Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Gm4613-201ENSMUST00000165488 276 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
VdrP48281 Arpp19-204ENSMUST00000167885 540 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
VdrP48281 Gm8357-201ENSMUST00000181115 1011 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
VdrP48281 Gm11392-201ENSMUST00000181419 710 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
VdrP48281 Gm26968-201ENSMUST00000182894 481 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
VdrP48281 1700016P04Rik-201ENSMUST00000186770 429 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
VdrP48281 Gm28413-201ENSMUST00000189369 291 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
VdrP48281 Gm37383-201ENSMUST00000191750 745 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
VdrP48281 Gm20690-202ENSMUST00000195126 355 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
VdrP48281 Gm3544-201ENSMUST00000196129 305 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
VdrP48281 Igkv12-47-201ENSMUST00000196961 356 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
VdrP48281 Gm45198-201ENSMUST00000206796 591 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
VdrP48281 A330076H08Rik-203ENSMUST00000208822 1164 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
VdrP48281 Lncbate1-201ENSMUST00000211953 812 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
VdrP48281 Gm45823-201ENSMUST00000212714 515 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
VdrP48281 Rpl26-ps1-201ENSMUST00000213139 426 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
VdrP48281 RMST_1.1-213ENSMUST00000220288 792 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
VdrP48281 CT010456.3-201ENSMUST00000221210 523 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
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VdrP48281 Gm36758-201ENSMUST00000222594 310 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
VdrP48281 Gnrh1-202ENSMUST00000223929 428 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
VdrP48281 4930469K13Rik-203ENSMUST00000224226 243 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
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VdrP48281 AC161537.1-202ENSMUST00000228450 868 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
VdrP48281 Olfr137-201ENSMUST00000057394 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
VdrP48281 Tas2r118-201ENSMUST00000062463 900 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
VdrP48281 Cldn10-202ENSMUST00000071546 1031 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
VdrP48281 Rpl31-ps20-201ENSMUST00000080982 378 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
VdrP48281 Cd40-203ENSMUST00000081310 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
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VdrP48281 Gm3985-201ENSMUST00000132101 2515 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
VdrP48281 Gm12784-202ENSMUST00000206001 3739 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
VdrP48281 Ttc41-201ENSMUST00000061458 1815 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
VdrP48281 Dock10-209ENSMUST00000190983 6672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
VdrP48281 AC131586.2-202ENSMUST00000227016 2705 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
VdrP48281 P2ry14-203ENSMUST00000196081 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
VdrP48281 Rsad2-201ENSMUST00000020970 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
VdrP48281 Fam196b-202ENSMUST00000165963 5371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
VdrP48281 Olfr266-203ENSMUST00000216610 1520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
VdrP48281 D030034A15Rik-201ENSMUST00000215835 3953 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
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VdrP48281 Olfr285-202ENSMUST00000216901 5330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
VdrP48281 Nckap5-204ENSMUST00000112583 7212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
VdrP48281 Olfr1458-202ENSMUST00000215160 1914 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
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VdrP48281 Ankrd17-205ENSMUST00000197021 8067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
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VdrP48281 Myt1l-202ENSMUST00000049784 7202 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
VdrP48281 Tmprss11a-201ENSMUST00000101073 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
VdrP48281 Gm8267-201ENSMUST00000165003 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
VdrP48281 Zfp37-205ENSMUST00000221329 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
VdrP48281 1700049E17Rik1-201ENSMUST00000095985 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
VdrP48281 Olfr1426-203ENSMUST00000217952 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
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VdrP48281 Il19-202ENSMUST00000112465 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
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VdrP48281 Morn5-201ENSMUST00000028256 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
VdrP48281 1700011L22Rik-201ENSMUST00000034109 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
VdrP48281 Mphosph6-201ENSMUST00000034303 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
VdrP48281 Gm5142-201ENSMUST00000066558 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
VdrP48281 Olfr1220-203ENSMUST00000213288 4223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
VdrP48281 Adam3-209ENSMUST00000171438 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
VdrP48281 Tcf7l2-213ENSMUST00000111662 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
VdrP48281 Slc9a9-201ENSMUST00000033463 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
VdrP48281 Dennd1b-201ENSMUST00000094505 8073 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
VdrP48281 Fap-209ENSMUST00000174448 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
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