Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 AC108846.2-201ENSMUST00000214925 731 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 1700025K04Rik-201ENSMUST00000218075 1174 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 AC124420.1-201ENSMUST00000219779 791 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 AC159622.2-201ENSMUST00000221592 983 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 AC154250.1-201ENSMUST00000224775 489 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 AC154431.2-201ENSMUST00000225215 1055 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 AC116395.1-201ENSMUST00000225480 1143 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 Rbp7-201ENSMUST00000030848 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 Rpgr-201ENSMUST00000044598 3805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 Olfr617-201ENSMUST00000048265 957 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 Olfr745-201ENSMUST00000062534 1175 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 Gm6369-201ENSMUST00000069626 412 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 Vmn1r234-201ENSMUST00000079633 990 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 n-R5s95-201ENSMUST00000082684 118 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 Sult2a3-201ENSMUST00000098809 1018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 Gm44667-201ENSMUST00000207632 3337 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 Gm21123-201ENSMUST00000210822 1734 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 Gm38062-201ENSMUST00000192541 1856 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 Stx17-202ENSMUST00000107720 5770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 Vmn2r2-201ENSMUST00000077958 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 Gm29666-201ENSMUST00000189185 8038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 Itih4-204ENSMUST00000168782 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 Dcun1d4-202ENSMUST00000087181 4117 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 Olfr725-202ENSMUST00000206920 1519 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 Klrk1-205ENSMUST00000168919 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 Gm45671-201ENSMUST00000210229 3920 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 Olfr259-203ENSMUST00000215828 4095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 Gm38284-201ENSMUST00000194803 4539 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 Ncr1-202ENSMUST00000126417 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 Vmn1r12-203ENSMUST00000227581 6490 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 Olfr292-201ENSMUST00000080165 3211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 Olfr281-202ENSMUST00000217517 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 Mospd2-202ENSMUST00000112247 2479 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 Vmn1r220-205ENSMUST00000228239 7849 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 Gm38126-201ENSMUST00000195297 4003 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 Orc2-202ENSMUST00000114325 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 Olfr651-203ENSMUST00000216904 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 Taf13-204ENSMUST00000143054 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 Gm43891-201ENSMUST00000205132 3112 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 Atp12a-201ENSMUST00000007340 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 Rhox3b-ps-201ENSMUST00000121045 868 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 Gm12399-201ENSMUST00000121475 446 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 Gm14800-201ENSMUST00000122084 1272 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 Scgb2b23-ps-201ENSMUST00000122094 330 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 Gm10658-201ENSMUST00000128125 1241 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 Gm12827-201ENSMUST00000132690 660 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 Gm13261-201ENSMUST00000137351 1020 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 Gm24768-201ENSMUST00000158512 94 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 Gm23387-201ENSMUST00000158586 107 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 Gm15775-201ENSMUST00000159796 538 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 Vmn1r166-201ENSMUST00000164045 921 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 Gm8453-201ENSMUST00000167253 921 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 Atp2b4-208ENSMUST00000167348 243 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 Gm4498-201ENSMUST00000168580 921 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 Gm3242-201ENSMUST00000171273 485 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 Vmn1r118-201ENSMUST00000172322 921 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 Malat1-202ENSMUST00000173314 556 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 Gm18588-201ENSMUST00000177308 492 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 Gm8693-201ENSMUST00000178871 921 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 Vmn1r138-201ENSMUST00000179206 921 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 Vmn1r131-201ENSMUST00000179390 921 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 Vmn1r111-201ENSMUST00000179511 921 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 4831440E17Rik-201ENSMUST00000181942 1028 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 Gm27193-201ENSMUST00000184217 586 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 1700040F17Rik-201ENSMUST00000187158 817 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 Gm29605-201ENSMUST00000190800 292 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 Gm37126-201ENSMUST00000195289 883 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 Gm43576-201ENSMUST00000197937 871 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 Gm6366-201ENSMUST00000198766 826 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 Gm3321-201ENSMUST00000200603 1129 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 Gm36378-201ENSMUST00000201709 388 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 AL603630.1-201ENSMUST00000214781 147 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 AL772397.1-201ENSMUST00000216707 606 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 AC153821.1-201ENSMUST00000217893 581 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 Gm9535-201ENSMUST00000218499 768 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 AC159238.1-201ENSMUST00000220699 343 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 AC154861.1-201ENSMUST00000223767 800 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 Ear14-202ENSMUST00000228064 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 Olfr49-201ENSMUST00000059996 1030 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 Orm2-201ENSMUST00000075341 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 Olfr1029-201ENSMUST00000082191 1061 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 Olfr1143-201ENSMUST00000090708 945 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 Ctla4-202ENSMUST00000097720 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 Olfr1164-201ENSMUST00000099834 1112 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 Olfr1138-201ENSMUST00000099848 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 Serpinb3b-201ENSMUST00000086694 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 Mgat4a-206ENSMUST00000154819 2796 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 Gm7108-201ENSMUST00000118038 3407 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 Cd180-204ENSMUST00000171267 1787 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 Olfr947-ps1-202ENSMUST00000214936 2168 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 Stk32a-201ENSMUST00000045477 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 Olfr406-202ENSMUST00000214303 2842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 Atp8a2-201ENSMUST00000080368 12886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 Gm13974-201ENSMUST00000144368 1454 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.44
Rnft1Q9DCN7 Ppig-202ENSMUST00000090858 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Rnft1Q9DCN7 Gm37079-201ENSMUST00000194114 2135 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Rnft1Q9DCN7 Zbed6-201ENSMUST00000190574 5007 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Rnft1Q9DCN7 Cdk14-202ENSMUST00000115450 2386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Rnft1Q9DCN7 Tcf7l2-202ENSMUST00000061496 4053 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Rnft1Q9DCN7 Mfap1a-201ENSMUST00000089926 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.5 ms