Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Gm18537-201ENSMUST00000205709 989 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Ctdnep1Q3TP92 Gm31522-201ENSMUST00000207942 762 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Ctdnep1Q3TP92 Gm45069-201ENSMUST00000208604 317 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Ctdnep1Q3TP92 AC121947.1-201ENSMUST00000221755 1145 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Ctdnep1Q3TP92 Lgals2-201ENSMUST00000044584 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Ctdnep1Q3TP92 Olfr107-201ENSMUST00000077008 1033 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Ctdnep1Q3TP92 Gm37132-201ENSMUST00000195553 2238 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Ctdnep1Q3TP92 Nipal1-201ENSMUST00000087212 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Ctdnep1Q3TP92 Gm37018-201ENSMUST00000192441 3869 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Ctdnep1Q3TP92 Ubtfl1-202ENSMUST00000164441 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Ctdnep1Q3TP92 Zbed4-ps2-201ENSMUST00000187003 3448 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Ctdnep1Q3TP92 Tmprss11a-201ENSMUST00000101073 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ctdnep1Q3TP92 Gm37221-201ENSMUST00000194472 3007 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Ctdnep1Q3TP92 Olfr167-202ENSMUST00000214315 7435 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ctdnep1Q3TP92 Nlrp9c-201ENSMUST00000041845 2631 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ctdnep1Q3TP92 Igkv8-26-201ENSMUST00000103382 371 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ctdnep1Q3TP92 Il19-202ENSMUST00000112465 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ctdnep1Q3TP92 Gm11699-201ENSMUST00000119016 401 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Ctdnep1Q3TP92 Gm11533-201ENSMUST00000120287 477 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Ctdnep1Q3TP92 Gm23430-201ENSMUST00000122490 314 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Ctdnep1Q3TP92 Gm25459-201ENSMUST00000157953 114 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Ctdnep1Q3TP92 Gm16139-201ENSMUST00000160015 420 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Ctdnep1Q3TP92 Gm8582-201ENSMUST00000164061 789 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Ctdnep1Q3TP92 Rasgrp3-202ENSMUST00000164192 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ctdnep1Q3TP92 Il19-201ENSMUST00000016668 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ctdnep1Q3TP92 Gm27006-201ENSMUST00000182218 943 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Ctdnep1Q3TP92 Zcchc10-201ENSMUST00000018383 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ctdnep1Q3TP92 A730094K22Rik-201ENSMUST00000193867 740 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Ctdnep1Q3TP92 Gimd1-202ENSMUST00000196701 654 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ctdnep1Q3TP92 Gm43078-201ENSMUST00000197222 168 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Ctdnep1Q3TP92 Gm34549-202ENSMUST00000207356 970 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ctdnep1Q3TP92 Ube2dnl1-201ENSMUST00000059509 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ctdnep1Q3TP92 Rasgrp3-201ENSMUST00000095204 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ctdnep1Q3TP92 Siae-201ENSMUST00000002007 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ctdnep1Q3TP92 Gm44695-201ENSMUST00000205567 1631 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Ctdnep1Q3TP92 Gm15011-201ENSMUST00000117724 1480 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Ctdnep1Q3TP92 Galnt1-208ENSMUST00000178605 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ctdnep1Q3TP92 Gm43062-201ENSMUST00000196302 1319 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Ctdnep1Q3TP92 Dazl-201ENSMUST00000010736 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ctdnep1Q3TP92 Iqca-207ENSMUST00000212394 2574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ctdnep1Q3TP92 Gm43175-201ENSMUST00000198450 3810 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1357-202ENSMUST00000203305 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ctdnep1Q3TP92 Gm37971-201ENSMUST00000193516 3391 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Ctdnep1Q3TP92 Gm37717-201ENSMUST00000192647 3027 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Ctdnep1Q3TP92 Olfr448-202ENSMUST00000213952 3024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Ctdnep1Q3TP92 C920009B18Rik-202ENSMUST00000181223 4535 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Ctdnep1Q3TP92 CT573016.1-201ENSMUST00000224814 2103 ntAPPRIS P5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Ctdnep1Q3TP92 Olfr705-203ENSMUST00000216009 3085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Ctdnep1Q3TP92 Gm2016-201ENSMUST00000110147 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Ctdnep1Q3TP92 Gm35256-201ENSMUST00000212780 3269 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Ctdnep1Q3TP92 Ugt1a7c-202ENSMUST00000113135 3302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Ctdnep1Q3TP92 1500005C15Rik-201ENSMUST00000199867 2394 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Ctdnep1Q3TP92 Ostn-201ENSMUST00000066852 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Ctdnep1Q3TP92 Cep55-201ENSMUST00000096096 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Ctdnep1Q3TP92 AF366264-201ENSMUST00000071308 3157 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Ctdnep1Q3TP92 Gm16523-202ENSMUST00000203640 4750 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Ctdnep1Q3TP92 Gm15754-201ENSMUST00000119191 478 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Ctdnep1Q3TP92 Gm15747-201ENSMUST00000141216 460 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Ctdnep1Q3TP92 Ptprtos-201ENSMUST00000151688 630 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Ctdnep1Q3TP92 Gm15790-201ENSMUST00000161109 1251 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Ctdnep1Q3TP92 Olfr753-ps1-202ENSMUST00000174673 919 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Ctdnep1Q3TP92 C920009B18Rik-203ENSMUST00000181643 1004 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Ctdnep1Q3TP92 Gm8419-201ENSMUST00000189886 412 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Ctdnep1Q3TP92 Gm28640-201ENSMUST00000190918 550 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Ctdnep1Q3TP92 Gm37235-201ENSMUST00000195171 59 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Ctdnep1Q3TP92 Gm37220-201ENSMUST00000195179 415 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Ctdnep1Q3TP92 Ighv1-44-201ENSMUST00000195597 352 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Ctdnep1Q3TP92 Gm43444-201ENSMUST00000198123 291 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Ctdnep1Q3TP92 Gm44110-201ENSMUST00000203871 475 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Ctdnep1Q3TP92 Gm44134-202ENSMUST00000204777 545 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Ctdnep1Q3TP92 Glud-ps-201ENSMUST00000206310 657 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Ctdnep1Q3TP92 Rfpl4-203ENSMUST00000208468 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Ctdnep1Q3TP92 1300002E11Rik-206ENSMUST00000209728 701 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Ctdnep1Q3TP92 Gm45525-201ENSMUST00000210800 389 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Ctdnep1Q3TP92 Gm10709-201ENSMUST00000213318 480 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Ctdnep1Q3TP92 CU024910.1-201ENSMUST00000214310 418 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Ctdnep1Q3TP92 Gm6362-201ENSMUST00000217686 836 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Ctdnep1Q3TP92 Gm19116-201ENSMUST00000218592 642 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Ctdnep1Q3TP92 AC156576.2-202ENSMUST00000222525 411 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Ctdnep1Q3TP92 Ceacam12-201ENSMUST00000032520 1056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Ctdnep1Q3TP92 Gm8526-201ENSMUST00000079153 475 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Ctdnep1Q3TP92 n-R5s215-201ENSMUST00000082480 104 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Ctdnep1Q3TP92 Olfr441-201ENSMUST00000095954 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Ctdnep1Q3TP92 Gm38189-201ENSMUST00000194495 1457 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Ctdnep1Q3TP92 Gm7792-201ENSMUST00000201555 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Ctdnep1Q3TP92 Ube2n-201ENSMUST00000099329 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Ctdnep1Q3TP92 Csrnp3-204ENSMUST00000122912 10672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Ctdnep1Q3TP92 Zfp867-201ENSMUST00000057799 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Ctdnep1Q3TP92 Gm43771-201ENSMUST00000202931 1578 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Ctdnep1Q3TP92 Gm19125-201ENSMUST00000188408 1383 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Ctdnep1Q3TP92 Tbpl2-201ENSMUST00000080453 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Ctdnep1Q3TP92 Myo3b-201ENSMUST00000060208 6256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1215-202ENSMUST00000214809 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Ctdnep1Q3TP92 Zfp287-206ENSMUST00000185656 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Ctdnep1Q3TP92 Gm13057-201ENSMUST00000105776 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Ctdnep1Q3TP92 A830019L24Rik-202ENSMUST00000198056 3165 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Ctdnep1Q3TP92 AC131687.1-201ENSMUST00000225931 5446 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Ctdnep1Q3TP92 Uba6-201ENSMUST00000039373 6590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Ctdnep1Q3TP92 Lypd6-205ENSMUST00000169232 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Ctdnep1Q3TP92 Cdk14-202ENSMUST00000115450 2386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.9 ms