Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Gm17988-201ENSMUST00000208796 535 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 AC123832.2-201ENSMUST00000215151 129 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 AC124420.1-201ENSMUST00000219779 791 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 4930407I19Rik-201ENSMUST00000220265 923 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 AC124826.1-201ENSMUST00000221651 325 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm40653-202ENSMUST00000222122 1155 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm18940-201ENSMUST00000222518 871 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 AC091783.2-201ENSMUST00000224626 740 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Fcer1a-201ENSMUST00000049706 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Nme5-201ENSMUST00000079287 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Mir331-201ENSMUST00000083673 96 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Homer2-202ENSMUST00000098326 10982 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Vmn2r22-201ENSMUST00000170808 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Cep57l1-202ENSMUST00000105505 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Pus10-201ENSMUST00000020520 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Wrn-202ENSMUST00000033991 6262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm45762-201ENSMUST00000212863 2619 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 4930563J15Rik-201ENSMUST00000218306 3468 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Olfr610-203ENSMUST00000217627 1643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm26984-201ENSMUST00000182345 3510 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 AU023762-203ENSMUST00000209897 2179 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm13854-201ENSMUST00000121183 1679 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm14324-201ENSMUST00000121358 3051 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 P2ry13-201ENSMUST00000040622 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Vmn1r84-204ENSMUST00000227427 2880 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Olfr1389-203ENSMUST00000217595 3549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 C1d-201ENSMUST00000000594 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Sspn-202ENSMUST00000111701 4512 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Tet1-201ENSMUST00000050826 13986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Pon3-201ENSMUST00000031773 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm42607-201ENSMUST00000200221 3393 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Kmt2d-201ENSMUST00000023741 19823 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Sgip1-203ENSMUST00000080728 3712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Car5b-201ENSMUST00000033739 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Trmt10a-206ENSMUST00000162864 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm26994-201ENSMUST00000182027 1571 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 S100a9-202ENSMUST00000117167 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm15073-201ENSMUST00000117432 634 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Olfr607-201ENSMUST00000119283 915 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm14842-201ENSMUST00000119577 269 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm7700-201ENSMUST00000120273 970 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm12494-201ENSMUST00000121684 521 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm11184-201ENSMUST00000126437 268 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Tbata-207ENSMUST00000140456 953 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm16260-201ENSMUST00000155141 304 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Mipepos-201ENSMUST00000155855 610 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm4258-201ENSMUST00000182127 506 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm29111-201ENSMUST00000188823 696 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm28584-201ENSMUST00000191489 696 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm17790-201ENSMUST00000191545 1228 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm38138-201ENSMUST00000193274 696 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Ighv1-45-201ENSMUST00000193677 352 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm37991-201ENSMUST00000194297 696 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm42652-201ENSMUST00000199073 614 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm43054-201ENSMUST00000199495 884 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm32158-201ENSMUST00000200135 404 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm7890-201ENSMUST00000204877 601 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm5318-201ENSMUST00000205249 406 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm45185-201ENSMUST00000207556 404 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 AC108401.1-201ENSMUST00000219740 361 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm3785-201ENSMUST00000221000 202 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm16497-202ENSMUST00000223480 557 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Vmn1r233-201ENSMUST00000056339 960 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 4933400A11Rik-202ENSMUST00000068894 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 S100a9-201ENSMUST00000069960 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 5330409N07Rik-201ENSMUST00000222069 3518 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Vmn1r36-204ENSMUST00000226829 1923 ntAPPRIS P2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 B230303O12Rik-201ENSMUST00000199119 3645 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm10220-201ENSMUST00000088236 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm7205-201ENSMUST00000196032 1323 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 AC153959.1-201ENSMUST00000213617 1694 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 AC155634.1-201ENSMUST00000221687 2706 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm45061-201ENSMUST00000204395 2095 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Zfp937-201ENSMUST00000073782 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm5128-202ENSMUST00000180198 3836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Fat1-203ENSMUST00000189017 14651 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Nusap1-201ENSMUST00000028771 3526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Homer1-202ENSMUST00000079086 4287 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Lrriq1-201ENSMUST00000020043 2542 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Dnah3-204ENSMUST00000209154 12265 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Mme-205ENSMUST00000194134 8039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 AC133498.1-201ENSMUST00000222871 2925 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Ppp2r3a-201ENSMUST00000066773 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Olfr1504-202ENSMUST00000209192 1514 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Prg4-208ENSMUST00000164600 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm26707-201ENSMUST00000181552 3902 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm43258-201ENSMUST00000200312 1950 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Mtus1-203ENSMUST00000093534 4148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Nr3c1-204ENSMUST00000115571 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Dynlt1-ps1-201ENSMUST00000117045 342 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm13451-201ENSMUST00000117649 592 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm14335-201ENSMUST00000119165 810 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm16423-201ENSMUST00000120078 947 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Olfr405-ps1-201ENSMUST00000120649 936 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm13531-201ENSMUST00000121893 543 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm11415-201ENSMUST00000128214 480 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm25332-201ENSMUST00000158038 105 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm8323-201ENSMUST00000168436 1201 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm2959-201ENSMUST00000169844 621 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Mir3095-201ENSMUST00000175552 87 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
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