Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

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Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 B020031M17Rik-201ENSMUST00000080505 522 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Nfib-201ENSMUST00000050872 8770 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp78-201ENSMUST00000086323 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Gm156-202ENSMUST00000118532 2000 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Hdac9-201ENSMUST00000110819 4413 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Brs3-201ENSMUST00000033464 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.4
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1220-203ENSMUST00000213288 4223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Ccdc88cQ6VGS5 B3gnt5-201ENSMUST00000079780 4258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Ccdc88cQ6VGS5 A730017C20Rik-205ENSMUST00000165666 1911 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Ccdc88cQ6VGS5 Acvr1c-202ENSMUST00000100085 4289 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Ccdc88cQ6VGS5 C87499-202ENSMUST00000107142 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15048-201ENSMUST00000118201 954 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11617-201ENSMUST00000119609 639 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14472-201ENSMUST00000119815 282 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Ccdc88cQ6VGS5 Gm6081-201ENSMUST00000134472 489 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13062-201ENSMUST00000151337 562 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16132-201ENSMUST00000159296 598 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Ccdc88cQ6VGS5 Gm8032-201ENSMUST00000171009 574 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Ccdc88cQ6VGS5 Rrh-208ENSMUST00000200079 1106 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Ccdc88cQ6VGS5 Gm30928-202ENSMUST00000206881 271 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Ccdc88cQ6VGS5 Gm18329-201ENSMUST00000215832 589 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
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Ccdc88cQ6VGS5 AC122034.1-201ENSMUST00000227641 595 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Ccdc88cQ6VGS5 Slc10a5-201ENSMUST00000078748 3923 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Ccdc88cQ6VGS5 Gm8700-201ENSMUST00000222187 3054 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Ccdc88cQ6VGS5 Sirpb1a-203ENSMUST00000192700 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
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Ccdc88cQ6VGS5 Tnrc6a-201ENSMUST00000094053 8183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
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Ccdc88cQ6VGS5 Dennd2c-202ENSMUST00000172288 4979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Ccdc88cQ6VGS5 Ptprz1-201ENSMUST00000090568 8068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm25919-201ENSMUST00000104271 132 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Ccdc88cQ6VGS5 Svs3a-202ENSMUST00000109370 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Ccdc88cQ6VGS5 Cd59b-202ENSMUST00000111130 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm12147-201ENSMUST00000144024 182 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
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Ccdc88cQ6VGS5 Zcchc10-201ENSMUST00000018383 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
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Ccdc88cQ6VGS5 Olfr874-202ENSMUST00000216982 2632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn2r88-204ENSMUST00000228139 3227 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
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Ccdc88cQ6VGS5 Ccr9-203ENSMUST00000166236 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Ccdc88cQ6VGS5 Enpp2-204ENSMUST00000173516 2887 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
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Ccdc88cQ6VGS5 A230107N01Rik-201ENSMUST00000180894 2348 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Ccdc88cQ6VGS5 Serpinb6b-202ENSMUST00000110293 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Ccdc88cQ6VGS5 Hsf3-204ENSMUST00000164693 2076 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Ccdc88cQ6VGS5 Scaper-202ENSMUST00000214747 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
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Ccdc88cQ6VGS5 Kif27-201ENSMUST00000043605 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
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Ccdc88cQ6VGS5 Nol8-201ENSMUST00000021824 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Ccdc88cQ6VGS5 Mbd5-202ENSMUST00000112745 6037 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Ccdc88cQ6VGS5 Synj2bp-203ENSMUST00000163402 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Ccdc88cQ6VGS5 Gcnt1-201ENSMUST00000169897 4594 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Ccdc88cQ6VGS5 Serpinb5-202ENSMUST00000112729 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45001-201ENSMUST00000208279 2515 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Ccdc88cQ6VGS5 Kat6b-ps1-201ENSMUST00000187624 3433 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44843-201ENSMUST00000208320 1396 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Ccdc88cQ6VGS5 Scn9a-203ENSMUST00000112354 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Ccdc88cQ6VGS5 Gm8595-201ENSMUST00000118250 630 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12850-201ENSMUST00000119210 436 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12303-201ENSMUST00000119506 673 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Ccdc88cQ6VGS5 Gm6175-201ENSMUST00000121351 400 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Ccdc88cQ6VGS5 1700061J23Rik-201ENSMUST00000141678 537 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Ccdc88cQ6VGS5 Scarna13-201ENSMUST00000158164 275 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28467-201ENSMUST00000190981 318 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29678-201ENSMUST00000193966 1134 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Ccdc88cQ6VGS5 Gm42513-201ENSMUST00000197831 2119 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43444-201ENSMUST00000198123 291 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43522-202ENSMUST00000200185 442 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44717-201ENSMUST00000208133 578 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Ccdc88cQ6VGS5 CT033781.1-201ENSMUST00000223128 454 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37435-201ENSMUST00000192078 3947 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Ccdc88cQ6VGS5 D5Ertd577e-201ENSMUST00000094593 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15457-201ENSMUST00000129513 3990 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Ccdc88cQ6VGS5 4933403O08Rik-202ENSMUST00000152343 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
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