Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

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Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Tex48-201ENSMUST00000102861 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 Traj18-201ENSMUST00000103723 66 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 Gm24989-201ENSMUST00000104461 88 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 Vmn1r2-201ENSMUST00000105160 921 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 Gm11271-201ENSMUST00000116054 440 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 Gm4342-201ENSMUST00000118982 367 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 Gm12287-201ENSMUST00000119770 707 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 Gm8648-201ENSMUST00000122457 221 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 Gm15471-201ENSMUST00000145893 625 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 Gm12603-202ENSMUST00000146678 618 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 Gm15401-203ENSMUST00000156497 378 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 Gm20617-202ENSMUST00000177332 758 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 Gm27033-201ENSMUST00000183226 544 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 Gm29576-201ENSMUST00000188020 678 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 Gm29051-201ENSMUST00000190184 369 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 Gm28354-201ENSMUST00000190904 678 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 Gm29459-201ENSMUST00000191359 518 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 4930433B08Rik-201ENSMUST00000192010 644 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 Gm2229-201ENSMUST00000193328 710 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 Gm43241-201ENSMUST00000198375 364 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 Gm42951-201ENSMUST00000199688 684 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 Klk1b10-ps-201ENSMUST00000205895 783 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 Gm5027-201ENSMUST00000206700 375 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 Gm5339-201ENSMUST00000210551 1102 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 Gm45485-201ENSMUST00000211229 357 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 AC122905.1-201ENSMUST00000218181 456 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 AC167222.2-201ENSMUST00000220014 295 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 AC154851.2-201ENSMUST00000222172 644 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 AC129219.1-201ENSMUST00000224336 448 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 AC122251.2-201ENSMUST00000227341 603 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 Orm1-201ENSMUST00000030044 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 Olfr788-201ENSMUST00000056961 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 Vmn1r79-201ENSMUST00000062811 921 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 Olfr815-201ENSMUST00000071557 951 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 Orm2-201ENSMUST00000075341 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 Olfr1014-201ENSMUST00000076250 918 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 Gm22575-201ENSMUST00000082981 110 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 Rpl31-ps17-201ENSMUST00000097040 378 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 Defb18-201ENSMUST00000097818 258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 Lrrc51-202ENSMUST00000098236 949 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 Olfr1040-201ENSMUST00000099909 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 Gm32736-201ENSMUST00000200427 2701 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 Olfr281-202ENSMUST00000217517 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 Gm43503-201ENSMUST00000200033 3408 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 Mir99ahg-201ENSMUST00000068704 2858 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 Gabpb1-201ENSMUST00000039978 1991 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 Slc28a2-203ENSMUST00000110525 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 Gm37725-201ENSMUST00000193965 2125 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 Olfr537-ps1-202ENSMUST00000210949 2821 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 Olfr1389-203ENSMUST00000217595 3549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 Cpxcr1-201ENSMUST00000101269 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 Rapgef4-203ENSMUST00000102698 2982 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 Obox4-ps28-201ENSMUST00000175654 1362 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 Slc17a2-201ENSMUST00000006786 4629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 AC121960.2-201ENSMUST00000227349 3446 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 Ceacam2-202ENSMUST00000064862 3087 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 CT009765.1-201ENSMUST00000219088 2705 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 Ktn1-223ENSMUST00000190999 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 Gm33336-201ENSMUST00000219656 1676 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 Gm37342-201ENSMUST00000194588 4965 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 Gm38128-201ENSMUST00000192085 3250 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 Rpgrip1l-201ENSMUST00000047783 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 Abi3bp-201ENSMUST00000048471 4687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 Hlcs-209ENSMUST00000228910 4150 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 Zmat4-201ENSMUST00000042352 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 4933402E13Rik-202ENSMUST00000178085 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 Gm17146-201ENSMUST00000108464 372 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 Ncald-202ENSMUST00000116445 858 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 Gm14606-201ENSMUST00000117078 1155 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 Gm11212-201ENSMUST00000118337 618 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 Gm8855-201ENSMUST00000118888 878 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 Gm6121-201ENSMUST00000119231 924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 Gm5793-201ENSMUST00000119393 630 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 Gm11991-201ENSMUST00000119652 1074 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 Pcnp-204ENSMUST00000122253 792 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 Gm12152-201ENSMUST00000122465 684 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 n-R5s48-201ENSMUST00000122482 110 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 Gm12827-201ENSMUST00000132690 660 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 Olfr1177-ps-201ENSMUST00000137895 921 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 AI662270-203ENSMUST00000145461 592 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 Gm14710-201ENSMUST00000146082 1066 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 Sox5os2-201ENSMUST00000156443 627 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 Gm24359-201ENSMUST00000158418 221 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 Gm26211-201ENSMUST00000158578 129 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 Gm3159-201ENSMUST00000164038 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 Gm3127-201ENSMUST00000167839 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 Gm9890-201ENSMUST00000171867 537 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 Gm18006-201ENSMUST00000177411 662 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 Mir7072-201ENSMUST00000184542 60 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 Scgb2b9-ps-201ENSMUST00000189522 334 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 Gm38166-201ENSMUST00000191660 471 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 Gm37770-201ENSMUST00000192855 772 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 Gm8860-201ENSMUST00000193160 445 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 Gm29678-201ENSMUST00000193966 1134 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 Gm37477-201ENSMUST00000195215 884 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 Gm3544-201ENSMUST00000196129 305 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 Gm44361-201ENSMUST00000197960 94 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 Gm31520-201ENSMUST00000203048 733 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 C430039J01Rik-201ENSMUST00000205973 957 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp39Q3TIX9 Cwc15-202ENSMUST00000213913 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
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