Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Hyal4-201ENSMUST00000031691 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
RhoP15409 Sirpb1b-202ENSMUST00000192382 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
RhoP15409 Synj2bp-203ENSMUST00000163402 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
RhoP15409 Xpr1-201ENSMUST00000027741 7492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
RhoP15409 Gm37951-201ENSMUST00000192963 3032 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
RhoP15409 Slc26a5-202ENSMUST00000115176 2768 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
RhoP15409 Olfr398-203ENSMUST00000214334 5348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
RhoP15409 Vmn1r36-201ENSMUST00000226142 1770 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
RhoP15409 Vmn1r37-204ENSMUST00000226974 1770 ntAPPRIS P2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
RhoP15409 Tspan7-202ENSMUST00000115526 7067 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
RhoP15409 AC132384.12-201ENSMUST00000219608 4227 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
RhoP15409 Gm43062-201ENSMUST00000196302 1319 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RhoP15409 Gm15448-202ENSMUST00000108619 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
RhoP15409 Vmn2r-ps54-202ENSMUST00000150147 2952 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
RhoP15409 Smim8-202ENSMUST00000108131 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
RhoP15409 Defb45-201ENSMUST00000109834 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
RhoP15409 Gm22709-201ENSMUST00000116893 111 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RhoP15409 Gm11737-201ENSMUST00000118713 468 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RhoP15409 Gm3931-201ENSMUST00000119038 455 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RhoP15409 Gm12788-201ENSMUST00000119090 308 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RhoP15409 Gm6744-201ENSMUST00000119303 543 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RhoP15409 Vmn1r-ps80-201ENSMUST00000174838 966 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RhoP15409 Gm26895-201ENSMUST00000181295 619 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
RhoP15409 Gm27679-201ENSMUST00000184612 84 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RhoP15409 Gm19231-201ENSMUST00000193212 830 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RhoP15409 A330069K06Rik-201ENSMUST00000194077 917 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
RhoP15409 Gm7181-201ENSMUST00000202197 434 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RhoP15409 Tas2r146-ps1-201ENSMUST00000203065 934 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RhoP15409 Rpl17-ps2-201ENSMUST00000218101 532 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RhoP15409 Gm9202-201ENSMUST00000223036 437 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RhoP15409 Gm7550-201ENSMUST00000223334 282 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
RhoP15409 Vmn1r16-201ENSMUST00000227168 912 ntAPPRIS P2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
RhoP15409 AC121912.1-201ENSMUST00000227525 1201 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RhoP15409 Gm21994-201ENSMUST00000063463 990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
RhoP15409 Scgb2b27-201ENSMUST00000085620 512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
RhoP15409 Olfr1348-201ENSMUST00000086319 957 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
RhoP15409 Gm94-201ENSMUST00000096570 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
RhoP15409 Vmn2r-ps82-201ENSMUST00000174222 1641 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RhoP15409 Gm43503-201ENSMUST00000200033 3408 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RhoP15409 Gm39327-201ENSMUST00000213594 1982 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
RhoP15409 Abcd2-201ENSMUST00000069511 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
RhoP15409 A930006L05Rik-201ENSMUST00000186821 2814 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
RhoP15409 Olfr1392-203ENSMUST00000214170 3507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
RhoP15409 Olfr1392-205ENSMUST00000214598 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
RhoP15409 Gng12-201ENSMUST00000043148 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
RhoP15409 A330008L17Rik-202ENSMUST00000153366 2614 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
RhoP15409 Olfr976-202ENSMUST00000213171 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
RhoP15409 Olfr651-203ENSMUST00000216904 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
RhoP15409 AC163032.1-201ENSMUST00000220671 2970 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RhoP15409 Vcan-203ENSMUST00000109546 12427 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
RhoP15409 Odam-202ENSMUST00000129757 1370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
RhoP15409 A930004J17Rik-201ENSMUST00000192689 4610 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RhoP15409 Gm37060-201ENSMUST00000194997 2397 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RhoP15409 Olfr497-202ENSMUST00000213521 2396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RhoP15409 Tank-205ENSMUST00000112502 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RhoP15409 Tank-201ENSMUST00000078074 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
RhoP15409 Casp8ap2-205ENSMUST00000178925 6557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RhoP15409 St18-208ENSMUST00000140079 5892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
RhoP15409 Kcnip4-208ENSMUST00000176978 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
RhoP15409 4931406B18Rik-201ENSMUST00000013497 3970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
RhoP15409 Muc15-201ENSMUST00000090332 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RhoP15409 Cpne3-201ENSMUST00000029885 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
RhoP15409 Olfr1015-203ENSMUST00000215945 2479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RhoP15409 Olfr616-202ENSMUST00000214806 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RhoP15409 Nsun6-203ENSMUST00000114713 2420 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
RhoP15409 Vmn2r-ps119-201ENSMUST00000177481 2406 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RhoP15409 Lhfpl3-201ENSMUST00000196406 2589 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
RhoP15409 Hephl1-201ENSMUST00000159985 5261 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RhoP15409 Gm37959-201ENSMUST00000191700 2897 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RhoP15409 Gm26078-201ENSMUST00000104067 128 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RhoP15409 Gm22592-201ENSMUST00000104242 131 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RhoP15409 Gm25919-201ENSMUST00000104271 132 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RhoP15409 Gm11987-201ENSMUST00000118524 381 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RhoP15409 Gm15971-201ENSMUST00000119372 211 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RhoP15409 Rhox3b-ps-201ENSMUST00000121045 868 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RhoP15409 Gm11925-201ENSMUST00000121375 535 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RhoP15409 Gm14808-201ENSMUST00000129259 361 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RhoP15409 Gm11659-201ENSMUST00000137561 466 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RhoP15409 Prl2c5-204ENSMUST00000151144 623 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RhoP15409 Gm23224-201ENSMUST00000158122 271 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RhoP15409 Gm15995-201ENSMUST00000159897 574 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RhoP15409 Gm4207-201ENSMUST00000173144 960 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RhoP15409 Obox3-ps5-201ENSMUST00000176412 1003 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RhoP15409 Rian-205ENSMUST00000182100 1017 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
RhoP15409 Gm28943-201ENSMUST00000186187 615 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RhoP15409 Gm28736-201ENSMUST00000186257 615 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RhoP15409 Gm29401-201ENSMUST00000186690 615 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RhoP15409 Gm29178-204ENSMUST00000186784 615 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RhoP15409 Gm28589-201ENSMUST00000186991 615 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RhoP15409 Gm28936-201ENSMUST00000187153 615 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RhoP15409 Gm29529-201ENSMUST00000187154 714 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RhoP15409 Gm29121-201ENSMUST00000187611 615 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RhoP15409 Gm28243-201ENSMUST00000187801 615 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RhoP15409 Gm28844-202ENSMUST00000187977 615 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RhoP15409 AV026068-209ENSMUST00000189143 517 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RhoP15409 Gm29058-201ENSMUST00000189510 615 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RhoP15409 Gm29624-201ENSMUST00000190018 615 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RhoP15409 Gm28780-201ENSMUST00000190223 615 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RhoP15409 Gm28467-201ENSMUST00000190981 318 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RhoP15409 Gm28969-211ENSMUST00000190992 615 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
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