Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Vmn1r155-201ENSMUST00000177632 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Atg3Q9CPX6 Vmn1r137-201ENSMUST00000177884 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Atg3Q9CPX6 Vmn1r130-201ENSMUST00000177936 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Atg3Q9CPX6 Vmn1r107-201ENSMUST00000179079 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Atg3Q9CPX6 Vmn1r165-201ENSMUST00000179594 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Atg3Q9CPX6 Gm27468-201ENSMUST00000183577 106 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Atg3Q9CPX6 Oaz3-201ENSMUST00000191506 732 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Atg3Q9CPX6 Gm36378-201ENSMUST00000201709 388 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Atg3Q9CPX6 Tas2r111-ps2-201ENSMUST00000203794 901 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Atg3Q9CPX6 Gm18689-201ENSMUST00000203969 902 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Atg3Q9CPX6 Olfr27-201ENSMUST00000214052 1076 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Atg3Q9CPX6 AC122305.3-201ENSMUST00000214762 361 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Atg3Q9CPX6 AC173345.3-201ENSMUST00000221245 1093 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Atg3Q9CPX6 CT025538.2-201ENSMUST00000226083 772 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Atg3Q9CPX6 AC131033.2-201ENSMUST00000228138 1011 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Atg3Q9CPX6 Gm10799-201ENSMUST00000099666 312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Atg3Q9CPX6 Cyp2j8-201ENSMUST00000124729 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Atg3Q9CPX6 1700030N03Rik-203ENSMUST00000190575 3146 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Atg3Q9CPX6 AC155255.1-201ENSMUST00000218751 1428 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Atg3Q9CPX6 Nuf2-202ENSMUST00000111368 2405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Atg3Q9CPX6 Gm31218-202ENSMUST00000221428 1823 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Atg3Q9CPX6 Muc15-201ENSMUST00000090332 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Atg3Q9CPX6 Olfr114-203ENSMUST00000216249 1457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Atg3Q9CPX6 Pgbd1-201ENSMUST00000099719 3283 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Atg3Q9CPX6 Gramd1c-203ENSMUST00000179565 3159 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Atg3Q9CPX6 Lcp1-209ENSMUST00000145303 3841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Atg3Q9CPX6 Slc9a4-201ENSMUST00000027233 3962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Atg3Q9CPX6 Gm38325-201ENSMUST00000194507 1377 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Atg3Q9CPX6 Gm37082-201ENSMUST00000192629 1927 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Atg3Q9CPX6 Adam30-201ENSMUST00000050342 3510 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Atg3Q9CPX6 Gm42436-201ENSMUST00000198804 3656 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Atg3Q9CPX6 5830444B04Rik-204ENSMUST00000166921 2870 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Atg3Q9CPX6 Arhgdib-202ENSMUST00000111891 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Atg3Q9CPX6 Oosp3-202ENSMUST00000119053 621 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Atg3Q9CPX6 Gm12654-201ENSMUST00000120387 587 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Atg3Q9CPX6 Olfr1274-ps-201ENSMUST00000120681 1035 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Atg3Q9CPX6 Gm15877-201ENSMUST00000121897 964 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Atg3Q9CPX6 Gm12488-201ENSMUST00000122449 499 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Atg3Q9CPX6 Med9os-202ENSMUST00000139794 446 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Atg3Q9CPX6 Gm15642-201ENSMUST00000148057 311 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Atg3Q9CPX6 Gm23774-201ENSMUST00000158990 131 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Atg3Q9CPX6 Gm22923-201ENSMUST00000174952 110 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Atg3Q9CPX6 Vmn1r-ps143-201ENSMUST00000176730 604 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Atg3Q9CPX6 Gm22917-201ENSMUST00000180116 110 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Atg3Q9CPX6 Gm28610-201ENSMUST00000187716 406 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Atg3Q9CPX6 Gm28238-201ENSMUST00000188102 383 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Atg3Q9CPX6 Gm28061-201ENSMUST00000189085 807 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Atg3Q9CPX6 Gm8325-202ENSMUST00000193411 182 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Atg3Q9CPX6 Gm43436-201ENSMUST00000199308 147 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Atg3Q9CPX6 1700065J11Rik-201ENSMUST00000201560 424 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Atg3Q9CPX6 Gm44053-201ENSMUST00000203364 929 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Atg3Q9CPX6 AC153544.1-201ENSMUST00000217988 400 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Atg3Q9CPX6 AC121569.2-201ENSMUST00000222557 574 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Atg3Q9CPX6 Gm7550-201ENSMUST00000223334 282 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Atg3Q9CPX6 Dapl1-201ENSMUST00000028369 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Atg3Q9CPX6 Ceacam12-201ENSMUST00000032520 1056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Atg3Q9CPX6 Gm24029-201ENSMUST00000083928 143 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Atg3Q9CPX6 Gm44113-201ENSMUST00000203510 3041 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Atg3Q9CPX6 Gm36947-201ENSMUST00000194709 2249 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Atg3Q9CPX6 Lpin2-203ENSMUST00000126681 4167 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Atg3Q9CPX6 Samd8-202ENSMUST00000119430 6801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Atg3Q9CPX6 Timm17a-201ENSMUST00000081104 7280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Atg3Q9CPX6 1700093K21Rik-204ENSMUST00000169264 1320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Atg3Q9CPX6 Tank-205ENSMUST00000112502 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Atg3Q9CPX6 Tank-201ENSMUST00000078074 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Atg3Q9CPX6 4932416K20Rik-201ENSMUST00000093229 3554 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Atg3Q9CPX6 Slf1-201ENSMUST00000151524 3747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Atg3Q9CPX6 Vmn1r171-212ENSMUST00000228674 2488 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Atg3Q9CPX6 Cfap57-202ENSMUST00000081921 3750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Atg3Q9CPX6 Arsk-201ENSMUST00000120573 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Atg3Q9CPX6 Synrg-208ENSMUST00000183714 3651 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Atg3Q9CPX6 Gm45885-202ENSMUST00000211520 1383 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Atg3Q9CPX6 AC164297.2-201ENSMUST00000224388 1508 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Atg3Q9CPX6 Tlr4-201ENSMUST00000048096 4077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Atg3Q9CPX6 Olfr1181-202ENSMUST00000102619 1240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Atg3Q9CPX6 Ap3s1-ps1-201ENSMUST00000117113 579 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Atg3Q9CPX6 Gm13189-201ENSMUST00000138462 252 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Atg3Q9CPX6 Gm15882-201ENSMUST00000161344 855 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Atg3Q9CPX6 Gm10269-201ENSMUST00000165229 372 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Atg3Q9CPX6 Gm4141-201ENSMUST00000174364 921 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Atg3Q9CPX6 Gm4201-201ENSMUST00000174775 921 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Atg3Q9CPX6 Gm20549-201ENSMUST00000174804 429 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Atg3Q9CPX6 Meis1-208ENSMUST00000177417 5308 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Atg3Q9CPX6 Ap3s1-ps2-201ENSMUST00000178107 579 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Atg3Q9CPX6 Mir7006-201ENSMUST00000183624 69 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Atg3Q9CPX6 Gm4587-201ENSMUST00000209135 637 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Atg3Q9CPX6 5033424D13Rik-201ENSMUST00000221779 648 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Atg3Q9CPX6 Gm6474-201ENSMUST00000223250 699 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Atg3Q9CPX6 AC118006.2-201ENSMUST00000224167 962 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Atg3Q9CPX6 CT025579.3-201ENSMUST00000224543 451 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Atg3Q9CPX6 AC154452.1-201ENSMUST00000225819 241 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Atg3Q9CPX6 AC118250.1-201ENSMUST00000228569 875 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Atg3Q9CPX6 Olfr965-201ENSMUST00000069342 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Atg3Q9CPX6 Olfr1181-201ENSMUST00000099823 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Atg3Q9CPX6 Ank3-240ENSMUST00000183169 6870 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Atg3Q9CPX6 Zfp81-201ENSMUST00000054072 6639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Atg3Q9CPX6 Gm17021-202ENSMUST00000214413 2371 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Atg3Q9CPX6 Foxp1-204ENSMUST00000113322 7177 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Atg3Q9CPX6 Olfr1085-202ENSMUST00000213279 5191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Atg3Q9CPX6 Slc26a7-201ENSMUST00000042221 5165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.3 ms