Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 AC157822.1-201ENSMUST00000196643 80 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Ccdc47Q9D024 1700001N15Rik-201ENSMUST00000199380 482 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Ccdc47Q9D024 Gm18252-202ENSMUST00000214886 409 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Ccdc47Q9D024 AC155941.1-201ENSMUST00000220223 529 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Ccdc47Q9D024 1700019C18Rik-202ENSMUST00000221688 1047 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Ccdc47Q9D024 AC137871.3-201ENSMUST00000226628 225 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Ccdc47Q9D024 Olfr1122-201ENSMUST00000056435 1080 ntAPPRIS P1 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Ccdc47Q9D024 Skint10-202ENSMUST00000068851 493 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Ccdc47Q9D024 Klrc3-201ENSMUST00000071149 715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Ccdc47Q9D024 n-R5s161-201ENSMUST00000083728 114 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Ccdc47Q9D024 Heph-202ENSMUST00000079322 3904 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Ccdc47Q9D024 Gabra3-201ENSMUST00000055966 3662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Ccdc47Q9D024 Spata6-203ENSMUST00000084354 2239 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Ccdc47Q9D024 Ereg-201ENSMUST00000031324 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Ccdc47Q9D024 Enpp2-202ENSMUST00000167541 2664 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Ccdc47Q9D024 Dnah2-202ENSMUST00000108659 13704 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Ccdc47Q9D024 Rapgef6-201ENSMUST00000094536 3372 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Ccdc47Q9D024 Pon3-201ENSMUST00000031773 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Ccdc47Q9D024 AC122355.1-201ENSMUST00000228155 4184 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Ccdc47Q9D024 Adgrg2-203ENSMUST00000112401 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Ccdc47Q9D024 Adgrg2-204ENSMUST00000112402 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Ccdc47Q9D024 Adgrg2-205ENSMUST00000112404 4601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Ccdc47Q9D024 Adgrg2-206ENSMUST00000112405 4634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Ccdc47Q9D024 Fmo9-201ENSMUST00000027843 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Ccdc47Q9D024 Ugt2b34-202ENSMUST00000113333 4312 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.32
Ccdc47Q9D024 Vmn2r120-201ENSMUST00000165781 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Vmn2r98-201ENSMUST00000170424 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Vmn1r71-201ENSMUST00000079113 4996 ntAPPRIS P2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Gm43025-201ENSMUST00000201764 1886 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Olfr2-206ENSMUST00000216375 5828 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Lipn-201ENSMUST00000025682 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Olfr670-202ENSMUST00000214216 3729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Btf3l4-202ENSMUST00000102740 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Mup3-202ENSMUST00000107472 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Gm11423-201ENSMUST00000136051 655 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Gm15691-201ENSMUST00000138626 849 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 1700109G15Rik-201ENSMUST00000150735 384 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Gm16132-201ENSMUST00000159296 598 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Gm20069-201ENSMUST00000178938 545 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Gm7745-201ENSMUST00000182235 973 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Gm31306-201ENSMUST00000197517 508 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Fxyd1-207ENSMUST00000205778 438 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Gm19196-201ENSMUST00000209258 357 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Gm7499-201ENSMUST00000210423 813 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Gm4803-201ENSMUST00000218729 1279 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 AC079681.1-201ENSMUST00000219437 639 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 AC211878.6-201ENSMUST00000221896 358 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Vmn1r89-201ENSMUST00000053008 951 ntAPPRIS P2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 4933411G06Rik-201ENSMUST00000075909 1022 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Clec4b1-201ENSMUST00000077228 674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 mt-Nd6-201ENSMUST00000082419 519 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Olfr657-201ENSMUST00000098171 960 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Dnah14-209ENSMUST00000208001 13696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Zp3r-203ENSMUST00000142416 1835 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Dleu2-207ENSMUST00000182756 3530 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Olfr1416-202ENSMUST00000214928 4838 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Zfp280d-201ENSMUST00000098576 4387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Gm43788-201ENSMUST00000201539 2417 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Oxr1-205ENSMUST00000166917 2509 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Prom1-203ENSMUST00000087441 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Ube2u-201ENSMUST00000092730 1435 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Vmn2r22-201ENSMUST00000170808 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Olfr510-204ENSMUST00000217170 2997 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Gm3259-202ENSMUST00000160045 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Cyp2c40-201ENSMUST00000160476 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 A330076H08Rik-202ENSMUST00000207694 1836 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 C87414-201ENSMUST00000076321 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Olfr447-202ENSMUST00000216408 3185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Phc3-209ENSMUST00000168645 10976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Klhl4-202ENSMUST00000113371 3566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Klhl4-201ENSMUST00000040504 3584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Kcnma1-202ENSMUST00000074983 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 B4galt4-202ENSMUST00000114708 734 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Gm13428-201ENSMUST00000117540 365 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Gm11227-201ENSMUST00000119774 471 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Olfr408-ps1-201ENSMUST00000121710 941 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Gm14237-201ENSMUST00000122080 430 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Gm23430-201ENSMUST00000122490 314 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Gm14343-201ENSMUST00000154524 731 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Gm16146-201ENSMUST00000160306 439 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Tmem258-204ENSMUST00000166412 447 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Gm17511-201ENSMUST00000172206 342 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Vmn2r-ps4-201ENSMUST00000176989 1015 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Gm29482-201ENSMUST00000187845 230 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Gm42886-201ENSMUST00000199214 466 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 AC153729.3-201ENSMUST00000213319 781 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Noxred1-201ENSMUST00000021423 1101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 AC102569.1-204ENSMUST00000222816 793 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 1700013H16Rik-201ENSMUST00000067940 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 n-R5s65-201ENSMUST00000082614 117 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Gm22126-201ENSMUST00000083244 142 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Gm25515-201ENSMUST00000083858 157 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 n-R5s69-201ENSMUST00000083872 119 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Olfr356-201ENSMUST00000095021 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Olfr994-201ENSMUST00000099925 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Obox7-203ENSMUST00000183788 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Gm16751-201ENSMUST00000142212 1685 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Nebl-213ENSMUST00000177966 1690 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Hc-201ENSMUST00000028233 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Ppm1k-201ENSMUST00000042766 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
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