q9Z2V6 4930474N09Rik-201ENSMUST00000223511 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
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Hdac5Q9Z2V6 4930430A15Rik-201ENSMUST00000028577 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hdac5Q9Z2V6 Dsg4-201ENSMUST00000019426 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
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Hdac5Q9Z2V6 Fmr1-204ENSMUST00000114655 4199 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
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Hdac5Q9Z2V6 Cps1-201ENSMUST00000027144 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hdac5Q9Z2V6 Sulf1-201ENSMUST00000088585 4630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hdac5Q9Z2V6 Olfr1179-202ENSMUST00000213157 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hdac5Q9Z2V6 Gm44916-201ENSMUST00000208664 2194 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Hdac5Q9Z2V6 Gm9871-203ENSMUST00000204837 1560 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hdac5Q9Z2V6 Galnt11-203ENSMUST00000114952 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hdac5Q9Z2V6 Spag17os-201ENSMUST00000137776 2437 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hdac5Q9Z2V6 Gm37080-201ENSMUST00000194804 2404 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Hdac5Q9Z2V6 Gm26002-201ENSMUST00000101915 107 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Hdac5Q9Z2V6 Igkv14-126-201ENSMUST00000103310 358 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hdac5Q9Z2V6 Igkv8-24-201ENSMUST00000103384 365 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hdac5Q9Z2V6 S100a1-202ENSMUST00000107340 577 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hdac5Q9Z2V6 Olfr328-202ENSMUST00000108824 1199 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hdac5Q9Z2V6 Atp5j-203ENSMUST00000114193 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hdac5Q9Z2V6 Fam107b-204ENSMUST00000115054 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hdac5Q9Z2V6 Gm14918-201ENSMUST00000118153 268 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Hdac5Q9Z2V6 Gm12880-201ENSMUST00000120652 494 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Hdac5Q9Z2V6 Gm16224-201ENSMUST00000127711 412 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hdac5Q9Z2V6 Gm11659-201ENSMUST00000137561 466 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hdac5Q9Z2V6 Rrm2b-203ENSMUST00000137636 900 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hdac5Q9Z2V6 Gm13727-201ENSMUST00000154480 424 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hdac5Q9Z2V6 Gm22675-201ENSMUST00000158430 104 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Hdac5Q9Z2V6 Gm5283-201ENSMUST00000177874 334 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Hdac5Q9Z2V6 n-R5s93-201ENSMUST00000180091 119 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Hdac5Q9Z2V6 Rian-214ENSMUST00000183026 596 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hdac5Q9Z2V6 Gm35108-201ENSMUST00000194321 699 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.8 ms