Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Cx3cr1-203ENSMUST00000215016 4493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccdc180J3QNE4 Trmt10a-206ENSMUST00000162864 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccdc180J3QNE4 Olfr472-203ENSMUST00000216937 5392 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccdc180J3QNE4 Slc17a2-201ENSMUST00000006786 4629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccdc180J3QNE4 Bnc2-201ENSMUST00000102820 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccdc180J3QNE4 Gm26873-201ENSMUST00000181390 2368 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccdc180J3QNE4 Map7d3-201ENSMUST00000114766 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccdc180J3QNE4 Gm13084-202ENSMUST00000105769 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccdc180J3QNE4 Gm8358-201ENSMUST00000167222 555 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccdc180J3QNE4 Gm23872-201ENSMUST00000175432 77 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccdc180J3QNE4 Gm5849-201ENSMUST00000180151 351 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccdc180J3QNE4 Gm27039-201ENSMUST00000182438 962 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccdc180J3QNE4 Gm43262-201ENSMUST00000202970 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccdc180J3QNE4 Gm44108-201ENSMUST00000203525 422 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccdc180J3QNE4 Gm18591-201ENSMUST00000220568 763 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccdc180J3QNE4 Pik3c2g-201ENSMUST00000032353 1206 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccdc180J3QNE4 Gm30340-201ENSMUST00000191898 2198 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccdc180J3QNE4 Olfr527-202ENSMUST00000214143 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccdc180J3QNE4 Synrg-208ENSMUST00000183714 3651 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccdc180J3QNE4 Brd8-203ENSMUST00000115765 3869 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccdc180J3QNE4 Mttp-202ENSMUST00000098580 3072 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccdc180J3QNE4 Olfr462-203ENSMUST00000213928 5598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccdc180J3QNE4 Ddx58-201ENSMUST00000037907 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccdc180J3QNE4 Cdh17-201ENSMUST00000029871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccdc180J3QNE4 AC121094.1-201ENSMUST00000224766 1345 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccdc180J3QNE4 CT033783.1-201ENSMUST00000220881 2884 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc180J3QNE4 Gm7969-201ENSMUST00000221347 2884 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc180J3QNE4 CT033783.2-201ENSMUST00000222807 2884 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc180J3QNE4 Crtam-203ENSMUST00000180872 4443 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc180J3QNE4 Gm42607-201ENSMUST00000200221 3393 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc180J3QNE4 Akap4-203ENSMUST00000115751 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc180J3QNE4 Gm11376-201ENSMUST00000144541 231 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc180J3QNE4 C030037F17Rik-201ENSMUST00000155211 406 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc180J3QNE4 Bhlhe40-202ENSMUST00000163617 476 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc180J3QNE4 Gng12-208ENSMUST00000204511 739 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc180J3QNE4 Gm45908-201ENSMUST00000212977 1177 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc180J3QNE4 Olfr697-202ENSMUST00000217734 1190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc180J3QNE4 Olfr1126-201ENSMUST00000071355 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc180J3QNE4 Vmn1r46-201ENSMUST00000075797 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc180J3QNE4 Mrgprb3-201ENSMUST00000094383 1009 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc180J3QNE4 Fryl-202ENSMUST00000101127 11340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc180J3QNE4 Ncoa7-208ENSMUST00000215926 2875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc180J3QNE4 Smc2-202ENSMUST00000117280 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc180J3QNE4 Vmn2r28-201ENSMUST00000086297 3785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc180J3QNE4 Eya4-202ENSMUST00000092665 5304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc180J3QNE4 Gm24429-201ENSMUST00000104076 132 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc180J3QNE4 Cypt1-202ENSMUST00000115422 661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc180J3QNE4 Gm2199-201ENSMUST00000119065 874 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc180J3QNE4 Gm13488-201ENSMUST00000120419 179 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc180J3QNE4 Gm25430-201ENSMUST00000157614 289 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc180J3QNE4 Gm7609-204ENSMUST00000161424 461 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc180J3QNE4 Gm4831-201ENSMUST00000174626 594 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc180J3QNE4 Gm8669-201ENSMUST00000183839 945 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc180J3QNE4 Gm38040-201ENSMUST00000193505 225 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc180J3QNE4 Gm32051-201ENSMUST00000196818 709 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc180J3QNE4 Prl3d1-201ENSMUST00000082079 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ccdc180J3QNE4 Dock2-201ENSMUST00000093193 6409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccdc180J3QNE4 Gm45112-201ENSMUST00000208576 5125 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccdc180J3QNE4 Gm43361-201ENSMUST00000196562 4690 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccdc180J3QNE4 Gm13089-201ENSMUST00000073532 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccdc180J3QNE4 C530050E15Rik-201ENSMUST00000181373 3837 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccdc180J3QNE4 Ccdc82-201ENSMUST00000110583 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccdc180J3QNE4 Vmn2r99-201ENSMUST00000176107 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccdc180J3QNE4 Gm20075-201ENSMUST00000220449 2161 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccdc180J3QNE4 Nxpe4-203ENSMUST00000216998 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccdc180J3QNE4 Gm26514-201ENSMUST00000181087 4231 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccdc180J3QNE4 AC125487.2-201ENSMUST00000219810 1300 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccdc180J3QNE4 Gm38062-201ENSMUST00000192541 1856 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccdc180J3QNE4 AC159002.2-201ENSMUST00000228843 4874 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccdc180J3QNE4 Zfand6-201ENSMUST00000069537 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccdc180J3QNE4 Vmn2r-ps54-205ENSMUST00000182110 2587 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccdc180J3QNE4 Prl8a6-203ENSMUST00000110355 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccdc180J3QNE4 Gm15754-201ENSMUST00000119191 478 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccdc180J3QNE4 Gm24860-201ENSMUST00000158457 276 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccdc180J3QNE4 Gm20453-201ENSMUST00000173968 226 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccdc180J3QNE4 1500004A13Rik-206ENSMUST00000184170 576 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccdc180J3QNE4 Gm37070-201ENSMUST00000193272 460 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccdc180J3QNE4 AC117240.2-201ENSMUST00000220921 263 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccdc180J3QNE4 Prl8a6-202ENSMUST00000080762 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccdc180J3QNE4 AC154755.2-201ENSMUST00000224384 2857 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccdc180J3QNE4 Gm45358-201ENSMUST00000209492 2305 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccdc180J3QNE4 Olfr684-202ENSMUST00000215552 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccdc180J3QNE4 Olfr684-204ENSMUST00000217136 3182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccdc180J3QNE4 Olfr25-202ENSMUST00000212354 1362 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ccdc180J3QNE4 Spata6-203ENSMUST00000084354 2239 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccdc180J3QNE4 Pard3-212ENSMUST00000160717 4214 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccdc180J3QNE4 Rsrc2-210ENSMUST00000182489 1665 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccdc180J3QNE4 Fam205c-201ENSMUST00000055944 1655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccdc180J3QNE4 Gm43175-201ENSMUST00000198450 3810 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccdc180J3QNE4 Etl4-209ENSMUST00000114627 7413 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccdc180J3QNE4 Cnr1-202ENSMUST00000084736 5761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccdc180J3QNE4 Csta1-201ENSMUST00000096090 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccdc180J3QNE4 Olfr870-202ENSMUST00000215984 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccdc180J3QNE4 Prl2b1-202ENSMUST00000102954 870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccdc180J3QNE4 Crem-224ENSMUST00000147138 436 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccdc180J3QNE4 Mir7687-201ENSMUST00000184722 59 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccdc180J3QNE4 Gm37421-201ENSMUST00000193088 132 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccdc180J3QNE4 Gm44840-201ENSMUST00000208983 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccdc180J3QNE4 Gm45525-201ENSMUST00000210800 389 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ccdc180J3QNE4 Gm18541-201ENSMUST00000215935 538 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.3 ms