Protein–RNA interactions for Protein: Q8BK35

Nop53, Ribosome biogenesis protein NOP53, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop53Q8BK35 AC118476.2-201ENSMUST00000215206 757 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Nop53Q8BK35 Olfr342-202ENSMUST00000216275 3818 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Nop53Q8BK35 Gm40658-202ENSMUST00000221900 701 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Nop53Q8BK35 AC122295.1-201ENSMUST00000223476 388 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Nop53Q8BK35 AC102575.1-201ENSMUST00000225348 547 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Nop53Q8BK35 Vmn1r41-203ENSMUST00000226562 1046 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Nop53Q8BK35 Anxa13-202ENSMUST00000227274 1201 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Nop53Q8BK35 Gm25079-201ENSMUST00000082529 203 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Nop53Q8BK35 Itih5l-ps-201ENSMUST00000145639 3964 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Nop53Q8BK35 Actl11-201ENSMUST00000085073 3993 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Nop53Q8BK35 Gpbp1l1-201ENSMUST00000030460 3588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Nop53Q8BK35 Gm16506-201ENSMUST00000165553 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Nop53Q8BK35 Gm35585-201ENSMUST00000195996 1570 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Nop53Q8BK35 Aadat-202ENSMUST00000209338 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Nop53Q8BK35 1110002J07Rik-201ENSMUST00000181710 2229 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Nop53Q8BK35 Rps15a-207ENSMUST00000172457 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Nop53Q8BK35 Slc38a6-202ENSMUST00000101313 1546 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Nop53Q8BK35 Olfr961-202ENSMUST00000219295 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Nop53Q8BK35 3830408C21Rik-202ENSMUST00000223895 1689 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Nop53Q8BK35 4933425L06Rik-201ENSMUST00000022232 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Nop53Q8BK35 AC163660.4-201ENSMUST00000224983 2171 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Nop53Q8BK35 Gbp2b-201ENSMUST00000029936 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Nop53Q8BK35 Gm42711-201ENSMUST00000197060 2302 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Nop53Q8BK35 Slc17a8-201ENSMUST00000020102 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Nop53Q8BK35 Cx3cr1-203ENSMUST00000215016 4493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Nop53Q8BK35 Gm39327-201ENSMUST00000213594 1982 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Nop53Q8BK35 Helz-203ENSMUST00000106746 13147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Nop53Q8BK35 Trim5-201ENSMUST00000051795 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Nop53Q8BK35 Psg17-201ENSMUST00000004655 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Nop53Q8BK35 Dsg1c-201ENSMUST00000054128 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Nop53Q8BK35 Ddx18-201ENSMUST00000001724 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Nop53Q8BK35 5830432E09Rik-201ENSMUST00000180693 3569 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Nop53Q8BK35 Wdr12-201ENSMUST00000027173 10012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Nop53Q8BK35 Mir503-201ENSMUST00000102168 71 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Nop53Q8BK35 Gm12789-201ENSMUST00000106914 883 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Nop53Q8BK35 Gm16082-201ENSMUST00000115992 377 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Nop53Q8BK35 Gm5287-201ENSMUST00000120666 598 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Nop53Q8BK35 Gm14787-201ENSMUST00000121236 388 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Nop53Q8BK35 Gm14986-201ENSMUST00000121262 1002 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Nop53Q8BK35 Ndufb5-203ENSMUST00000122290 625 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Nop53Q8BK35 Gm23657-201ENSMUST00000122623 294 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Nop53Q8BK35 Gm2800-201ENSMUST00000122988 641 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Nop53Q8BK35 Crem-207ENSMUST00000126578 915 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Nop53Q8BK35 Gm16144-201ENSMUST00000131093 827 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Nop53Q8BK35 Gm11916-201ENSMUST00000132759 650 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Nop53Q8BK35 Crem-236ENSMUST00000154715 1167 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Nop53Q8BK35 Gm22336-201ENSMUST00000157719 107 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Nop53Q8BK35 Gm24847-201ENSMUST00000158032 108 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Nop53Q8BK35 AY512915-204ENSMUST00000162315 676 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Nop53Q8BK35 Gm7316-201ENSMUST00000165395 445 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Nop53Q8BK35 Gm24080-201ENSMUST00000175178 232 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
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Nop53Q8BK35 Gm24653-201ENSMUST00000178541 79 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Nop53Q8BK35 Gm25934-201ENSMUST00000178642 79 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Nop53Q8BK35 1700010L04Rik-203ENSMUST00000179662 1015 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Nop53Q8BK35 Rpp14-202ENSMUST00000180369 477 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Nop53Q8BK35 Gm27803-201ENSMUST00000183763 119 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Nop53Q8BK35 Mir7058-201ENSMUST00000184637 75 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Nop53Q8BK35 Gm28542-201ENSMUST00000185545 696 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Nop53Q8BK35 4930556G22Rik-201ENSMUST00000185689 741 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
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Nop53Q8BK35 Gm29659-201ENSMUST00000187063 696 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Nop53Q8BK35 Gm28682-201ENSMUST00000187430 696 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Nop53Q8BK35 Gm28738-201ENSMUST00000187480 696 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Nop53Q8BK35 Gm29319-201ENSMUST00000188060 696 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
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Nop53Q8BK35 Gm29312-201ENSMUST00000188724 696 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Nop53Q8BK35 Gm29637-201ENSMUST00000188877 696 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Nop53Q8BK35 Gm29181-201ENSMUST00000191288 696 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Nop53Q8BK35 Rpl23a-ps11-201ENSMUST00000191583 463 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Nop53Q8BK35 A930005N03Rik-201ENSMUST00000194920 1247 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
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Nop53Q8BK35 Gm43608-201ENSMUST00000197703 687 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Nop53Q8BK35 Rps4x-ps-201ENSMUST00000199852 793 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Nop53Q8BK35 Gm43812-202ENSMUST00000202701 581 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Nop53Q8BK35 Gm4605-201ENSMUST00000203148 625 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Nop53Q8BK35 Gm30784-201ENSMUST00000204491 794 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Nop53Q8BK35 Gm31663-202ENSMUST00000208481 1190 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Nop53Q8BK35 Gm45319-201ENSMUST00000210220 318 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Nop53Q8BK35 Gm18503-201ENSMUST00000220340 728 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Nop53Q8BK35 Gm9231-201ENSMUST00000220817 1009 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Nop53Q8BK35 1700024I08Rik-203ENSMUST00000222372 754 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Nop53Q8BK35 Olfr736-201ENSMUST00000058965 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Nop53Q8BK35 Olfr49-201ENSMUST00000059996 1030 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Nop53Q8BK35 Meig1-201ENSMUST00000064685 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Nop53Q8BK35 Olfr395-201ENSMUST00000072991 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Nop53Q8BK35 Gm24460-201ENSMUST00000082731 106 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Nop53Q8BK35 Gm16020-201ENSMUST00000084281 210 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Nop53Q8BK35 Gm13106-201ENSMUST00000119045 1443 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Nop53Q8BK35 Zfp640-202ENSMUST00000224116 1562 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Nop53Q8BK35 Clec4a1-201ENSMUST00000060484 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Nop53Q8BK35 B130024G19Rik-203ENSMUST00000190320 5451 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Nop53Q8BK35 Gm15093-201ENSMUST00000179021 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Nop53Q8BK35 Grip1-208ENSMUST00000138410 3532 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Nop53Q8BK35 Dennd2c-202ENSMUST00000172288 4979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Nop53Q8BK35 AC158938.1-201ENSMUST00000225372 6720 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Nop53Q8BK35 Gm42998-201ENSMUST00000197053 2371 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Nop53Q8BK35 Atp10d-201ENSMUST00000094710 2365 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Nop53Q8BK35 T2-201ENSMUST00000163578 1755 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
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