Protein–RNA interactions for Protein: Q07802

Ebf1, Transcription factor COE1, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebf1Q07802 Gm10658-201ENSMUST00000128125 1241 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Ebf1Q07802 Gm16095-201ENSMUST00000128235 253 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Ebf1Q07802 Gm12655-202ENSMUST00000133884 925 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Ebf1Q07802 Gm16333-201ENSMUST00000161416 318 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Ebf1Q07802 Vmn2r-ps131-201ENSMUST00000176094 1046 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Ebf1Q07802 Fam47e-207ENSMUST00000176621 746 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Ebf1Q07802 Speer4c-202ENSMUST00000179506 480 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Ebf1Q07802 Gm6055-201ENSMUST00000180532 378 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Ebf1Q07802 Gm19200-201ENSMUST00000182579 1001 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Ebf1Q07802 Mir7235-201ENSMUST00000183796 56 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Ebf1Q07802 Mir6348-201ENSMUST00000183804 120 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Ebf1Q07802 Gm20897-201ENSMUST00000185240 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Ebf1Q07802 Gm20883-201ENSMUST00000185245 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Ebf1Q07802 Gm20916-202ENSMUST00000185338 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Ebf1Q07802 Gm28897-201ENSMUST00000185340 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Ebf1Q07802 Gm20736-202ENSMUST00000185550 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Ebf1Q07802 Gm20835-201ENSMUST00000185565 923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Ebf1Q07802 Gm29564-201ENSMUST00000185575 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
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Ebf1Q07802 Gm21317-201ENSMUST00000185636 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Ebf1Q07802 Gm29582-201ENSMUST00000185667 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Ebf1Q07802 Gm21858-202ENSMUST00000185713 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Ebf1Q07802 Gm28553-201ENSMUST00000185924 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Ebf1Q07802 Gm20908-201ENSMUST00000186004 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Ebf1Q07802 Gm21409-201ENSMUST00000186110 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Ebf1Q07802 Gm28998-201ENSMUST00000186194 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Ebf1Q07802 Gm20906-201ENSMUST00000186493 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Ebf1Q07802 Gm20929-201ENSMUST00000186578 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
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Ebf1Q07802 Gm20850-201ENSMUST00000188672 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
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Ebf1Q07802 Gm20820-201ENSMUST00000188754 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
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Ebf1Q07802 Mobp-206ENSMUST00000214943 435 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
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Ebf1Q07802 1700048P04Rik-201ENSMUST00000219825 369 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
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Ebf1Q07802 Rpl29-ps2-202ENSMUST00000220540 1165 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Ebf1Q07802 AC161252.1-201ENSMUST00000225536 467 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Ebf1Q07802 AC131068.1-201ENSMUST00000226891 482 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Ebf1Q07802 Dppa3-201ENSMUST00000049644 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Ebf1Q07802 Gm6863-201ENSMUST00000052882 636 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Ebf1Q07802 Olfr691-201ENSMUST00000057528 969 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Ebf1Q07802 Gm9961-201ENSMUST00000068397 547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Ebf1Q07802 Olfr805-201ENSMUST00000078876 960 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Ebf1Q07802 Gm22126-201ENSMUST00000083244 142 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Ebf1Q07802 Fpr-rs4-201ENSMUST00000095651 972 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Ebf1Q07802 AC168056.3-201ENSMUST00000225395 2540 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Ebf1Q07802 Vmn1r220-203ENSMUST00000227679 7868 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Ebf1Q07802 Vmn1r220-206ENSMUST00000228854 7854 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
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