Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Gm15274-201ENSMUST00000131442 291 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Smim18J3QNP2 Gm13134-201ENSMUST00000132106 738 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Smim18J3QNP2 Olfr377-ps1-201ENSMUST00000134011 1136 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Smim18J3QNP2 Gm21979-201ENSMUST00000139887 291 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Smim18J3QNP2 Gm13373-201ENSMUST00000144634 655 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Smim18J3QNP2 Gm15843-201ENSMUST00000146593 529 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Smim18J3QNP2 1700073E17Rik-203ENSMUST00000148424 741 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Smim18J3QNP2 Gm15259-201ENSMUST00000151262 291 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Smim18J3QNP2 Gm25487-201ENSMUST00000158725 125 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Smim18J3QNP2 Gm3091-201ENSMUST00000163408 484 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Smim18J3QNP2 Gm6541-201ENSMUST00000165542 561 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Smim18J3QNP2 Csnk2b-209ENSMUST00000174779 632 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Smim18J3QNP2 4930521E06Rik-201ENSMUST00000186732 905 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Smim18J3QNP2 Gm28179-202ENSMUST00000189029 327 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Smim18J3QNP2 Gm28835-202ENSMUST00000189206 543 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Smim18J3QNP2 Gm28532-201ENSMUST00000190408 572 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Smim18J3QNP2 Gm32102-201ENSMUST00000196885 241 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Smim18J3QNP2 Fbxw27-201ENSMUST00000197125 810 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Smim18J3QNP2 Gm31887-201ENSMUST00000197661 501 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Smim18J3QNP2 Gm17660-203ENSMUST00000198485 522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Smim18J3QNP2 5033403H07Rik-203ENSMUST00000198580 467 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Smim18J3QNP2 Gm8190-201ENSMUST00000199603 586 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Smim18J3QNP2 Gm44539-201ENSMUST00000206010 238 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Smim18J3QNP2 4930513N20Rik-201ENSMUST00000207466 1265 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Smim18J3QNP2 Gm45185-201ENSMUST00000207556 404 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Smim18J3QNP2 Gm6230-201ENSMUST00000208077 780 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Smim18J3QNP2 Gm9604-201ENSMUST00000211175 433 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Smim18J3QNP2 AC153801.1-201ENSMUST00000217904 947 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Smim18J3QNP2 Gm4057-201ENSMUST00000221407 368 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Smim18J3QNP2 Selenok-ps8-201ENSMUST00000221926 280 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Smim18J3QNP2 AC157571.1-201ENSMUST00000222014 520 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Smim18J3QNP2 Gm6575-201ENSMUST00000222946 697 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Smim18J3QNP2 AC154361.1-201ENSMUST00000225694 745 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Smim18J3QNP2 Gm5229-201ENSMUST00000039375 354 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Smim18J3QNP2 Ppih-201ENSMUST00000056458 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Smim18J3QNP2 Olfr1451-201ENSMUST00000063144 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Smim18J3QNP2 Ly6c1-201ENSMUST00000065408 844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Smim18J3QNP2 Gm4861-201ENSMUST00000068546 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Smim18J3QNP2 Olfr190-201ENSMUST00000071243 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Smim18J3QNP2 Mup13-201ENSMUST00000072678 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Smim18J3QNP2 Vmn1r178-201ENSMUST00000078593 915 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Smim18J3QNP2 mt-Nd2-201ENSMUST00000082396 1038 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Smim18J3QNP2 n-R5s169-201ENSMUST00000083110 120 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Smim18J3QNP2 Olfr18-201ENSMUST00000086473 1156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Smim18J3QNP2 Olfr671-202ENSMUST00000210963 3157 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Smim18J3QNP2 Vmn1r87-204ENSMUST00000228800 1993 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Smim18J3QNP2 Gm42548-201ENSMUST00000202669 3933 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Smim18J3QNP2 Naalad2-207ENSMUST00000172171 4066 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Smim18J3QNP2 Gm37357-201ENSMUST00000192386 3123 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Smim18J3QNP2 Gm44751-201ENSMUST00000208302 4387 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Smim18J3QNP2 Zfp638-220ENSMUST00000204751 9033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Smim18J3QNP2 Olfr1263-202ENSMUST00000214382 4400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Smim18J3QNP2 Olfr535-203ENSMUST00000213715 5033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Smim18J3QNP2 Ccnb3-201ENSMUST00000056725 4475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Smim18J3QNP2 Olfr178-202ENSMUST00000206523 2095 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Smim18J3QNP2 Serpina3b-201ENSMUST00000085052 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Smim18J3QNP2 Olfr198-202ENSMUST00000208244 2200 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Smim18J3QNP2 Zranb1-205ENSMUST00000215716 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Smim18J3QNP2 Ptprd-201ENSMUST00000050757 4698 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Smim18J3QNP2 Nlrp1b-203ENSMUST00000108515 4131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Smim18J3QNP2 Cts6-201ENSMUST00000021890 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Smim18J3QNP2 Olfr826-202ENSMUST00000203720 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Smim18J3QNP2 Olfr821-202ENSMUST00000205181 1993 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Smim18J3QNP2 Gnal-202ENSMUST00000076605 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Smim18J3QNP2 Gm4070-201ENSMUST00000106766 8795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Smim18J3QNP2 Gvin1-201ENSMUST00000006667 8795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Smim18J3QNP2 Rpl36a-201ENSMUST00000113211 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Smim18J3QNP2 B4galt4-203ENSMUST00000114710 837 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Smim18J3QNP2 Gm7058-201ENSMUST00000119209 902 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Smim18J3QNP2 Vmn1r-ps103-201ENSMUST00000120171 893 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Smim18J3QNP2 Gm11415-201ENSMUST00000128214 480 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Smim18J3QNP2 8430419K02Rik-201ENSMUST00000128654 1870 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Smim18J3QNP2 Gm14401-204ENSMUST00000134614 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Smim18J3QNP2 Gm16113-201ENSMUST00000159629 372 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Smim18J3QNP2 Ighv1-62-2-201ENSMUST00000163467 302 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Smim18J3QNP2 Vmn1r101-201ENSMUST00000164245 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Smim18J3QNP2 Vmn1r119-201ENSMUST00000164683 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Smim18J3QNP2 Vmn1r149-201ENSMUST00000165916 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Smim18J3QNP2 Ighv1-71-201ENSMUST00000166645 302 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Smim18J3QNP2 Zscan4e-201ENSMUST00000166753 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Smim18J3QNP2 Snrpe-204ENSMUST00000166915 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Smim18J3QNP2 Gm44501-201ENSMUST00000167713 1229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Smim18J3QNP2 Gm4187-201ENSMUST00000172551 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Smim18J3QNP2 Gm4133-201ENSMUST00000172989 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Smim18J3QNP2 Gm11168-203ENSMUST00000178348 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Smim18J3QNP2 Pea15b-201ENSMUST00000182806 387 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Smim18J3QNP2 Mir6415-201ENSMUST00000184064 100 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Smim18J3QNP2 Gm28846-201ENSMUST00000189161 368 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Smim18J3QNP2 Gm26672-203ENSMUST00000192501 756 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Smim18J3QNP2 Gm36965-201ENSMUST00000193797 394 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Smim18J3QNP2 Obox4-ps5-201ENSMUST00000196368 397 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Smim18J3QNP2 Gm44342-201ENSMUST00000196874 129 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Smim18J3QNP2 Obox4-ps4-201ENSMUST00000196934 397 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Smim18J3QNP2 Gm20940-201ENSMUST00000197308 360 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Smim18J3QNP2 S100a6-203ENSMUST00000198128 464 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Smim18J3QNP2 Gm43148-201ENSMUST00000198237 520 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Smim18J3QNP2 Gm44383-201ENSMUST00000198940 129 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Smim18J3QNP2 Obox4-ps10-201ENSMUST00000199376 504 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Smim18J3QNP2 Cep57l1-201ENSMUST00000019951 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Smim18J3QNP2 AC099934.1-201ENSMUST00000200493 79 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms