Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Gm37685-201ENSMUST00000193507 2177 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Atg4aQ8C9S8 Olfr237-ps1-203ENSMUST00000216411 4115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Atg4aQ8C9S8 Gm45311-201ENSMUST00000211086 1330 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Atg4aQ8C9S8 Vmn1r37-202ENSMUST00000226311 1305 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Atg4aQ8C9S8 Asap1-205ENSMUST00000175793 4314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Atg4aQ8C9S8 AC131687.1-201ENSMUST00000225931 5446 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Atg4aQ8C9S8 Serpinb3b-201ENSMUST00000086694 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Atg4aQ8C9S8 Gm15233-201ENSMUST00000118747 400 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Atg4aQ8C9S8 Gm11826-201ENSMUST00000118781 438 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Atg4aQ8C9S8 Gm12244-201ENSMUST00000119500 291 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Atg4aQ8C9S8 Gm15747-201ENSMUST00000141216 460 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Atg4aQ8C9S8 B230118H07Rik-209ENSMUST00000160722 931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Atg4aQ8C9S8 Gm10251-201ENSMUST00000178788 384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Atg4aQ8C9S8 Gm27024-201ENSMUST00000182561 755 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Atg4aQ8C9S8 Gm26969-201ENSMUST00000183203 648 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Atg4aQ8C9S8 Mir7072-201ENSMUST00000184542 60 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Atg4aQ8C9S8 Gm27148-201ENSMUST00000185086 160 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Atg4aQ8C9S8 Gm37581-201ENSMUST00000192371 988 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Atg4aQ8C9S8 Gm37436-201ENSMUST00000193842 1085 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Atg4aQ8C9S8 Gm18702-201ENSMUST00000196923 588 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Atg4aQ8C9S8 Gm42619-201ENSMUST00000197564 1136 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Atg4aQ8C9S8 Pomp-203ENSMUST00000201376 383 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Atg4aQ8C9S8 Gm43973-201ENSMUST00000203562 210 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Atg4aQ8C9S8 Cyp2b27-ps-201ENSMUST00000205582 1279 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Atg4aQ8C9S8 Gm8291-201ENSMUST00000209635 1261 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Atg4aQ8C9S8 Gm45525-201ENSMUST00000210800 389 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Atg4aQ8C9S8 Gm34165-201ENSMUST00000222012 1174 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Atg4aQ8C9S8 Gm5087-204ENSMUST00000225820 645 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Atg4aQ8C9S8 AC164597.1-201ENSMUST00000226538 514 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Atg4aQ8C9S8 Snora44-201ENSMUST00000082670 129 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Atg4aQ8C9S8 AC124569.3-201ENSMUST00000224860 1621 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Atg4aQ8C9S8 Zfp59-201ENSMUST00000108331 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Atg4aQ8C9S8 Rgs2-202ENSMUST00000127206 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Atg4aQ8C9S8 Gm37971-201ENSMUST00000193516 3391 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Atg4aQ8C9S8 Gm12784-202ENSMUST00000206001 3739 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Atg4aQ8C9S8 Olfr1080-201ENSMUST00000213185 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Atg4aQ8C9S8 Olfr224-202ENSMUST00000215322 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Atg4aQ8C9S8 Gm37092-201ENSMUST00000193381 1518 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Atg4aQ8C9S8 Psd3-201ENSMUST00000038959 11319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Atg4aQ8C9S8 Trim6-201ENSMUST00000098180 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Atg4aQ8C9S8 Hydin-201ENSMUST00000043141 15783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Atg4aQ8C9S8 Elf1-204ENSMUST00000227192 3765 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Atg4aQ8C9S8 Olfr1359-203ENSMUST00000214435 4425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Atg4aQ8C9S8 Clmn-201ENSMUST00000109936 11866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Atg4aQ8C9S8 AC124516.3-201ENSMUST00000221302 3613 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Atg4aQ8C9S8 Cdk14-201ENSMUST00000030763 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Atg4aQ8C9S8 Gm42725-201ENSMUST00000199296 4193 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Atg4aQ8C9S8 Gm38387-201ENSMUST00000191945 2577 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Atg4aQ8C9S8 Prdm9-206ENSMUST00000167994 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Atg4aQ8C9S8 Ugt8a-203ENSMUST00000198610 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Atg4aQ8C9S8 Rbms3-206ENSMUST00000111773 7908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Atg4aQ8C9S8 AC132852.2-201ENSMUST00000216052 2794 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Atg4aQ8C9S8 Ccdc144b-203ENSMUST00000200469 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Atg4aQ8C9S8 Gm37127-201ENSMUST00000192924 3036 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Atg4aQ8C9S8 Ercc6l-201ENSMUST00000056904 5302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Atg4aQ8C9S8 Gm37023-201ENSMUST00000192895 2426 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Atg4aQ8C9S8 Rnf148-201ENSMUST00000104979 1239 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Atg4aQ8C9S8 Mup6-202ENSMUST00000107520 540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Atg4aQ8C9S8 Hmgn2l6-201ENSMUST00000115986 267 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Atg4aQ8C9S8 Gm9428-201ENSMUST00000127214 769 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Atg4aQ8C9S8 Gm26372-201ENSMUST00000157831 236 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Atg4aQ8C9S8 Gm24343-201ENSMUST00000158708 111 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Atg4aQ8C9S8 Gm16161-201ENSMUST00000162239 290 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Atg4aQ8C9S8 Sbp-205ENSMUST00000183017 700 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Atg4aQ8C9S8 0610031O16Rik-204ENSMUST00000185122 825 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Atg4aQ8C9S8 Gm43078-201ENSMUST00000197222 168 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Atg4aQ8C9S8 Gm7733-201ENSMUST00000199038 919 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Atg4aQ8C9S8 4930519L02Rik-202ENSMUST00000200254 452 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Atg4aQ8C9S8 Gm34066-201ENSMUST00000210156 825 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Atg4aQ8C9S8 AC156802.1-201ENSMUST00000223623 579 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Atg4aQ8C9S8 AC107711.2-203ENSMUST00000227827 762 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Atg4aQ8C9S8 AC154738.7-201ENSMUST00000228606 579 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Atg4aQ8C9S8 Ghrl-201ENSMUST00000064993 527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Atg4aQ8C9S8 Cep55-201ENSMUST00000096096 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Atg4aQ8C9S8 Samd12-201ENSMUST00000078673 9019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Atg4aQ8C9S8 Gm42531-201ENSMUST00000201648 4048 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Atg4aQ8C9S8 Gm2832-201ENSMUST00000172412 1760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Atg4aQ8C9S8 Gm6818-201ENSMUST00000190556 2558 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Atg4aQ8C9S8 AC156569.1-201ENSMUST00000222020 3841 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Atg4aQ8C9S8 Gm43567-201ENSMUST00000197581 1978 ntBASIC6.84□□□□□ -1.32
Atg4aQ8C9S8 Pls3-203ENSMUST00000114058 3032 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.32
Atg4aQ8C9S8 Gm38137-201ENSMUST00000193735 1401 ntBASIC6.84□□□□□ -1.32
Atg4aQ8C9S8 Gm42662-201ENSMUST00000202539 1431 ntBASIC6.84□□□□□ -1.32
Atg4aQ8C9S8 Tmprss11a-201ENSMUST00000101073 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Atg4aQ8C9S8 Tmprss11b-201ENSMUST00000038448 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Atg4aQ8C9S8 Ceacam15-201ENSMUST00000108498 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Atg4aQ8C9S8 Als2cr12-203ENSMUST00000188772 1382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Atg4aQ8C9S8 Gm7919-201ENSMUST00000202043 1389 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Atg4aQ8C9S8 AC154806.2-201ENSMUST00000227212 2385 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Atg4aQ8C9S8 Vmn1r220-203ENSMUST00000227679 7868 ntAPPRIS P1 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Atg4aQ8C9S8 Vmn1r220-206ENSMUST00000228854 7854 ntAPPRIS P1 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Atg4aQ8C9S8 Cfap70-203ENSMUST00000056073 3615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Atg4aQ8C9S8 Dsc1-201ENSMUST00000038710 3775 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Atg4aQ8C9S8 Zfp937-201ENSMUST00000073782 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Atg4aQ8C9S8 Pbrm1-202ENSMUST00000022474 4843 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Atg4aQ8C9S8 Gm13544-201ENSMUST00000131189 2940 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Atg4aQ8C9S8 Gm37049-201ENSMUST00000194356 1983 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Atg4aQ8C9S8 Trav14-3-201ENSMUST00000103589 384 ntAPPRIS P1 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Atg4aQ8C9S8 Gm26078-201ENSMUST00000104067 128 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Atg4aQ8C9S8 Olfr1069-ps1-201ENSMUST00000120755 965 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms