Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Hipk3-203ENSMUST00000111125 3651 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
P10404 Anxa1-201ENSMUST00000025561 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
P10404 Gm43498-201ENSMUST00000202002 1486 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
P10404 Gm25546-201ENSMUST00000103977 132 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
P10404 Mir465c-2-201ENSMUST00000104757 81 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
P10404 Gm22091-201ENSMUST00000116908 127 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
P10404 A730017C20Rik-203ENSMUST00000118510 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
P10404 Gm13486-201ENSMUST00000119910 282 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
P10404 Gm13489-201ENSMUST00000121234 971 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
P10404 Gm11257-201ENSMUST00000121313 315 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
P10404 Gm13555-201ENSMUST00000121668 319 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
P10404 Gm15367-201ENSMUST00000122398 1016 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
P10404 Gm12823-201ENSMUST00000134494 318 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
P10404 Gm2735-201ENSMUST00000136133 277 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
P10404 Gm2709-201ENSMUST00000142979 350 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
P10404 Gm23740-201ENSMUST00000157385 100 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
P10404 Gm11107-201ENSMUST00000165414 505 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
P10404 Gm17060-201ENSMUST00000172394 824 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
P10404 Gm3454-201ENSMUST00000185571 412 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
P10404 Gm29053-201ENSMUST00000187484 370 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
P10404 Scgb2b8-ps-201ENSMUST00000188661 327 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
P10404 Scgb2b13-ps-201ENSMUST00000190420 328 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
P10404 Gm29369-201ENSMUST00000190674 615 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
P10404 Gm37322-201ENSMUST00000193409 337 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
P10404 Gm33370-201ENSMUST00000195935 489 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
P10404 Gm24826-202ENSMUST00000197298 216 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
P10404 Gm8924-201ENSMUST00000197405 1132 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
P10404 Gm21040-201ENSMUST00000199493 1132 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
P10404 Eif4e-205ENSMUST00000200100 729 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
P10404 Gm7463-201ENSMUST00000201541 547 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
P10404 Olfr1401-ps1-201ENSMUST00000202296 211 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
P10404 Gm31861-201ENSMUST00000204563 672 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
P10404 Olfr587-ps1-202ENSMUST00000209201 477 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
P10404 Gm45282-201ENSMUST00000209439 681 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
P10404 AC122428.4-201ENSMUST00000213494 589 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
P10404 AC158630.1-201ENSMUST00000214387 993 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
P10404 Gm18655-201ENSMUST00000214802 1090 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
P10404 Gm8125-201ENSMUST00000216602 738 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
P10404 Ppp1r36-204ENSMUST00000220187 504 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
P10404 Gm34215-201ENSMUST00000221599 355 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
P10404 AC147245.1-201ENSMUST00000223294 677 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
P10404 CT030238.4-202ENSMUST00000226143 745 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
P10404 AC154324.1-201ENSMUST00000226711 814 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
P10404 AC132317.2-201ENSMUST00000227301 519 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
P10404 AC154484.2-201ENSMUST00000228359 818 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
P10404 Rps26-201ENSMUST00000026420 681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
P10404 Olfr1151-201ENSMUST00000061081 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
P10404 Npm2-201ENSMUST00000062629 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
P10404 Olfr871-201ENSMUST00000073122 1147 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
P10404 Olfr506-201ENSMUST00000077343 1008 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
P10404 Mir129-2-201ENSMUST00000083577 90 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
P10404 Gm24765-201ENSMUST00000083691 103 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
P10404 Mir465c-1-201ENSMUST00000093560 81 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
P10404 Gm10800-201ENSMUST00000099683 660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
P10404 Gm13575-201ENSMUST00000142353 1520 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
P10404 Gm42597-201ENSMUST00000196663 1544 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
P10404 Tdrkh-205ENSMUST00000197495 2476 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
P10404 Olfr1047-202ENSMUST00000216056 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
P10404 Gm8279-202ENSMUST00000165713 1760 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
P10404 Gm5795-203ENSMUST00000171150 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
P10404 AC154597.1-201ENSMUST00000224095 2713 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
P10404 Vmn2r44-201ENSMUST00000166499 3660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
P10404 Impg2-204ENSMUST00000160116 3992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
P10404 1810046K07Rik-201ENSMUST00000039959 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
P10404 Bbx-205ENSMUST00000114488 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
P10404 Dcdc5-202ENSMUST00000122388 4957 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
P10404 5430427O19Rik-201ENSMUST00000113976 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
P10404 Vmn2r-ps139-201ENSMUST00000190764 2057 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
P10404 Ampd1-201ENSMUST00000090715 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
P10404 Birc6-223ENSMUST00000183224 14562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
P10404 Gm12511-201ENSMUST00000135987 1603 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
P10404 Gm26745-201ENSMUST00000181022 1874 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
P10404 Gm10845-202ENSMUST00000228217 3389 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
P10404 Nmrk1-201ENSMUST00000042392 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
P10404 Prokr2-204ENSMUST00000142766 3932 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
P10404 Slc6a14-201ENSMUST00000033414 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
P10404 Zgrf1-201ENSMUST00000043108 7046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
P10404 Gm28798-201ENSMUST00000186372 2161 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
P10404 Dcaf1-203ENSMUST00000161758 5539 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
P10404 Olfr701-202ENSMUST00000166880 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
P10404 Nr6a1-210ENSMUST00000168098 5877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
P10404 Coro2a-203ENSMUST00000107757 4124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
P10404 Tank-205ENSMUST00000112502 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
P10404 Tank-201ENSMUST00000078074 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
P10404 Vmn2r11-201ENSMUST00000164875 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
P10404 Vmn1r10-202ENSMUST00000228270 2084 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
P10404 Il13ra2-202ENSMUST00000112827 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
P10404 Olfr826-202ENSMUST00000203720 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
P10404 Phtf1-204ENSMUST00000117150 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
P10404 Gm23692-201ENSMUST00000101881 160 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
P10404 Gm25631-201ENSMUST00000104390 130 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
P10404 Gm13103-202ENSMUST00000105768 994 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
P10404 Fancl-202ENSMUST00000109509 1187 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
P10404 Gm15108-201ENSMUST00000116160 803 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
P10404 Serpina3h-202ENSMUST00000116393 1226 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
P10404 Gm15715-201ENSMUST00000118032 283 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
P10404 Gm9085-201ENSMUST00000119994 1072 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
P10404 Gm15586-201ENSMUST00000121218 528 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
P10404 Olfr1017-ps1-201ENSMUST00000121263 664 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
P10404 Gm14366-201ENSMUST00000121970 730 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.4 ms