Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 408 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 AC124729.1-202ENSMUST00000225587 938 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Ccbe1Q3MI99 AC140267.1-201ENSMUST00000226485 213 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Ccbe1Q3MI99 AC154323.1-201ENSMUST00000228329 1231 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Ccbe1Q3MI99 1700011L22Rik-201ENSMUST00000034109 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Ccbe1Q3MI99 Olfr307-201ENSMUST00000069279 1012 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Ccbe1Q3MI99 Tppp2-201ENSMUST00000008957 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Ccbe1Q3MI99 Vmn1r196-201ENSMUST00000091735 906 ntAPPRIS P2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Ccbe1Q3MI99 Sult2a3-201ENSMUST00000098809 1018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Ccbe1Q3MI99 Olfr39-202ENSMUST00000212983 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Ccbe1Q3MI99 AW554918-208ENSMUST00000165400 5351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Ccbe1Q3MI99 AW554918-202ENSMUST00000097643 5351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Ccbe1Q3MI99 Pkn2-206ENSMUST00000173830 2808 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Ccbe1Q3MI99 Zscan4e-202ENSMUST00000210521 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Ccbe1Q3MI99 Olfr491-203ENSMUST00000214605 2136 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Ccbe1Q3MI99 Scaper-202ENSMUST00000214747 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Ccbe1Q3MI99 Clec12a-201ENSMUST00000065289 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Ccbe1Q3MI99 Ankfy1-206ENSMUST00000155998 8030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Ccbe1Q3MI99 Zfp808-204ENSMUST00000221772 1379 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Ccbe1Q3MI99 Psg18-202ENSMUST00000098783 1783 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Ccbe1Q3MI99 Gm45555-201ENSMUST00000210028 2602 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Ccbe1Q3MI99 Agps-203ENSMUST00000175646 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Ccbe1Q3MI99 Olfr1250-202ENSMUST00000111527 4386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Ccbe1Q3MI99 Mug-ps1-201ENSMUST00000186891 4386 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Ccbe1Q3MI99 Adam28-201ENSMUST00000022642 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Ccbe1Q3MI99 Olfr1301-202ENSMUST00000207590 4820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Ccbe1Q3MI99 Gm5454-201ENSMUST00000052030 1453 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Ccbe1Q3MI99 Gm16421-201ENSMUST00000117616 1557 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccbe1Q3MI99 Aadat-202ENSMUST00000209338 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccbe1Q3MI99 AC153912.2-201ENSMUST00000215840 2015 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccbe1Q3MI99 Naip2-203ENSMUST00000167986 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccbe1Q3MI99 Vmn2r-ps42-201ENSMUST00000174123 2083 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccbe1Q3MI99 AC137871.4-201ENSMUST00000226323 3901 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccbe1Q3MI99 Clca4a-201ENSMUST00000029923 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccbe1Q3MI99 Vmn2r79-201ENSMUST00000164462 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccbe1Q3MI99 Abcd2-201ENSMUST00000069511 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccbe1Q3MI99 Ppig-202ENSMUST00000090858 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccbe1Q3MI99 Krcc1-202ENSMUST00000168700 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccbe1Q3MI99 1700092K14Rik-201ENSMUST00000106604 395 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccbe1Q3MI99 Sult2a4-201ENSMUST00000108520 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccbe1Q3MI99 Zfp616-203ENSMUST00000116546 531 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccbe1Q3MI99 Mir669d-2-201ENSMUST00000116854 86 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccbe1Q3MI99 Gm11406-201ENSMUST00000117418 484 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccbe1Q3MI99 Vmn1r-ps95-201ENSMUST00000118641 903 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccbe1Q3MI99 Klrd1-203ENSMUST00000119520 919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccbe1Q3MI99 Gm12287-201ENSMUST00000119770 707 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccbe1Q3MI99 Gm14655-201ENSMUST00000120124 578 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccbe1Q3MI99 M6pr-ps-201ENSMUST00000120481 830 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccbe1Q3MI99 Gm14623-201ENSMUST00000121398 603 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccbe1Q3MI99 Gm15618-201ENSMUST00000121610 452 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccbe1Q3MI99 Cnih1-202ENSMUST00000146629 789 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccbe1Q3MI99 Gm22235-201ENSMUST00000157085 110 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccbe1Q3MI99 Gm25505-201ENSMUST00000157220 246 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccbe1Q3MI99 Gm24782-201ENSMUST00000157641 132 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccbe1Q3MI99 Gm23317-201ENSMUST00000157999 129 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccbe1Q3MI99 Gm23259-201ENSMUST00000158318 303 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccbe1Q3MI99 Gm16589-201ENSMUST00000159522 918 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccbe1Q3MI99 Gm16026-205ENSMUST00000162923 641 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccbe1Q3MI99 Gm6434-201ENSMUST00000163316 372 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccbe1Q3MI99 Vmn1r238-201ENSMUST00000165255 921 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccbe1Q3MI99 Prol1-201ENSMUST00000170832 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccbe1Q3MI99 Gypc-201ENSMUST00000172434 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccbe1Q3MI99 Malat1-202ENSMUST00000173314 556 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccbe1Q3MI99 Gm15256-201ENSMUST00000177793 883 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccbe1Q3MI99 Mir8099-2-201ENSMUST00000183568 127 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccbe1Q3MI99 Mir7222-201ENSMUST00000183740 75 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccbe1Q3MI99 Trav6d-4-202ENSMUST00000183820 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccbe1Q3MI99 Mir8099-1-201ENSMUST00000184238 127 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccbe1Q3MI99 Gm28228-201ENSMUST00000186880 632 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccbe1Q3MI99 Gm29355-201ENSMUST00000188178 697 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccbe1Q3MI99 Gm21803-201ENSMUST00000188897 693 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccbe1Q3MI99 Gm20788-201ENSMUST00000190538 697 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccbe1Q3MI99 Gm28060-201ENSMUST00000191554 189 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccbe1Q3MI99 7530428D23Rik-201ENSMUST00000191725 765 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccbe1Q3MI99 Gm37376-201ENSMUST00000192176 453 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccbe1Q3MI99 Gm37395-201ENSMUST00000194721 697 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccbe1Q3MI99 Ighv1-21-201ENSMUST00000194856 351 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccbe1Q3MI99 Gm43765-201ENSMUST00000196303 893 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccbe1Q3MI99 Gm26413-201ENSMUST00000196783 126 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccbe1Q3MI99 Ighv8-15-201ENSMUST00000197770 294 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccbe1Q3MI99 Gm21048-201ENSMUST00000202470 1166 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccbe1Q3MI99 Gm20559-206ENSMUST00000202696 358 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccbe1Q3MI99 Clec2j-202ENSMUST00000203658 606 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccbe1Q3MI99 Gm29759-201ENSMUST00000205860 327 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccbe1Q3MI99 Olfr574-202ENSMUST00000211329 1039 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccbe1Q3MI99 Gm45486-201ENSMUST00000211767 1109 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccbe1Q3MI99 Olfr964-ps1-201ENSMUST00000217577 914 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccbe1Q3MI99 Gm19007-201ENSMUST00000217746 874 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccbe1Q3MI99 AC160413.1-201ENSMUST00000217909 932 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccbe1Q3MI99 Olfr108-202ENSMUST00000218675 1038 ntAPPRIS P2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccbe1Q3MI99 AC162183.1-201ENSMUST00000224843 472 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccbe1Q3MI99 AC164618.3-201ENSMUST00000224863 681 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccbe1Q3MI99 AC140210.1-201ENSMUST00000224961 534 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccbe1Q3MI99 AC164116.2-201ENSMUST00000225398 1038 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccbe1Q3MI99 AL590614.1-201ENSMUST00000226037 268 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccbe1Q3MI99 AC114008.1-201ENSMUST00000226193 937 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccbe1Q3MI99 AC134864.1-201ENSMUST00000226326 511 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccbe1Q3MI99 AC130673.1-201ENSMUST00000227992 435 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccbe1Q3MI99 AC154692.1-201ENSMUST00000228314 544 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccbe1Q3MI99 Cst8-201ENSMUST00000028931 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ccbe1Q3MI99 Olfr574-201ENSMUST00000052997 1041 ntAPPRIS P2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
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