Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Nol8-201ENSMUST00000021824 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Dusp16-204ENSMUST00000149776 3305 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Gm17473-201ENSMUST00000180585 2216 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Tbx22-204ENSMUST00000168403 1715 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Gm43485-201ENSMUST00000199292 1710 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 BC030870-201ENSMUST00000098713 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 AC153962.3-202ENSMUST00000217778 1412 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Vmn1r196-204ENSMUST00000228382 6525 ntAPPRIS P2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Pign-206ENSMUST00000187537 4006 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Trim6-201ENSMUST00000098180 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Olfr1392-203ENSMUST00000214170 3507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Olfr1392-205ENSMUST00000214598 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Gm37087-201ENSMUST00000192966 3309 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Gm37752-201ENSMUST00000193494 3309 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 4933409F18Rik-202ENSMUST00000222026 1584 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Adam6b-201ENSMUST00000063317 2547 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Olfr1171-ps1-202ENSMUST00000150178 1398 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Olfr31-202ENSMUST00000206009 4017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Gm24709-201ENSMUST00000104123 132 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Gm11911-201ENSMUST00000117938 1023 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Mageb16-ps1-201ENSMUST00000117991 1127 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Gm15400-201ENSMUST00000118944 601 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Gm14805-201ENSMUST00000120172 340 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Gm25227-201ENSMUST00000158204 112 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Gm25439-201ENSMUST00000158280 131 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Vmn1r9-201ENSMUST00000171186 1051 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Gm9597-201ENSMUST00000171913 602 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Kcnj13-202ENSMUST00000174179 261 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Gm22655-201ENSMUST00000174949 96 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Gm27653-201ENSMUST00000185037 136 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Olfr1228-201ENSMUST00000190757 1094 ntAPPRIS P2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Gm2367-201ENSMUST00000192374 472 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Gm37591-201ENSMUST00000193283 650 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Gm6074-201ENSMUST00000193340 451 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Ighv8-5-201ENSMUST00000194257 358 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Rrh-205ENSMUST00000196902 1250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Gm43655-201ENSMUST00000197367 222 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Gm44463-201ENSMUST00000198895 137 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Gm4756-203ENSMUST00000208307 798 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Gm45579-201ENSMUST00000209367 887 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Axdnd1-210ENSMUST00000212747 1238 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 AC156801.1-201ENSMUST00000216158 493 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 CT009515.3-201ENSMUST00000226509 671 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Vmn1r31-205ENSMUST00000228586 2115 ntAPPRIS P2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 AC120375.2-202ENSMUST00000228722 397 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Rps11-ps4-201ENSMUST00000062226 474 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Olfr516-201ENSMUST00000071410 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Wdr83os-201ENSMUST00000079764 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Olfr39-202ENSMUST00000212983 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Gm3286-203ENSMUST00000201629 1945 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 AC155167.2-201ENSMUST00000226127 1945 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Tead1-202ENSMUST00000069256 9480 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Klrb1f-201ENSMUST00000032257 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Olfr1392-206ENSMUST00000215861 3670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Hdlbp-204ENSMUST00000186164 3808 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Olfr1214-203ENSMUST00000217469 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Parp4-201ENSMUST00000161553 6387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Kcnma1-208ENSMUST00000177634 4605 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Pot1a-201ENSMUST00000115327 2447 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Ktn1-224ENSMUST00000191018 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Nlgn1-203ENSMUST00000191835 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Slc9a9-201ENSMUST00000033463 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Gm40987-202ENSMUST00000221856 1588 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 1700019D03Rik-203ENSMUST00000114493 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Olfr1173-201ENSMUST00000099830 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Vmn1r171-202ENSMUST00000226128 3063 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Gm12185-202ENSMUST00000094476 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Brs3-201ENSMUST00000033464 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Magea6-202ENSMUST00000112562 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Gm14267-201ENSMUST00000119751 496 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Gm12301-201ENSMUST00000152963 523 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Sox5os3-202ENSMUST00000154167 765 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Gm8032-201ENSMUST00000171009 574 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Obox4-ps38-201ENSMUST00000175961 724 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Gm2916-201ENSMUST00000178392 384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Gm10410-201ENSMUST00000180138 384 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Gm26898-201ENSMUST00000181678 384 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Gm4832-201ENSMUST00000182679 399 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Gm27208-201ENSMUST00000184323 604 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Gm6693-201ENSMUST00000189583 813 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Gm7890-201ENSMUST00000204877 601 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Olfr562-ps1-201ENSMUST00000210779 951 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 AC119894.1-201ENSMUST00000220399 350 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 AC164618.3-201ENSMUST00000224863 681 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 AC102139.1-201ENSMUST00000227000 251 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 AC124709.3-201ENSMUST00000227294 171 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Gm5830-201ENSMUST00000049117 443 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Olfr564-201ENSMUST00000061096 951 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Dph3b-ps-201ENSMUST00000076359 246 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Magea6-201ENSMUST00000076986 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Gm45562-201ENSMUST00000210015 1537 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Vmn1r80-206ENSMUST00000228028 6918 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Olfr736-204ENSMUST00000215227 2485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Kat6b-ps1-201ENSMUST00000187624 3433 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Gm19084-201ENSMUST00000222939 1762 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Ift80-208ENSMUST00000169064 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Daw1-202ENSMUST00000065436 1349 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Vmn2r28-201ENSMUST00000086297 3785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Samd12-201ENSMUST00000078673 9019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Flrt2-201ENSMUST00000057324 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
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