Protein–RNA interactions for Protein: P62983

Rps27a, Ubiquitin-40S ribosomal protein S27a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps27aP62983 Gm9027-201ENSMUST00000165914 661 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 Gm4141-201ENSMUST00000174364 921 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 Gm4201-201ENSMUST00000174775 921 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 Gm21860-201ENSMUST00000177893 309 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 Rps12-ps21-201ENSMUST00000178172 402 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 Gm23450-201ENSMUST00000178285 91 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 Gm21748-201ENSMUST00000179623 309 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 BC065403-201ENSMUST00000180997 1022 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 Gm29234-201ENSMUST00000187452 1262 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 Gm16833-202ENSMUST00000189204 672 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 Gm37381-202ENSMUST00000194643 657 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 Slamf7-205ENSMUST00000194791 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 Anxa3-202ENSMUST00000196126 453 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 Gm3544-201ENSMUST00000196129 305 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 Gm43779-201ENSMUST00000196691 829 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 Gm8930-201ENSMUST00000201693 768 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 BC049739-201ENSMUST00000202626 660 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 Gm43930-201ENSMUST00000203868 845 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 Gm45246-201ENSMUST00000210820 367 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 Gm45722-201ENSMUST00000213075 466 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 Gm39384-201ENSMUST00000213703 743 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 AC165292.1-201ENSMUST00000215218 620 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 Gm19212-201ENSMUST00000216642 862 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 AC110816.1-201ENSMUST00000218559 980 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 1700048P04Rik-201ENSMUST00000219825 369 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 Prl2c2-203ENSMUST00000221612 596 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 AC158536.1-201ENSMUST00000222510 256 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 AC154795.1-201ENSMUST00000225611 364 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 AC114572.1-201ENSMUST00000227262 300 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 Tas2r143-201ENSMUST00000057398 882 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 Tas2r119-201ENSMUST00000057633 1006 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 Gm23927-201ENSMUST00000082466 215 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 Olfr519-201ENSMUST00000084752 960 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 Gml2-201ENSMUST00000096399 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 Arhgap12-202ENSMUST00000077128 4431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 Gucy2f-201ENSMUST00000042530 8122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 Olfr1262-202ENSMUST00000111508 6068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 Zpld1-202ENSMUST00000143914 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 Gm42685-201ENSMUST00000200378 2390 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 Gria2-201ENSMUST00000075316 10371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 Dleu2-207ENSMUST00000182756 3530 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 Aftph-205ENSMUST00000146722 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 Pus10-203ENSMUST00000109525 3177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 Zfy1-202ENSMUST00000189888 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 Olfr351-203ENSMUST00000215137 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 Gm7980-201ENSMUST00000168107 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 Flrt2-201ENSMUST00000057324 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 Vmn1r87-204ENSMUST00000228800 1993 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 Sh2d1b1-201ENSMUST00000179976 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 Gm3604-201ENSMUST00000107989 1677 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 B230217J21Rik-201ENSMUST00000218349 3896 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 Ubtfl1-203ENSMUST00000169398 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 Zc2hc1a-201ENSMUST00000051064 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 Glrx2-204ENSMUST00000129653 3515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 Olfr97-205ENSMUST00000214848 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 Trps1-203ENSMUST00000183421 3446 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 Cbx5-201ENSMUST00000108813 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 4933406F09Rik-204ENSMUST00000181409 2078 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 Olfr984-202ENSMUST00000213858 5186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 AC130827.1-201ENSMUST00000220476 3850 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 Kcnj2-201ENSMUST00000042970 5444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 Fsbp-201ENSMUST00000180239 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 Rnd3-201ENSMUST00000017288 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 Igkv4-79-201ENSMUST00000103342 358 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 Gin1-202ENSMUST00000112842 1037 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 Gm13770-201ENSMUST00000117149 305 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 Zfp286os-201ENSMUST00000128292 713 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 Amy2a1-201ENSMUST00000132353 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 Gm15634-201ENSMUST00000147206 492 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 Gm15956-201ENSMUST00000153352 502 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 Gm23116-201ENSMUST00000158481 67 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 Vmn1r-ps60-201ENSMUST00000173467 852 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 Rpl31-ps23-201ENSMUST00000180440 388 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 Gm21542-201ENSMUST00000182307 993 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 Mir3473g-201ENSMUST00000183494 136 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 2010005H15Rik-202ENSMUST00000187183 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 Gm28616-201ENSMUST00000187344 441 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 Gm7266-201ENSMUST00000187999 405 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 Gm37475-201ENSMUST00000193107 1015 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 Gm3351-201ENSMUST00000193454 505 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 Gm34768-201ENSMUST00000193884 565 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 Gm37196-201ENSMUST00000194762 906 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 Gm18427-201ENSMUST00000195422 515 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 Gm43392-201ENSMUST00000196560 434 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 Ass-ps1-201ENSMUST00000197717 761 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 Igkv12-67-201ENSMUST00000197806 354 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 Gm3970-201ENSMUST00000198001 334 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 S100a14-203ENSMUST00000199538 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 Gm43646-201ENSMUST00000199962 464 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 Rpl7-ps7-201ENSMUST00000200912 799 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 Gm18009-201ENSMUST00000203239 1016 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 Gm44253-201ENSMUST00000203387 628 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 Gm44134-202ENSMUST00000204777 545 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 Gm44607-201ENSMUST00000205611 1090 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 Gm45241-201ENSMUST00000211237 634 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 Gm33728-201ENSMUST00000217285 546 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 AC151904.3-201ENSMUST00000219266 895 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 AC140930.1-201ENSMUST00000221889 389 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 AC122459.2-201ENSMUST00000227099 638 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rps27aP62983 AC154484.2-201ENSMUST00000228359 818 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.1 ms