Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Gm39336-201ENSMUST00000214933 260 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 Gm4057-201ENSMUST00000221407 368 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 CT025598.1-201ENSMUST00000225140 427 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 AC116319.2-201ENSMUST00000228159 984 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 Olfr1354-201ENSMUST00000075859 1095 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 Mup4-201ENSMUST00000075973 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 n-R5-8s1-201ENSMUST00000083988 148 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 Fam183b-202ENSMUST00000094156 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 Mup13-202ENSMUST00000098042 984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 Gm43627-201ENSMUST00000197119 2299 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 Zc2hc1a-201ENSMUST00000051064 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 Cfap70-201ENSMUST00000022348 3469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 Gabrg1-201ENSMUST00000031119 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 Crtam-203ENSMUST00000180872 4443 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 Olfr947-ps1-202ENSMUST00000214936 2168 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 Ube2n-201ENSMUST00000099329 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 Gm5832-201ENSMUST00000121704 1582 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 AC121942.1-201ENSMUST00000224459 2891 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 Cnot4-201ENSMUST00000044163 3337 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 Kdm5d-201ENSMUST00000055032 7974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 BB365896-201ENSMUST00000173978 3000 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 Gm3286-203ENSMUST00000201629 1945 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 Vmn1r196-205ENSMUST00000228557 5790 ntAPPRIS P2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 Hmgn5-201ENSMUST00000033597 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 Ceacam2-202ENSMUST00000064862 3087 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 Alpk2-201ENSMUST00000035548 7249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 Pold3-209ENSMUST00000208670 1716 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 Xkrx-201ENSMUST00000033611 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 Gm5797-201ENSMUST00000100886 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 Mup3-203ENSMUST00000107488 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 Mup6-202ENSMUST00000107520 540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 Gm3149-201ENSMUST00000112779 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 Gm3033-201ENSMUST00000112792 438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 B4galt4-203ENSMUST00000114710 837 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 Gm5387-201ENSMUST00000119776 857 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 Gm13506-201ENSMUST00000120391 1083 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 Olfr1021-ps1-201ENSMUST00000121914 1042 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 Gm13366-201ENSMUST00000122198 970 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 n-R5s19-201ENSMUST00000122793 120 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 Gm9428-201ENSMUST00000127214 769 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 4930405D11Rik-201ENSMUST00000132218 568 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 1700061H18Rik-202ENSMUST00000147221 564 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 Rnf32-211ENSMUST00000168460 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 Sptssb-202ENSMUST00000171529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 Gm21698-201ENSMUST00000178487 666 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 Gm5692-201ENSMUST00000187254 1057 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 Gm28783-201ENSMUST00000188872 359 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 4930433B08Rik-201ENSMUST00000192010 644 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 Gm18660-201ENSMUST00000199542 629 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 Gm44360-201ENSMUST00000200081 82 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 Asb17os-202ENSMUST00000200329 497 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 Gm18290-201ENSMUST00000202900 844 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 AC134333.1-201ENSMUST00000204536 944 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 Gm4548-201ENSMUST00000208487 509 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 Gm8863-201ENSMUST00000216630 926 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 AC159293.2-201ENSMUST00000222289 424 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 Olfr250-201ENSMUST00000052085 996 ntAPPRIS P2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 Olfr309-201ENSMUST00000055690 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 Gm4861-201ENSMUST00000068546 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 Gm23407-201ENSMUST00000082538 91 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 Ube2nl-201ENSMUST00000085228 456 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 Arhgap32-203ENSMUST00000174641 13568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 Lipn-201ENSMUST00000025682 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 Gm43887-201ENSMUST00000204727 3186 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 Gm19084-201ENSMUST00000222939 1762 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 Olfr39-202ENSMUST00000212983 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 Olfr350-202ENSMUST00000214457 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 Gm44045-201ENSMUST00000204906 2520 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 Olfr726-205ENSMUST00000215278 1324 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 Slco1c1-203ENSMUST00000203140 2771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 Ifi206-201ENSMUST00000160565 3047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 A230057D06Rik-201ENSMUST00000208961 3026 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 Gm8267-203ENSMUST00000226900 1592 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 Bbox1-201ENSMUST00000046233 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 Gm44416-201ENSMUST00000204055 2066 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 Vmn2r121-201ENSMUST00000094491 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 Gm2223-201ENSMUST00000112099 1350 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 Vmn1r31-205ENSMUST00000228586 2115 ntAPPRIS P2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 Ifi44-201ENSMUST00000029671 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 Fbxo3-202ENSMUST00000102565 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 9330178D15Rik-201ENSMUST00000196033 3451 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 Armc4-201ENSMUST00000081275 3477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 Gm37735-201ENSMUST00000193995 1406 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 Zfp184-205ENSMUST00000176511 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 Sgms1-209ENSMUST00000142618 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 Olfr10-202ENSMUST00000217290 2776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 Glb1l3-203ENSMUST00000210274 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 Ugt2a2-201ENSMUST00000079811 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 Fam26d-202ENSMUST00000218239 3075 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 Pramel4-203ENSMUST00000094520 2297 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 Gm21778-202ENSMUST00000185926 1482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 A930006L05Rik-201ENSMUST00000186821 2814 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 Gtdc1-203ENSMUST00000112810 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 Adgrl3-203ENSMUST00000117253 4764 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 Gm15354-201ENSMUST00000132019 1772 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 Adam34-202ENSMUST00000212185 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 Sytl5-201ENSMUST00000067529 2301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 Olfr888-202ENSMUST00000211851 2930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 AC122024.1-201ENSMUST00000219276 4850 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 Grik2-207ENSMUST00000218823 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
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