Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 AC121997.2-202ENSMUST00000227158 939 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Scrg1-201ENSMUST00000034023 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Cr2-201ENSMUST00000043104 1044 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Olfr192-201ENSMUST00000080251 925 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Olfr473-201ENSMUST00000084761 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Ndufa9-201ENSMUST00000088194 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm3512-201ENSMUST00000090663 441 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Olfr1162-201ENSMUST00000099837 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gdap10-201ENSMUST00000180613 5003 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Cept1-201ENSMUST00000039153 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Tgtp1-201ENSMUST00000068063 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Creb5-212ENSMUST00000205120 7482 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Abcc9-201ENSMUST00000073173 7433 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Virma-203ENSMUST00000108307 6571 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Irgm2-202ENSMUST00000108836 3459 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Irgm2-201ENSMUST00000058704 3470 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm13102-202ENSMUST00000097800 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Etnppl-201ENSMUST00000072271 4468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm43498-201ENSMUST00000202002 1486 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 4921539E11Rik-201ENSMUST00000030245 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Ckap5-202ENSMUST00000099716 6574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm37945-201ENSMUST00000192536 4367 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm30075-201ENSMUST00000205509 3005 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 AC160029.1-201ENSMUST00000219628 2678 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Il18bp-201ENSMUST00000094134 1311 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Zfp748-202ENSMUST00000181892 5293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 A330023F24Rik-202ENSMUST00000181273 4217 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Erc2-208ENSMUST00000210924 4871 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Olfr1396-204ENSMUST00000215553 4237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 AC122024.1-201ENSMUST00000219276 4850 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Sp110-201ENSMUST00000093508 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Rps15a-201ENSMUST00000106588 640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Spata17-202ENSMUST00000110945 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Rhox3c-201ENSMUST00000115188 1053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm14837-201ENSMUST00000119688 206 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm14986-201ENSMUST00000121262 1002 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm14728-201ENSMUST00000122196 492 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 4930415H17Rik-201ENSMUST00000122396 123 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm22478-201ENSMUST00000122570 154 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm13480-201ENSMUST00000125095 1000 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm11657-201ENSMUST00000137175 337 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 4933431E20Rik-206ENSMUST00000138472 483 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Bloc1s6os-201ENSMUST00000150154 696 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm5611-201ENSMUST00000164523 852 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Mir6411-201ENSMUST00000183556 108 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm28560-201ENSMUST00000186091 315 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm28334-201ENSMUST00000186653 315 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 1810041H14Rik-203ENSMUST00000187773 416 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm28495-201ENSMUST00000188452 315 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm28232-201ENSMUST00000188683 315 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm28481-201ENSMUST00000189231 315 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm29059-201ENSMUST00000191534 315 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm37765-201ENSMUST00000192395 315 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm37237-201ENSMUST00000192893 315 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm36968-201ENSMUST00000193737 315 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm7897-201ENSMUST00000193981 554 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm38290-201ENSMUST00000195238 315 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm42958-201ENSMUST00000197595 318 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm43346-201ENSMUST00000198290 685 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm21040-201ENSMUST00000199493 1132 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm5154-201ENSMUST00000203971 399 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Olfr451-ps1-201ENSMUST00000205127 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm35520-201ENSMUST00000209235 784 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm32975-201ENSMUST00000211651 584 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm31659-201ENSMUST00000211989 481 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm35998-201ENSMUST00000212862 838 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm29154-205ENSMUST00000213325 1112 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 AL603745.1-201ENSMUST00000215473 532 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 AC124399.1-201ENSMUST00000218334 590 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 CT030657.1-201ENSMUST00000222397 378 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 AC124569.1-201ENSMUST00000225932 101 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Morn5-201ENSMUST00000028256 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Tex36-201ENSMUST00000033275 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Tas2r118-201ENSMUST00000062463 900 ntAPPRIS P1 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Rpl35a-ps7-201ENSMUST00000080603 333 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm23452-201ENSMUST00000083327 107 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Rhox3h-201ENSMUST00000096457 1053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Zfp970-201ENSMUST00000099002 794 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Olfr1044-201ENSMUST00000099906 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 BC051142-203ENSMUST00000114175 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Zfp873-201ENSMUST00000105313 1893 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gbp9-201ENSMUST00000031238 4381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Trpm8-204ENSMUST00000171176 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Hipk3-203ENSMUST00000111125 3651 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm3278-201ENSMUST00000164459 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Ice2-201ENSMUST00000034761 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm45290-201ENSMUST00000211177 3890 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Fbln5-203ENSMUST00000222587 2371 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm8279-202ENSMUST00000165713 1760 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm5795-203ENSMUST00000171150 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Poln-201ENSMUST00000042954 2897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Sell-203ENSMUST00000192047 5703 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm31181-201ENSMUST00000217731 2283 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm44704-201ENSMUST00000208963 1990 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Clrn3-201ENSMUST00000053716 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Zc3h11a-204ENSMUST00000191896 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Mfap3-201ENSMUST00000020830 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm20362-201ENSMUST00000204808 2072 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Txndc16-207ENSMUST00000147853 2816 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Rabgef1Q9JM13 Gm25760-201ENSMUST00000103989 132 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 176.9 ms