Protein–RNA interactions for Protein: E9PXC0

Srp54b, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54bE9PXC0 4930402F06Rik-201ENSMUST00000113009 1150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Srp54bE9PXC0 Mir466j-201ENSMUST00000116876 122 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Srp54bE9PXC0 Olfr360-201ENSMUST00000120704 954 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Srp54bE9PXC0 Gm12293-201ENSMUST00000121898 590 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Srp54bE9PXC0 Apol7d-203ENSMUST00000126516 1193 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Srp54bE9PXC0 Gm12147-201ENSMUST00000144024 182 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Srp54bE9PXC0 Gm25152-201ENSMUST00000157117 114 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Srp54bE9PXC0 Gm24685-201ENSMUST00000157764 285 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Srp54bE9PXC0 Olfr102-201ENSMUST00000169373 1027 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Srp54bE9PXC0 Gm17711-201ENSMUST00000172028 237 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Srp54bE9PXC0 Gm29594-201ENSMUST00000191181 398 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Srp54bE9PXC0 Gm18865-201ENSMUST00000193011 1171 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Srp54bE9PXC0 A330069K06Rik-201ENSMUST00000194077 917 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Srp54bE9PXC0 Gm37220-201ENSMUST00000195179 415 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Srp54bE9PXC0 Gm37358-201ENSMUST00000195492 479 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Srp54bE9PXC0 Gm2287-202ENSMUST00000199619 1000 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Srp54bE9PXC0 Gm19060-201ENSMUST00000201959 421 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Srp54bE9PXC0 Gm43456-201ENSMUST00000202519 457 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Srp54bE9PXC0 Gm5886-202ENSMUST00000203957 522 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Srp54bE9PXC0 1700110I07Rik-201ENSMUST00000205487 726 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Srp54bE9PXC0 Cyp2b27-ps-201ENSMUST00000205582 1279 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Srp54bE9PXC0 Gm6477-201ENSMUST00000217098 764 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Srp54bE9PXC0 Gm46192-201ENSMUST00000217894 326 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Srp54bE9PXC0 AC164618.3-201ENSMUST00000224863 681 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Srp54bE9PXC0 AC170999.2-201ENSMUST00000226223 264 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Srp54bE9PXC0 AC157572.4-201ENSMUST00000228203 549 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Srp54bE9PXC0 AC136376.1-201ENSMUST00000228496 950 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Srp54bE9PXC0 AC122035.2-201ENSMUST00000228698 462 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Srp54bE9PXC0 Cox7b-201ENSMUST00000033582 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Srp54bE9PXC0 Olfr934-201ENSMUST00000074211 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Srp54bE9PXC0 Gm8412-201ENSMUST00000077493 440 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Srp54bE9PXC0 n-R5s69-201ENSMUST00000083872 119 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Srp54bE9PXC0 Olfr678-201ENSMUST00000098160 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Srp54bE9PXC0 Defa31-201ENSMUST00000098896 377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Srp54bE9PXC0 Olfr201-201ENSMUST00000099656 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Srp54bE9PXC0 Olfr1016-201ENSMUST00000099915 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Srp54bE9PXC0 Baz2b-202ENSMUST00000112550 7895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Srp54bE9PXC0 Olfr753-ps1-203ENSMUST00000208970 2764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Srp54bE9PXC0 Vmn1r87-204ENSMUST00000228800 1993 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Srp54bE9PXC0 Olfr984-204ENSMUST00000217536 5114 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Srp54bE9PXC0 Mpeg1-201ENSMUST00000081035 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Srp54bE9PXC0 Rapgef6-204ENSMUST00000108894 3475 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Srp54bE9PXC0 Ube4a-202ENSMUST00000117549 3415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Srp54bE9PXC0 Olfr1215-203ENSMUST00000216271 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Srp54bE9PXC0 Amd2-201ENSMUST00000080898 3218 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Srp54bE9PXC0 Vmn1r37-204ENSMUST00000226974 1770 ntAPPRIS P2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Srp54bE9PXC0 Fstl5-203ENSMUST00000160261 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Srp54bE9PXC0 Gm16751-201ENSMUST00000142212 1685 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Srp54bE9PXC0 Itih4-204ENSMUST00000168782 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Srp54bE9PXC0 5830444B04Rik-204ENSMUST00000166921 2870 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Srp54bE9PXC0 Clec4a1-201ENSMUST00000060484 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Srp54bE9PXC0 Smarca2-203ENSMUST00000112637 1962 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Srp54bE9PXC0 Olfr237-ps1-203ENSMUST00000216411 4115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Srp54bE9PXC0 Dnah2-201ENSMUST00000035539 13569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Srp54bE9PXC0 Gm7205-201ENSMUST00000196032 1323 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Srp54bE9PXC0 Gm13261-201ENSMUST00000137351 1020 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Srp54bE9PXC0 Gm16085-201ENSMUST00000144575 453 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Srp54bE9PXC0 Gm23224-201ENSMUST00000158122 271 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Srp54bE9PXC0 Gm17044-201ENSMUST00000168549 828 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Srp54bE9PXC0 Vmn1r-ps80-201ENSMUST00000174838 966 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Srp54bE9PXC0 Pantr1-203ENSMUST00000176154 514 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Srp54bE9PXC0 Vmn2r-ps4-201ENSMUST00000176989 1015 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Srp54bE9PXC0 Gm9480-201ENSMUST00000198038 616 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Srp54bE9PXC0 Gm44296-201ENSMUST00000204689 681 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Srp54bE9PXC0 Olfr1353-202ENSMUST00000204849 1015 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Srp54bE9PXC0 Olfr162-ps1-201ENSMUST00000206015 934 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Srp54bE9PXC0 Gm5027-201ENSMUST00000206700 375 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Srp54bE9PXC0 H60c-203ENSMUST00000216211 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Srp54bE9PXC0 AC132474.2-201ENSMUST00000217414 573 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Srp54bE9PXC0 CT030170.4-202ENSMUST00000221109 540 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Srp54bE9PXC0 AC123658.1-201ENSMUST00000228364 867 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Srp54bE9PXC0 AC166369.2-201ENSMUST00000228403 308 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Srp54bE9PXC0 Ssxb2-201ENSMUST00000023931 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Srp54bE9PXC0 Tas2r108-201ENSMUST00000038750 1013 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Srp54bE9PXC0 2310079G19Rik-201ENSMUST00000052337 881 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Srp54bE9PXC0 Gm3476-202ENSMUST00000167913 1759 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Srp54bE9PXC0 Gm3149-202ENSMUST00000171810 1759 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Srp54bE9PXC0 Gm16170-201ENSMUST00000156882 3754 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Srp54bE9PXC0 Enox2-209ENSMUST00000167659 3632 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Srp54bE9PXC0 Il21-201ENSMUST00000029273 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Srp54bE9PXC0 Vmn1r77-202ENSMUST00000226525 8252 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Srp54bE9PXC0 Zfp106-211ENSMUST00000171215 6391 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Srp54bE9PXC0 Gm13057-201ENSMUST00000105776 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Srp54bE9PXC0 Il1rapl2-201ENSMUST00000075471 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Srp54bE9PXC0 Olfr651-203ENSMUST00000216904 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
Srp54bE9PXC0 Fkbp15-202ENSMUST00000084528 3329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Srp54bE9PXC0 Gm6145-206ENSMUST00000211251 2850 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
Srp54bE9PXC0 Gm37926-201ENSMUST00000191922 2424 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
Srp54bE9PXC0 Gabrp-201ENSMUST00000020366 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Srp54bE9PXC0 Trpm3-203ENSMUST00000087576 6740 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Srp54bE9PXC0 Gm38096-201ENSMUST00000193692 2389 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
Srp54bE9PXC0 Ncf2-202ENSMUST00000186568 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Srp54bE9PXC0 Etv1-202ENSMUST00000159334 3981 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Srp54bE9PXC0 Olfr419-202ENSMUST00000214725 2685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Srp54bE9PXC0 Gm44827-201ENSMUST00000207963 2229 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Srp54bE9PXC0 Agl-201ENSMUST00000040603 9625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Srp54bE9PXC0 Gm10295-201ENSMUST00000094315 2525 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Srp54bE9PXC0 Gm44530-201ENSMUST00000207920 3559 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Srp54bE9PXC0 Gm20750-201ENSMUST00000194274 3515 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Srp54bE9PXC0 Gm156-202ENSMUST00000118532 2000 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 126.9 ms