Protein–RNA interactions for Protein: O54942

Cldn5, Claudin-5, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn5O54942 AF067061-201ENSMUST00000179905 1174 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
Cldn5O54942 Gm27855-201ENSMUST00000184122 128 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Cldn5O54942 Gm3605-201ENSMUST00000185858 440 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Cldn5O54942 Gm37973-201ENSMUST00000195767 1289 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Cldn5O54942 Rrh-205ENSMUST00000196902 1250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Cldn5O54942 Gm42504-201ENSMUST00000198312 525 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
Cldn5O54942 Gm44724-203ENSMUST00000208430 998 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Cldn5O54942 AC113082.2-201ENSMUST00000215876 756 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
Cldn5O54942 AC153528.1-201ENSMUST00000217696 434 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
Cldn5O54942 Olfr628-202ENSMUST00000218266 951 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
Cldn5O54942 AC156802.1-201ENSMUST00000223623 579 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Cldn5O54942 CT009600.1-201ENSMUST00000228771 337 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Cldn5O54942 Gm6104-201ENSMUST00000078030 603 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Cldn5O54942 Gm23795-201ENSMUST00000084006 137 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Cldn5O54942 Scgb2b27-201ENSMUST00000085620 512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Cldn5O54942 Olfr243-201ENSMUST00000098194 951 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
Cldn5O54942 Zfp708-202ENSMUST00000109743 2536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
Cldn5O54942 Gm10295-201ENSMUST00000094315 2525 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
Cldn5O54942 Gm44586-201ENSMUST00000207166 2737 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Cldn5O54942 Olfr780-202ENSMUST00000215503 2910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Cldn5O54942 AC124414.1-201ENSMUST00000218033 2946 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Cldn5O54942 C87977-204ENSMUST00000105757 1885 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Cldn5O54942 Dnah17-202ENSMUST00000084803 14889 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Cldn5O54942 Olfr318-203ENSMUST00000214728 4552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Cldn5O54942 Usp26-202ENSMUST00000114869 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Cldn5O54942 Usp26-201ENSMUST00000069509 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Cldn5O54942 Gm43502-201ENSMUST00000200263 2596 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Cldn5O54942 Trrap-201ENSMUST00000038980 12344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Cldn5O54942 Zbed6-201ENSMUST00000190574 5007 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
Cldn5O54942 Asxl3-201ENSMUST00000097655 11697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Cldn5O54942 Adgrg6-203ENSMUST00000208429 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Cldn5O54942 Nfib-201ENSMUST00000050872 8770 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Cldn5O54942 Gm6902-201ENSMUST00000179072 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Cldn5O54942 Gm7205-201ENSMUST00000196032 1323 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Cldn5O54942 Gm26740-202ENSMUST00000181532 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Cldn5O54942 Olfr1504-202ENSMUST00000209192 1514 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Cldn5O54942 Synj2bp-203ENSMUST00000163402 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Cldn5O54942 Gm37553-201ENSMUST00000194135 1602 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Cldn5O54942 Zp3r-203ENSMUST00000142416 1835 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Cldn5O54942 Olfr566-203ENSMUST00000213481 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Cldn5O54942 Cc2d2b-203ENSMUST00000207801 3730 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Cldn5O54942 Ing3-201ENSMUST00000031680 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Cldn5O54942 Kmt2c-201ENSMUST00000045291 14967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Cldn5O54942 Gm43745-201ENSMUST00000198085 1883 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Cldn5O54942 Foxp2-201ENSMUST00000031545 5647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Cldn5O54942 Gm42819-201ENSMUST00000199630 5121 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Cldn5O54942 4933411O13Rik-201ENSMUST00000050665 1464 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Cldn5O54942 Igkv4-71-201ENSMUST00000101325 288 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Cldn5O54942 Ssxb10-201ENSMUST00000103003 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Cldn5O54942 Gm23910-201ENSMUST00000104597 132 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Cldn5O54942 Olfr363-ps-201ENSMUST00000119049 254 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Cldn5O54942 Gm14335-201ENSMUST00000119165 810 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Cldn5O54942 Gm4853-201ENSMUST00000119359 394 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Cldn5O54942 Gm15848-203ENSMUST00000136015 482 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Cldn5O54942 Gm14102-201ENSMUST00000147678 464 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Cldn5O54942 Gm8988-201ENSMUST00000155015 1240 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Cldn5O54942 Gm23669-201ENSMUST00000157470 128 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Cldn5O54942 Gm23224-201ENSMUST00000158122 271 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Cldn5O54942 Gm2012-202ENSMUST00000163263 892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Cldn5O54942 Gm3159-201ENSMUST00000164038 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Cldn5O54942 Gm6121-202ENSMUST00000167438 893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Cldn5O54942 Gm22993-201ENSMUST00000175423 254 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Cldn5O54942 Vmn2r-ps32-201ENSMUST00000175794 757 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Cldn5O54942 Gm26909-201ENSMUST00000181668 627 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Cldn5O54942 Gm37190-201ENSMUST00000193580 688 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Cldn5O54942 Rhox7-ps2-201ENSMUST00000197804 322 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Cldn5O54942 Gm42776-201ENSMUST00000198031 406 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Cldn5O54942 Gm9480-201ENSMUST00000198038 616 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Cldn5O54942 Gm42824-201ENSMUST00000199361 247 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Cldn5O54942 Gm35037-201ENSMUST00000203144 506 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Cldn5O54942 Gm34549-202ENSMUST00000207356 970 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Cldn5O54942 AC123832.2-201ENSMUST00000215151 129 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Cldn5O54942 Gm29521-203ENSMUST00000216148 805 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Cldn5O54942 AC132474.2-201ENSMUST00000217414 573 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Cldn5O54942 AC154616.2-201ENSMUST00000227978 398 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Cldn5O54942 Vmn1r233-201ENSMUST00000056339 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Cldn5O54942 Spink14-201ENSMUST00000060328 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
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Cldn5O54942 Gm9894-201ENSMUST00000171257 2904 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Cldn5O54942 Vmn1r201-202ENSMUST00000226330 4770 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Cldn5O54942 Gabrg2-202ENSMUST00000070735 2234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Cldn5O54942 Gm156-202ENSMUST00000118532 2000 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Cldn5O54942 Asxl3-202ENSMUST00000120223 11485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Cldn5O54942 Sirpb1b-202ENSMUST00000192382 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Cldn5O54942 Fkbp15-202ENSMUST00000084528 3329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Cldn5O54942 Gm8980-201ENSMUST00000140232 2197 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Cldn5O54942 Ipo5-201ENSMUST00000032898 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Cldn5O54942 Gm38062-201ENSMUST00000192541 1856 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Cldn5O54942 Olfr922-202ENSMUST00000213164 4028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Cldn5O54942 Speer4a-201ENSMUST00000079447 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Cldn5O54942 Dcp2-201ENSMUST00000025350 8616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Cldn5O54942 Tlr1-201ENSMUST00000059349 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Cldn5O54942 Klf7-202ENSMUST00000114086 7662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Cldn5O54942 Zfp106-211ENSMUST00000171215 6391 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Cldn5O54942 Gm37773-201ENSMUST00000194141 2120 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Cldn5O54942 Fmn1-202ENSMUST00000099576 11817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Cldn5O54942 Olfr736-204ENSMUST00000215227 2485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Cldn5O54942 Psg27-201ENSMUST00000094794 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Cldn5O54942 Zfp280d-201ENSMUST00000098576 4387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Cldn5O54942 Gm13084-202ENSMUST00000105769 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
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