Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Gm28576-201ENSMUST00000189007 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Gm29011-201ENSMUST00000191059 712 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Oaz3-201ENSMUST00000191506 732 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Gm36994-201ENSMUST00000192941 492 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 A330069K06Rik-201ENSMUST00000194077 917 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Gm37358-201ENSMUST00000195492 479 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Gm43037-201ENSMUST00000196808 250 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Gm42961-201ENSMUST00000202023 181 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Gm17988-201ENSMUST00000208796 535 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Nxpe1-ps-203ENSMUST00000210879 822 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Olfr628-202ENSMUST00000218266 951 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Gm1000-201ENSMUST00000220520 801 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Gm3785-201ENSMUST00000221000 202 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Gm7550-201ENSMUST00000223334 282 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Sh3kbp1-202ENSMUST00000080394 2980 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Mir143-201ENSMUST00000083511 63 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Olfr243-201ENSMUST00000098194 951 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Olfr204-202ENSMUST00000216261 5371 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 AC120375.1-201ENSMUST00000227034 3612 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Gm2539-201ENSMUST00000180720 2411 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Ccr9-203ENSMUST00000166236 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Gm38096-201ENSMUST00000193692 2389 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Naip6-201ENSMUST00000042220 6705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 AC105407.2-201ENSMUST00000223707 3911 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Fbxw27-208ENSMUST00000212725 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 AC154841.1-201ENSMUST00000227263 1479 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Olfr1301-202ENSMUST00000207590 4820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Sri-202ENSMUST00000088786 2504 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Psd3-201ENSMUST00000038959 11319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Rabep1-207ENSMUST00000178245 2460 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Olfr1386-203ENSMUST00000213674 2457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 AC159308.1-201ENSMUST00000216615 1351 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Gm37485-201ENSMUST00000192326 2953 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Gm12051-201ENSMUST00000147771 1341 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Gm33594-201ENSMUST00000209502 1333 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Ighv1-64-201ENSMUST00000103535 405 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Fpr3-202ENSMUST00000115565 1220 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Gm649-201ENSMUST00000117284 1054 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Gm16423-201ENSMUST00000120078 947 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Gm13338-201ENSMUST00000120235 361 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Rhox3b-ps-201ENSMUST00000121045 868 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Gm14695-201ENSMUST00000121721 282 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Gm4764-201ENSMUST00000130207 1233 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
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Grik3B1AS29 Gm2012-202ENSMUST00000163263 892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Gm6121-202ENSMUST00000167438 893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
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Grik3B1AS29 Gm27255-201ENSMUST00000184303 529 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Mir7008-201ENSMUST00000184398 63 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
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Grik3B1AS29 Gm37958-201ENSMUST00000193131 430 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Gm2287-202ENSMUST00000199619 1000 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
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Grik3B1AS29 AC132232.1-201ENSMUST00000214667 1019 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
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Grik3B1AS29 AC159297.1-201ENSMUST00000218689 290 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 AC105169.1-201ENSMUST00000218912 1294 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Gm6068-201ENSMUST00000222270 387 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Fpr3-201ENSMUST00000054871 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
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Grik3B1AS29 Defa17-201ENSMUST00000079528 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Gm23737-201ENSMUST00000082547 159 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 n-R5s69-201ENSMUST00000083872 119 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Hephl1-201ENSMUST00000159985 5261 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Gm45426-201ENSMUST00000209393 3672 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Hnmt-201ENSMUST00000051416 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Mtus1-205ENSMUST00000118835 6426 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
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Grik3B1AS29 D830032E09Rik-202ENSMUST00000189497 1632 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Ppig-202ENSMUST00000090858 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
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Grik3B1AS29 Smarca2-203ENSMUST00000112637 1962 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Myo3b-201ENSMUST00000060208 6256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Rsph4a-201ENSMUST00000169670 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Olfr1505-203ENSMUST00000216835 3685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Nlrp4a-202ENSMUST00000119386 3215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 1700019D03Rik-203ENSMUST00000114493 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Casp8ap2-205ENSMUST00000178925 6557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Slc22a29-205ENSMUST00000222533 1473 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 C230099D08Rik-201ENSMUST00000215772 2727 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Gm7108-201ENSMUST00000118038 3407 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Olfr527-203ENSMUST00000214858 3362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Arhgef38-202ENSMUST00000147041 6541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Gm37429-201ENSMUST00000193807 1799 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Plekhg1-201ENSMUST00000042438 7190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Galnt13-201ENSMUST00000068595 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Bclaf1-203ENSMUST00000185800 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Pifo-201ENSMUST00000010280 956 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Gm15238-201ENSMUST00000119938 1296 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Crem-206ENSMUST00000124747 973 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Fundc1-203ENSMUST00000142638 597 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Gm23280-201ENSMUST00000157905 139 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Vmn1r91-201ENSMUST00000165330 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Lsm5-203ENSMUST00000176595 274 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Gm498-203ENSMUST00000179036 990 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Gm16531-201ENSMUST00000180658 967 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Gm29395-201ENSMUST00000188551 1049 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
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