Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Ceacam1-201ENSMUST00000098666 3656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Zfhx4-205ENSMUST00000176383 13500 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm42841-201ENSMUST00000199806 1932 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Nlrp9c-201ENSMUST00000041845 2631 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 March1-203ENSMUST00000098708 4000 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm43164-201ENSMUST00000202529 2128 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm31258-201ENSMUST00000194532 3297 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Zc2hc1a-201ENSMUST00000051064 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Zfy1-201ENSMUST00000065545 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm45885-202ENSMUST00000211520 1383 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Olfr890-202ENSMUST00000213458 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Zfp101-201ENSMUST00000167107 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm45853-201ENSMUST00000212310 3171 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm37051-201ENSMUST00000194535 2943 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Zfp148-ps1-201ENSMUST00000211201 2453 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Zfp758-203ENSMUST00000121315 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Abcg2-201ENSMUST00000031822 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Map3k19-201ENSMUST00000061512 3936 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm2244-201ENSMUST00000164372 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm3278-201ENSMUST00000164459 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Rev3l-207ENSMUST00000164763 10399 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Zfp78-204ENSMUST00000207347 3883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Vmn2r99-201ENSMUST00000176107 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm38387-201ENSMUST00000191945 2577 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm15624-203ENSMUST00000204811 3402 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm25595-201ENSMUST00000102273 97 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm23834-201ENSMUST00000104436 129 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Lrrc51-207ENSMUST00000106967 675 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Ica1-202ENSMUST00000115518 1256 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm15502-201ENSMUST00000121449 208 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm12396-201ENSMUST00000121600 306 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm11879-201ENSMUST00000121885 702 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm13180-201ENSMUST00000141222 440 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm15892-203ENSMUST00000156149 1001 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm21999-201ENSMUST00000165985 387 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm5225-201ENSMUST00000178572 324 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Prp2-202ENSMUST00000178961 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm26812-201ENSMUST00000181647 328 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Mir6412-201ENSMUST00000184477 97 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm28455-201ENSMUST00000189105 1290 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm37604-201ENSMUST00000191749 1272 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm5103-201ENSMUST00000192081 1086 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm4332-201ENSMUST00000196114 346 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm42663-201ENSMUST00000199883 351 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm43151-201ENSMUST00000201093 657 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm9278-201ENSMUST00000205508 553 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 A730082K24Rik-202ENSMUST00000205795 658 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm44896-201ENSMUST00000206190 772 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm18600-201ENSMUST00000207205 505 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 1700034P13Rik-206ENSMUST00000207445 1146 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm45422-201ENSMUST00000211476 246 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm18103-201ENSMUST00000216621 779 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm36278-201ENSMUST00000217030 918 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 CT030170.6-203ENSMUST00000222523 1295 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 AC166358.4-201ENSMUST00000223030 105 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Nsa2-203ENSMUST00000225410 974 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 CT009539.1-201ENSMUST00000226465 220 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 AC154323.2-201ENSMUST00000226557 1151 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Orm1-201ENSMUST00000030044 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Sprr3-201ENSMUST00000058142 1222 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm4861-201ENSMUST00000068546 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Orm2-201ENSMUST00000075341 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Olfr111-201ENSMUST00000097325 1041 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Slc10a2-201ENSMUST00000023835 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Nlrp1b-203ENSMUST00000108515 4131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm42662-201ENSMUST00000202539 1431 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Scn7a-201ENSMUST00000042792 7338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm37514-201ENSMUST00000194512 2753 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm44894-201ENSMUST00000205280 2174 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Sft2d1Q5SSN7 Hmgn3-203ENSMUST00000185315 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r204-202ENSMUST00000228195 2936 ntAPPRIS P1 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Pja2-203ENSMUST00000172733 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm38259-201ENSMUST00000194602 3534 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Trav19-201ENSMUST00000103674 446 ntAPPRIS P1 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm14308-202ENSMUST00000117267 777 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm11902-201ENSMUST00000118849 270 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm14115-201ENSMUST00000119242 482 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm5793-201ENSMUST00000119393 630 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm16016-201ENSMUST00000120831 550 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm14679-201ENSMUST00000121536 722 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 4930448H16Rik-201ENSMUST00000159838 580 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 1700129C05Rik-202ENSMUST00000159858 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm16146-201ENSMUST00000160306 439 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Nup205-202ENSMUST00000170234 1120 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm6803-201ENSMUST00000178301 435 ntAPPRIS P1 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm2075-201ENSMUST00000180285 435 ntAPPRIS P1 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm27781-201ENSMUST00000185185 92 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Faiml-202ENSMUST00000188555 560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm42990-201ENSMUST00000199231 312 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Tas2r145-ps3-201ENSMUST00000204526 992 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm44796-201ENSMUST00000205272 626 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm29759-201ENSMUST00000205860 327 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm39090-202ENSMUST00000205992 508 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm45042-201ENSMUST00000207377 211 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm45044-201ENSMUST00000208078 396 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm4270-201ENSMUST00000209666 406 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm45626-201ENSMUST00000210093 361 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm8523-201ENSMUST00000211386 552 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Ss18l2-204ENSMUST00000215104 315 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
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