Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Crtam-202ENSMUST00000180384 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rb1cc1Q9ESK9 Gm44235-201ENSMUST00000204312 3058 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Rb1cc1Q9ESK9 Scn11a-202ENSMUST00000215718 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rb1cc1Q9ESK9 Wdr17-209ENSMUST00000150488 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rb1cc1Q9ESK9 AC155243.1-201ENSMUST00000220141 2262 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rb1cc1Q9ESK9 Ampd3-201ENSMUST00000005829 4094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr1015-203ENSMUST00000215945 2479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rb1cc1Q9ESK9 Fgf10-201ENSMUST00000022246 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rb1cc1Q9ESK9 Gm4847-201ENSMUST00000046662 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rb1cc1Q9ESK9 n-R5s82-201ENSMUST00000104213 109 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Rb1cc1Q9ESK9 Gm11912-201ENSMUST00000117235 264 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15400-201ENSMUST00000118944 601 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Rb1cc1Q9ESK9 Mir6926-201ENSMUST00000184562 68 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Rb1cc1Q9ESK9 Gm20203-201ENSMUST00000192352 332 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Rb1cc1Q9ESK9 Gm43444-201ENSMUST00000198123 291 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Rb1cc1Q9ESK9 Pvrig-ps-201ENSMUST00000199472 204 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Rb1cc1Q9ESK9 Gm6362-201ENSMUST00000217686 836 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr68-201ENSMUST00000072513 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr1261-201ENSMUST00000077785 921 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rb1cc1Q9ESK9 Gm6104-201ENSMUST00000078030 603 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Rb1cc1Q9ESK9 Lifr-204ENSMUST00000226471 3392 ntAPPRIS P3 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rb1cc1Q9ESK9 Cpb2-201ENSMUST00000022576 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr1299-201ENSMUST00000207228 1678 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rb1cc1Q9ESK9 Nlrp4a-204ENSMUST00000146907 3479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rb1cc1Q9ESK9 Gm43175-201ENSMUST00000198450 3810 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Rb1cc1Q9ESK9 C79798-201ENSMUST00000131588 1793 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rb1cc1Q9ESK9 Magea5-202ENSMUST00000169540 1563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rb1cc1Q9ESK9 Unc80-206ENSMUST00000212557 9777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rb1cc1Q9ESK9 Pigb-201ENSMUST00000093819 2866 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rb1cc1Q9ESK9 Gm45786-201ENSMUST00000213021 2278 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Rb1cc1Q9ESK9 Cdh8-201ENSMUST00000093249 3790 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rb1cc1Q9ESK9 Pcdh17-201ENSMUST00000071370 11451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Rb1cc1Q9ESK9 Gm16132-201ENSMUST00000159296 598 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Rb1cc1Q9ESK9 2310031A07Rik-201ENSMUST00000181212 990 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rb1cc1Q9ESK9 Gm44622-201ENSMUST00000209128 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rb1cc1Q9ESK9 5330439M10Rik-201ENSMUST00000218667 348 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Rb1cc1Q9ESK9 C1d-201ENSMUST00000000594 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rb1cc1Q9ESK9 C530050E15Rik-201ENSMUST00000181373 3837 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp975-201ENSMUST00000107992 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Rb1cc1Q9ESK9 Dclre1c-204ENSMUST00000115066 3828 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rb1cc1Q9ESK9 Ccdc82-201ENSMUST00000110583 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Rb1cc1Q9ESK9 Psg21-202ENSMUST00000182128 2066 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Rb1cc1Q9ESK9 1700047L14Rik-201ENSMUST00000189659 511 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Rb1cc1Q9ESK9 Gm43408-201ENSMUST00000198263 440 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
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Rb1cc1Q9ESK9 Sgms2-201ENSMUST00000090246 5801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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Rb1cc1Q9ESK9 Gm6011-201ENSMUST00000211736 1796 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Rb1cc1Q9ESK9 Ndufaf4-201ENSMUST00000029925 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rb1cc1Q9ESK9 Ncoa4-201ENSMUST00000111994 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rb1cc1Q9ESK9 Dtna-203ENSMUST00000220904 3860 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rb1cc1Q9ESK9 Heph-201ENSMUST00000033553 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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Rb1cc1Q9ESK9 Gm14308-202ENSMUST00000117267 777 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rb1cc1Q9ESK9 Mrpl24-203ENSMUST00000121048 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rb1cc1Q9ESK9 Gm11802-201ENSMUST00000137749 653 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rb1cc1Q9ESK9 Gm10784-201ENSMUST00000178715 238 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Rb1cc1Q9ESK9 Gm23945-201ENSMUST00000179609 92 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Rb1cc1Q9ESK9 Gm26972-201ENSMUST00000183218 344 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rb1cc1Q9ESK9 Gm27148-201ENSMUST00000185086 160 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Rb1cc1Q9ESK9 Gm8999-201ENSMUST00000204951 969 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Rb1cc1Q9ESK9 Gm44893-201ENSMUST00000207259 443 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr588-ps1-202ENSMUST00000210115 912 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
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Rb1cc1Q9ESK9 Gm2607-201ENSMUST00000212389 627 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Rb1cc1Q9ESK9 Vmn1r177-201ENSMUST00000073967 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr1138-201ENSMUST00000099848 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rb1cc1Q9ESK9 AC133076.2-201ENSMUST00000227678 3532 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Rb1cc1Q9ESK9 Lgalsl-201ENSMUST00000047028 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rb1cc1Q9ESK9 Sin3a-204ENSMUST00000167715 4961 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.5 ms