Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 AC154283.1-201ENSMUST00000228417 389 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RxraP28700 Fhl5-201ENSMUST00000029922 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
RxraP28700 Mup14-202ENSMUST00000075206 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
RxraP28700 Defa17-201ENSMUST00000079528 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
RxraP28700 Gm3512-201ENSMUST00000090663 441 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RxraP28700 Ctla4-202ENSMUST00000097720 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RxraP28700 Mup13-202ENSMUST00000098042 984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RxraP28700 Gm45752-201ENSMUST00000212917 3186 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RxraP28700 2900092N22Rik-201ENSMUST00000193601 1409 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RxraP28700 Vmn1r12-203ENSMUST00000227581 6490 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RxraP28700 Zbed6-201ENSMUST00000190574 5007 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RxraP28700 Zfp974-201ENSMUST00000098639 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
RxraP28700 C1d-201ENSMUST00000000594 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
RxraP28700 Olfr532-203ENSMUST00000213801 4232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RxraP28700 Nxf7-201ENSMUST00000033784 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
RxraP28700 Gm37897-201ENSMUST00000192613 3561 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RxraP28700 Crem-230ENSMUST00000151311 2485 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RxraP28700 Il1b-201ENSMUST00000028881 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
RxraP28700 Il5-201ENSMUST00000048605 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
RxraP28700 B020004J07Rik-201ENSMUST00000084386 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
RxraP28700 AC154755.2-201ENSMUST00000224384 2857 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RxraP28700 Ncoa4-201ENSMUST00000111994 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
RxraP28700 Rabgap1-203ENSMUST00000112920 4847 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RxraP28700 Olfr1500-201ENSMUST00000067670 2092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
RxraP28700 Slc22a29-205ENSMUST00000222533 1473 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
RxraP28700 Olfr1295-203ENSMUST00000217772 5539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
RxraP28700 Gm5590-202ENSMUST00000186976 2315 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
RxraP28700 9830004L10Rik-201ENSMUST00000185548 2177 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
RxraP28700 Serpinb7-201ENSMUST00000086690 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
RxraP28700 Kynu-203ENSMUST00000112826 1587 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
RxraP28700 1700024B05Rik-202ENSMUST00000168972 1573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
RxraP28700 Gm42598-201ENSMUST00000200110 2437 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
RxraP28700 Igkv4-50-201ENSMUST00000103363 352 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
RxraP28700 Ighv8-12-201ENSMUST00000103540 315 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
RxraP28700 Olfr50-201ENSMUST00000112950 1157 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
RxraP28700 Serpinb1-ps1-201ENSMUST00000118548 586 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
RxraP28700 Gm12465-201ENSMUST00000118591 300 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
RxraP28700 Gm8430-201ENSMUST00000119780 471 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
RxraP28700 Gm6620-201ENSMUST00000120113 715 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
RxraP28700 Gm13493-201ENSMUST00000120318 493 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
RxraP28700 Gm12451-201ENSMUST00000121636 633 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
RxraP28700 Gm11292-201ENSMUST00000146121 1153 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
RxraP28700 Gm22428-201ENSMUST00000158554 132 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
RxraP28700 Vmn1r-ps75-201ENSMUST00000174316 920 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
RxraP28700 Gm16456-201ENSMUST00000174431 920 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
RxraP28700 Mir5128-201ENSMUST00000175217 84 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
RxraP28700 D630011A20Rik-201ENSMUST00000180858 500 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
RxraP28700 1810041H14Rik-202ENSMUST00000187218 434 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
RxraP28700 Gm28763-201ENSMUST00000188870 166 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
RxraP28700 Gm29579-201ENSMUST00000190820 166 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
RxraP28700 1700066C05Rik-201ENSMUST00000191029 407 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
RxraP28700 Gm37784-201ENSMUST00000193233 189 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
RxraP28700 Gm5694-201ENSMUST00000195648 641 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
RxraP28700 Gm43132-201ENSMUST00000199106 792 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
RxraP28700 Gm20052-204ENSMUST00000202443 648 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
RxraP28700 Gm45008-201ENSMUST00000206420 493 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
RxraP28700 Gm45303-201ENSMUST00000211239 676 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
RxraP28700 AC166352.1-201ENSMUST00000215483 1105 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
RxraP28700 C230072F16Rik-203ENSMUST00000220322 1136 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
RxraP28700 CT025579.4-201ENSMUST00000224598 627 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
RxraP28700 AC164618.1-201ENSMUST00000225769 592 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
RxraP28700 Gm5229-201ENSMUST00000039375 354 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
RxraP28700 4930515G13Rik-201ENSMUST00000057521 492 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
RxraP28700 Olfr930-201ENSMUST00000058789 1101 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
RxraP28700 Olfr161-201ENSMUST00000061541 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
RxraP28700 Rps27a-ps2-201ENSMUST00000078766 467 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
RxraP28700 Rhox3h-201ENSMUST00000096457 1053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
RxraP28700 Olfr1308-201ENSMUST00000099605 963 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
RxraP28700 Gm44193-201ENSMUST00000204822 2523 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
RxraP28700 Glb1l3-203ENSMUST00000210274 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
RxraP28700 Gm3106-201ENSMUST00000179743 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
RxraP28700 Olfr390-202ENSMUST00000120081 3604 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
RxraP28700 Gm5415-201ENSMUST00000171322 3609 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
RxraP28700 Vmn2r42-201ENSMUST00000086282 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
RxraP28700 Ascc3-206ENSMUST00000219226 1357 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
RxraP28700 AC155710.1-201ENSMUST00000219913 1353 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
RxraP28700 Kcnma1-202ENSMUST00000074983 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
RxraP28700 Gm37212-201ENSMUST00000192582 3650 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
RxraP28700 Vrk2-202ENSMUST00000109504 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
RxraP28700 Rbpj-202ENSMUST00000087360 5252 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
RxraP28700 Olfr453-202ENSMUST00000213997 3082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.44
RxraP28700 AC154627.2-201ENSMUST00000227028 4669 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
RxraP28700 Kat7-202ENSMUST00000092766 3414 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
RxraP28700 Gm5832-201ENSMUST00000121704 1582 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
RxraP28700 Gm26603-201ENSMUST00000181380 2861 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
RxraP28700 Gm26691-202ENSMUST00000181952 4183 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
RxraP28700 Zfp433-201ENSMUST00000085664 1800 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
RxraP28700 Stxbp5-201ENSMUST00000038213 8825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
RxraP28700 Mir546-201ENSMUST00000102105 121 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
RxraP28700 Gm14326-201ENSMUST00000108928 767 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
RxraP28700 Klra5-202ENSMUST00000118060 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
RxraP28700 Gm12308-201ENSMUST00000120440 389 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
RxraP28700 Gm13299-201ENSMUST00000133644 425 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
RxraP28700 Gm13307-202ENSMUST00000142990 425 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
RxraP28700 Gm15647-201ENSMUST00000160178 691 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
RxraP28700 Gm16133-202ENSMUST00000160278 565 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
RxraP28700 Gm20480-201ENSMUST00000173953 250 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
RxraP28700 1700108F19Rik-207ENSMUST00000191384 210 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
RxraP28700 Gm37809-201ENSMUST00000195050 931 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
RxraP28700 Gm37705-201ENSMUST00000195111 577 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
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