Protein–RNA interactions for Protein: Q8BK35

Nop53, Ribosome biogenesis protein NOP53, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop53Q8BK35 Gm29617-206ENSMUST00000187759 1600 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Nop53Q8BK35 Gm28749-205ENSMUST00000187886 1600 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Nop53Q8BK35 Gm29000-208ENSMUST00000190932 1600 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Nop53Q8BK35 Gm10062-201ENSMUST00000072180 1470 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Nop53Q8BK35 Olfr1351-202ENSMUST00000216030 2489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Nop53Q8BK35 Tmem56-201ENSMUST00000029777 6248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Nop53Q8BK35 Gm42930-201ENSMUST00000200872 3260 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Nop53Q8BK35 Igkc-201ENSMUST00000103410 532 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
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Nop53Q8BK35 Gm22206-201ENSMUST00000158612 116 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Nop53Q8BK35 Gpx2-ps1-201ENSMUST00000160622 571 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Nop53Q8BK35 Gm3216-201ENSMUST00000166927 486 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Nop53Q8BK35 Gm23639-201ENSMUST00000175078 132 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Nop53Q8BK35 B230104I21Rik-201ENSMUST00000181143 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
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Nop53Q8BK35 1700016P04Rik-201ENSMUST00000186770 429 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
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Nop53Q8BK35 4933438B17Rik-202ENSMUST00000196374 576 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
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Nop53Q8BK35 Hcfc1r1-ps1-201ENSMUST00000198911 346 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Nop53Q8BK35 Zfp799-203ENSMUST00000201876 632 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
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Nop53Q8BK35 Gm38843-201ENSMUST00000209189 323 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
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Nop53Q8BK35 Olfr1044-201ENSMUST00000099906 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Nop53Q8BK35 Zmat4-206ENSMUST00000207301 4207 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Nop53Q8BK35 Olfr167-202ENSMUST00000214315 7435 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Nop53Q8BK35 Plcb1-201ENSMUST00000070724 3853 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
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Nop53Q8BK35 Psd3-203ENSMUST00000093468 1739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
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Nop53Q8BK35 Pramel4-202ENSMUST00000091676 2399 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Nop53Q8BK35 Gm7739-201ENSMUST00000221131 1560 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
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Nop53Q8BK35 Nxt2-203ENSMUST00000112914 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
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Nop53Q8BK35 Ighv9-2-201ENSMUST00000103472 351 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
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Nop53Q8BK35 1700007K09Rik-202ENSMUST00000188899 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Nop53Q8BK35 2610012C04Rik-201ENSMUST00000193434 1023 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
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Nop53Q8BK35 Gm44943-201ENSMUST00000207254 300 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Nop53Q8BK35 Olfr587-ps1-202ENSMUST00000209201 477 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Nop53Q8BK35 Odf3l1-202ENSMUST00000215694 1212 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Nop53Q8BK35 AC151971.2-201ENSMUST00000217540 909 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Nop53Q8BK35 Erh-204ENSMUST00000218364 665 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Nop53Q8BK35 AC131720.2-201ENSMUST00000220420 431 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Nop53Q8BK35 Gm16381-201ENSMUST00000220528 503 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Nop53Q8BK35 Gm4052-201ENSMUST00000220890 451 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Nop53Q8BK35 Rpl29-ps2-203ENSMUST00000222043 1036 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Nop53Q8BK35 Gm2001-201ENSMUST00000223236 503 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Nop53Q8BK35 Gcnt2-204ENSMUST00000223570 335 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Nop53Q8BK35 AV026068-229ENSMUST00000225516 595 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Nop53Q8BK35 Acrv1-201ENSMUST00000034620 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Nop53Q8BK35 Pbsn-201ENSMUST00000000003 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Nop53Q8BK35 Rab1a-206ENSMUST00000163483 2657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Nop53Q8BK35 Gm13340-201ENSMUST00000117219 1545 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Nop53Q8BK35 Spic-201ENSMUST00000004473 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Nop53Q8BK35 4930444G20Rik-201ENSMUST00000092672 1773 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Nop53Q8BK35 Erc2-208ENSMUST00000210924 4871 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
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