Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Stx19-201ENSMUST00000055557 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Zfp280d-201ENSMUST00000098576 4387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Gm39321-201ENSMUST00000216597 2075 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Alkbh8-204ENSMUST00000211933 7674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Mbnl1-207ENSMUST00000192607 4552 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 BB365896-201ENSMUST00000173978 3000 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 4933411O13Rik-201ENSMUST00000050665 1464 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Olfr736-205ENSMUST00000215263 2255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 AC107232.1-201ENSMUST00000227785 1503 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Gm35842-201ENSMUST00000207859 4464 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 6430511E19Rik-201ENSMUST00000192772 3835 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Gm10295-201ENSMUST00000094315 2525 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 F13b-201ENSMUST00000027615 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Ralgapa2-202ENSMUST00000109986 11030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Slc19a3-203ENSMUST00000164473 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Gm44026-201ENSMUST00000203985 2088 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Vmn2r120-201ENSMUST00000165781 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Trps1-203ENSMUST00000183421 3446 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Scoc-201ENSMUST00000081506 1791 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Mir700-201ENSMUST00000102169 79 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Olfr612-201ENSMUST00000104879 972 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Atp5l2-ps-201ENSMUST00000120130 312 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Gm11679-201ENSMUST00000121830 779 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 2310081O03Rik-201ENSMUST00000128591 759 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Smyd1-204ENSMUST00000129630 376 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Gm25342-201ENSMUST00000157459 122 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Gm8837-201ENSMUST00000161037 1107 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Gm7952-201ENSMUST00000180540 984 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Gm27468-201ENSMUST00000183577 106 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Mir6952-201ENSMUST00000185092 61 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 1700023F02Rik-202ENSMUST00000188279 412 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Olfr1409-ps1-201ENSMUST00000194013 252 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 4930512P04Rik-201ENSMUST00000197000 424 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 4933424M12Rik-202ENSMUST00000203451 1100 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Gm2926-201ENSMUST00000205625 239 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Gm45574-201ENSMUST00000210921 331 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Gm45870-201ENSMUST00000211269 601 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 4933404K13Rik-201ENSMUST00000214651 937 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 1700048P04Rik-201ENSMUST00000219825 369 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 AC211878.5-201ENSMUST00000221697 409 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Gm32526-201ENSMUST00000221878 981 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 AC163631.1-201ENSMUST00000225041 598 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 AC154718.1-201ENSMUST00000226676 250 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 AC114572.1-201ENSMUST00000227262 300 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 AC152394.2-202ENSMUST00000228503 1064 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Olfr313-201ENSMUST00000082220 1074 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Gm10221-201ENSMUST00000088299 309 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Pign-206ENSMUST00000187537 4006 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Nlgn1-201ENSMUST00000075054 4359 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Gm44829-201ENSMUST00000208008 3193 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Xkrx-201ENSMUST00000033611 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Ereg-201ENSMUST00000031324 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Gm6902-201ENSMUST00000179072 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Phospho2-206ENSMUST00000180290 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Gm13544-201ENSMUST00000131189 2940 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Gm26691-202ENSMUST00000181952 4183 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Gm6125-201ENSMUST00000217983 3472 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Gm9314-201ENSMUST00000199881 1528 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 AC158981.2-201ENSMUST00000227565 1537 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Olfr110-202ENSMUST00000216472 1721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Gm37127-201ENSMUST00000192924 3036 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Zbed4-ps2-201ENSMUST00000187003 3448 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Nol8-201ENSMUST00000021824 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Gm39327-201ENSMUST00000213594 1982 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Olfr477-202ENSMUST00000214677 2930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Olfr1330-203ENSMUST00000106361 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 AC153962.3-202ENSMUST00000217778 1412 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Gm18878-201ENSMUST00000223071 1443 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Olfr537-ps1-201ENSMUST00000209871 2792 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Zfp287-206ENSMUST00000185656 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 AC125095.1-201ENSMUST00000228387 2020 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Lrp2bp-203ENSMUST00000110381 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Ncald-202ENSMUST00000116445 858 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Mir1903-201ENSMUST00000122574 80 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Gm22518-201ENSMUST00000158267 68 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Gm23050-201ENSMUST00000158775 165 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Gm26057-201ENSMUST00000178099 165 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Gm23450-201ENSMUST00000178285 91 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Gm26537-201ENSMUST00000181474 652 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Gm27460-201ENSMUST00000184213 100 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Gm5692-201ENSMUST00000187254 1057 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Gm8241-201ENSMUST00000189286 816 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Gm38097-201ENSMUST00000192936 439 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Rrh-205ENSMUST00000196902 1250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Gm31306-201ENSMUST00000197517 508 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Gm44253-201ENSMUST00000203387 628 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Gm44571-201ENSMUST00000208092 533 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Gm45850-201ENSMUST00000212536 338 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Rab7-ps1-201ENSMUST00000213253 622 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 AC118476.1-201ENSMUST00000216237 349 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 CT033754.1-201ENSMUST00000216941 531 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 AC122188.1-201ENSMUST00000217534 312 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 AC079681.1-201ENSMUST00000219437 639 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 AC124826.1-201ENSMUST00000221651 325 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 AC121947.1-201ENSMUST00000221755 1145 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Gm7042-201ENSMUST00000223027 384 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Gm36262-201ENSMUST00000223274 499 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Ctag2-201ENSMUST00000033524 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Gm5612-201ENSMUST00000053326 375 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Gm7887-201ENSMUST00000056948 537 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.8 ms