Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 B230112J18Rik-201ENSMUST00000128473 602 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Gm16135-201ENSMUST00000129470 568 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Gm15589-201ENSMUST00000144193 271 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Gm15471-201ENSMUST00000145893 625 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Gm23233-201ENSMUST00000157301 137 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Gm22867-201ENSMUST00000157499 109 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Gm24733-201ENSMUST00000158863 253 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Rab11a-206ENSMUST00000169058 462 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Obox1-205ENSMUST00000173443 835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Obox2-204ENSMUST00000174305 834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Speer4c-202ENSMUST00000179506 480 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Mir7212-201ENSMUST00000184098 61 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Gm28707-201ENSMUST00000186134 558 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Gm38133-201ENSMUST00000195109 815 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Gm44997-202ENSMUST00000205970 425 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SbdsP70122 4933430N04Rik-202ENSMUST00000208031 1146 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Gm38590-201ENSMUST00000209515 970 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SbdsP70122 AC091522.1-201ENSMUST00000213934 850 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SbdsP70122 AC155922.1-201ENSMUST00000220100 373 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Spata9-201ENSMUST00000022081 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SbdsP70122 AC079644.3-201ENSMUST00000222452 357 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Gm18247-201ENSMUST00000222937 601 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SbdsP70122 AC164597.1-201ENSMUST00000226538 514 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Vmn1r22-205ENSMUST00000228322 909 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SbdsP70122 1700007K09Rik-201ENSMUST00000033146 360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SbdsP70122 4931400O07Rik-201ENSMUST00000033537 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Olfr684-201ENSMUST00000060893 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Mmp12-202ENSMUST00000065079 1185 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Olfr651-201ENSMUST00000098176 1069 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Ankrd12-201ENSMUST00000038116 8991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Zfp60-201ENSMUST00000042641 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Capn13-201ENSMUST00000095208 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Olfr461-202ENSMUST00000215009 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Cyp2j6-201ENSMUST00000030303 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Olfr771-202ENSMUST00000214271 2098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Gm39321-201ENSMUST00000216597 2075 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Gm42798-201ENSMUST00000200853 3972 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Ing3-201ENSMUST00000031680 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Gm44695-201ENSMUST00000205567 1631 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Gm38451-201ENSMUST00000208329 2646 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Zfp148-ps1-201ENSMUST00000211201 2453 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Gm28672-201ENSMUST00000188727 1490 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SbdsP70122 1500005C15Rik-201ENSMUST00000199867 2394 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Sel1l2-202ENSMUST00000122367 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Gm22371-201ENSMUST00000104588 130 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Rpl21-ps9-201ENSMUST00000119897 482 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Rps11-ps2-201ENSMUST00000121547 456 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Gm15300-201ENSMUST00000122324 279 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Gm13838-201ENSMUST00000132130 531 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Gm26346-201ENSMUST00000157525 329 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Gm22916-201ENSMUST00000157616 119 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Vmn1r101-201ENSMUST00000164245 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Vmn1r119-201ENSMUST00000164683 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Vmn1r149-201ENSMUST00000165916 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Gm4187-201ENSMUST00000172551 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Gm4133-201ENSMUST00000172989 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Vmn2r-ps4-201ENSMUST00000176989 1015 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Gm7713-201ENSMUST00000181201 1007 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Gm37560-201ENSMUST00000194289 1000 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Gm1969-201ENSMUST00000198125 1220 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Gm44712-201ENSMUST00000206250 1076 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Gm6828-201ENSMUST00000207902 1186 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Gm31522-201ENSMUST00000207942 762 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Cx3cl1-205ENSMUST00000211947 377 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Olfr1075-ps1-201ENSMUST00000214201 470 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SbdsP70122 CAAA01216754.4-203ENSMUST00000217178 1097 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Olfr1115-204ENSMUST00000217196 2109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Gm10037-204ENSMUST00000222626 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SbdsP70122 n-R5s88-201ENSMUST00000083173 118 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SbdsP70122 n-R5s69-201ENSMUST00000083872 119 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Olfr767-202ENSMUST00000213579 5493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Gm13057-201ENSMUST00000105776 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Gm14661-201ENSMUST00000152669 2051 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SbdsP70122 S100pbp-201ENSMUST00000049081 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Ros1-201ENSMUST00000020045 7401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Vmn2r6-201ENSMUST00000165012 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Vmn2r7-203ENSMUST00000168072 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Gm7792-201ENSMUST00000201555 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Gm37101-201ENSMUST00000191656 3660 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Olfr131-203ENSMUST00000215940 1614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SbdsP70122 4930404I05Rik-201ENSMUST00000125902 2675 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Amd2-201ENSMUST00000080898 3218 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Sirpb1b-202ENSMUST00000192382 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Trim5-202ENSMUST00000098179 3655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SbdsP70122 AC165273.1-201ENSMUST00000222780 2452 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SbdsP70122 AC174459.1-201ENSMUST00000224476 1943 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Zfp442-201ENSMUST00000109916 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Gm20486-201ENSMUST00000101544 128 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Gm23440-201ENSMUST00000104299 130 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Olfr407-ps1-201ENSMUST00000117794 866 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Gm14580-201ENSMUST00000119122 718 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Gm25291-201ENSMUST00000122795 144 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Mup7-203ENSMUST00000166098 1033 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Scnm1-202ENSMUST00000173462 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Gm7745-201ENSMUST00000182235 973 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Gm37375-201ENSMUST00000193859 387 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Gm37385-201ENSMUST00000195223 387 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Gm43798-201ENSMUST00000202056 394 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Gm44206-201ENSMUST00000203044 592 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Gm44781-201ENSMUST00000208480 601 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
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