Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Zfp965-201ENSMUST00000109002 957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
SrprbP47758 Gm15293-201ENSMUST00000110754 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
SrprbP47758 Vmn1r-ps99-201ENSMUST00000120067 766 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
SrprbP47758 Gm12308-201ENSMUST00000120440 389 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
SrprbP47758 Gm13998-201ENSMUST00000120952 335 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
SrprbP47758 Gm15187-201ENSMUST00000122329 264 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
SrprbP47758 n-R5s48-201ENSMUST00000122482 110 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
SrprbP47758 Gm14410-202ENSMUST00000133301 1113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
SrprbP47758 1700061H18Rik-201ENSMUST00000139488 634 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
SrprbP47758 Gm15471-201ENSMUST00000145893 625 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
SrprbP47758 Gm16079-201ENSMUST00000149065 578 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
SrprbP47758 Gm12414-201ENSMUST00000150794 494 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
SrprbP47758 Gm22339-201ENSMUST00000157718 62 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
SrprbP47758 Gm6904-201ENSMUST00000168702 898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
SrprbP47758 Vmn2r-ps84-201ENSMUST00000173377 897 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
SrprbP47758 Znrf1-215ENSMUST00000174454 494 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
SrprbP47758 Mir3060-201ENSMUST00000175339 83 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
SrprbP47758 n-R5s209-201ENSMUST00000179494 119 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
SrprbP47758 Gm27033-201ENSMUST00000183226 544 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
SrprbP47758 Gm28973-201ENSMUST00000189310 613 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
SrprbP47758 Gm5554-201ENSMUST00000199726 1206 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
SrprbP47758 Gm33242-201ENSMUST00000212130 1057 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
SrprbP47758 C030006N10Rik-201ENSMUST00000219077 517 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
SrprbP47758 AC159208.1-201ENSMUST00000221403 649 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
SrprbP47758 1700011B04Rik-211ENSMUST00000222690 394 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
SrprbP47758 AV026068-224ENSMUST00000224827 928 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
SrprbP47758 Eri2-202ENSMUST00000063902 1241 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
SrprbP47758 Olfr1337-201ENSMUST00000077247 951 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
SrprbP47758 Rpl29-202ENSMUST00000098994 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
SrprbP47758 Klrk1-205ENSMUST00000168919 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
SrprbP47758 Gm7073-201ENSMUST00000114687 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
SrprbP47758 AC116476.1-201ENSMUST00000226274 2318 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
SrprbP47758 Pnpla8-202ENSMUST00000122902 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
SrprbP47758 B020004J07Rik-201ENSMUST00000084386 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
SrprbP47758 Olfr553-202ENSMUST00000216776 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
SrprbP47758 Tln2-202ENSMUST00000040025 12132 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
SrprbP47758 Abcc2-201ENSMUST00000026208 8027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
SrprbP47758 Utp14b-ps1-201ENSMUST00000197716 2265 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
SrprbP47758 Pias1-202ENSMUST00000214830 2492 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
SrprbP47758 Xpo1-204ENSMUST00000109551 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
SrprbP47758 Ptprz1-204ENSMUST00000202102 4947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
SrprbP47758 Gm17093-201ENSMUST00000170427 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
SrprbP47758 Cts3-201ENSMUST00000054702 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
SrprbP47758 Gm43343-201ENSMUST00000202454 1926 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
SrprbP47758 Vmn1r219-202ENSMUST00000226845 5979 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
SrprbP47758 Vmn1r219-205ENSMUST00000228666 5993 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
SrprbP47758 Cd274-201ENSMUST00000016640 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
SrprbP47758 Zgrf1-203ENSMUST00000196141 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
SrprbP47758 Gm17477-201ENSMUST00000165458 2581 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
SrprbP47758 Gm9239-201ENSMUST00000186942 2557 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
SrprbP47758 Gm26873-201ENSMUST00000181390 2368 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
SrprbP47758 Gm12388-201ENSMUST00000119112 1887 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
SrprbP47758 4921524L21Rik-201ENSMUST00000044829 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
SrprbP47758 Trappc2-201ENSMUST00000112192 1294 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
SrprbP47758 Cd47-202ENSMUST00000114496 867 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
SrprbP47758 Gm14854-201ENSMUST00000117758 841 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
SrprbP47758 Vmn1r-ps95-201ENSMUST00000118641 903 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
SrprbP47758 Gm15194-201ENSMUST00000120453 434 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
SrprbP47758 Gm6067-201ENSMUST00000121648 491 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
SrprbP47758 Gm25179-201ENSMUST00000122632 128 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
SrprbP47758 4933401B06Rik-201ENSMUST00000139758 1155 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
SrprbP47758 AI847159-203ENSMUST00000141786 915 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
SrprbP47758 Gm24685-201ENSMUST00000157764 285 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
SrprbP47758 Scnm1-202ENSMUST00000173462 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
SrprbP47758 Vmn1r-ps55-201ENSMUST00000174634 392 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
SrprbP47758 Vmn1r-ps23-201ENSMUST00000175708 295 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
SrprbP47758 Gm38166-201ENSMUST00000191660 471 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
SrprbP47758 Gm8009-201ENSMUST00000191672 436 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
SrprbP47758 Gm18865-201ENSMUST00000193011 1171 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
SrprbP47758 Ighv5-3-201ENSMUST00000195336 322 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
SrprbP47758 Ighv1-83-201ENSMUST00000199643 351 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
SrprbP47758 Gm44282-201ENSMUST00000203199 190 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
SrprbP47758 Gm31897-201ENSMUST00000205924 340 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
SrprbP47758 Gm7587-201ENSMUST00000207618 1021 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
SrprbP47758 Dlg2-216ENSMUST00000209170 1057 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
SrprbP47758 Gm18039-201ENSMUST00000217816 728 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
SrprbP47758 AC241534.1-201ENSMUST00000218537 399 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
SrprbP47758 Gm18405-201ENSMUST00000220743 511 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
SrprbP47758 CT033781.1-201ENSMUST00000223128 454 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
SrprbP47758 Gm18955-201ENSMUST00000223173 649 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
SrprbP47758 AC154795.1-201ENSMUST00000225611 364 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
SrprbP47758 4930519F16Rik-201ENSMUST00000033688 1113 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
SrprbP47758 Mcts1-201ENSMUST00000000365 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
SrprbP47758 Olfr1325-201ENSMUST00000054541 948 ntAPPRIS P2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
SrprbP47758 1810024B03Rik-201ENSMUST00000056146 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
SrprbP47758 Olfr1406-201ENSMUST00000072395 1063 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
SrprbP47758 Olfr1387-201ENSMUST00000073824 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
SrprbP47758 Olfr149-201ENSMUST00000082027 1030 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
SrprbP47758 Ifi206-201ENSMUST00000160565 3047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
SrprbP47758 Apol10a-201ENSMUST00000060551 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
SrprbP47758 Abca15-202ENSMUST00000121265 5335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
SrprbP47758 Abca15-201ENSMUST00000076272 5335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
SrprbP47758 Gm8700-201ENSMUST00000222187 3054 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
SrprbP47758 Vmn2r61-201ENSMUST00000166131 2598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
SrprbP47758 Olfr1226-205ENSMUST00000216445 7046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
SrprbP47758 Akt3-202ENSMUST00000111159 4906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
SrprbP47758 Hdac9-201ENSMUST00000110819 4413 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
SrprbP47758 Abcd2-201ENSMUST00000069511 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
SrprbP47758 Glb1l3-203ENSMUST00000210274 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
SrprbP47758 Adgrg2-202ENSMUST00000112400 4682 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.9 ms