Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Gm40787-201ENSMUST00000218056 317 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccdc180J3QNE4 Clec2j-201ENSMUST00000032517 515 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccdc180J3QNE4 Cenpf-204ENSMUST00000171929 11130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccdc180J3QNE4 Gm45520-201ENSMUST00000210109 2031 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccdc180J3QNE4 Gm21761-202ENSMUST00000187530 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccdc180J3QNE4 Gm17093-201ENSMUST00000170427 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ccdc180J3QNE4 Rgs2-202ENSMUST00000127206 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc180J3QNE4 Zfp975-201ENSMUST00000107992 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc180J3QNE4 Olfr430-203ENSMUST00000214390 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc180J3QNE4 1110059G10Rik-201ENSMUST00000035154 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc180J3QNE4 Vmn1r184-205ENSMUST00000227790 4334 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc180J3QNE4 Mlh3-203ENSMUST00000220854 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc180J3QNE4 2500004C02Rik-202ENSMUST00000128026 1898 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc180J3QNE4 Lcp1-209ENSMUST00000145303 3841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc180J3QNE4 Galnt5-203ENSMUST00000166729 3812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc180J3QNE4 Tnik-215ENSMUST00000162777 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc180J3QNE4 Stag3-209ENSMUST00000162245 4123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc180J3QNE4 Med12-203ENSMUST00000117203 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc180J3QNE4 Vmn1r188-202ENSMUST00000226680 8374 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc180J3QNE4 Rpl7a-ps9-201ENSMUST00000117118 777 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc180J3QNE4 Gm15741-201ENSMUST00000119401 754 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc180J3QNE4 Gm7670-201ENSMUST00000121272 641 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc180J3QNE4 Gm18117-201ENSMUST00000187720 742 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc180J3QNE4 Olfr1215-201ENSMUST00000188399 943 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc180J3QNE4 2010016I18Rik-203ENSMUST00000189683 841 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc180J3QNE4 Gm44717-201ENSMUST00000208133 578 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc180J3QNE4 Nol8-203ENSMUST00000221142 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc180J3QNE4 Gm20125-201ENSMUST00000185722 3201 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc180J3QNE4 Lair1-202ENSMUST00000086400 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc180J3QNE4 Gm5662-201ENSMUST00000101168 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc180J3QNE4 Plxna4os2-201ENSMUST00000152538 2044 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc180J3QNE4 Vmn2r58-201ENSMUST00000171671 2589 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc180J3QNE4 Zfp345-201ENSMUST00000109914 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ccdc180J3QNE4 Gm9968-201ENSMUST00000147504 2990 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccdc180J3QNE4 AC159244.3-201ENSMUST00000222887 3153 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccdc180J3QNE4 Cps1-201ENSMUST00000027144 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccdc180J3QNE4 Urb2-201ENSMUST00000034457 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccdc180J3QNE4 Cep97-201ENSMUST00000023270 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccdc180J3QNE4 Dcn-201ENSMUST00000105287 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccdc180J3QNE4 Gm14326-201ENSMUST00000108928 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccdc180J3QNE4 Gm9429-201ENSMUST00000117804 868 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccdc180J3QNE4 Cul5-202ENSMUST00000120122 5945 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccdc180J3QNE4 4930448K20Rik-201ENSMUST00000120570 998 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccdc180J3QNE4 Gm16112-201ENSMUST00000159075 382 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccdc180J3QNE4 Gm17121-201ENSMUST00000170414 847 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccdc180J3QNE4 A730017C20Rik-206ENSMUST00000175830 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccdc180J3QNE4 Gm17222-201ENSMUST00000180135 847 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccdc180J3QNE4 Gm37429-201ENSMUST00000193807 1799 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccdc180J3QNE4 Gm35648-201ENSMUST00000202304 475 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccdc180J3QNE4 Gm4874-201ENSMUST00000203589 691 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccdc180J3QNE4 Gm18007-201ENSMUST00000205019 844 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccdc180J3QNE4 Ift80-201ENSMUST00000029347 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccdc180J3QNE4 Samt3-201ENSMUST00000047945 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccdc180J3QNE4 Obox3-201ENSMUST00000086122 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccdc180J3QNE4 Trpm3-204ENSMUST00000099564 3653 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccdc180J3QNE4 CT009480.1-201ENSMUST00000225771 4480 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccdc180J3QNE4 Olfr1505-203ENSMUST00000216835 3685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccdc180J3QNE4 Fam26d-202ENSMUST00000218239 3075 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccdc180J3QNE4 Hsf3-204ENSMUST00000164693 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccdc180J3QNE4 Adamts6-203ENSMUST00000224208 6480 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccdc180J3QNE4 Gm17654-201ENSMUST00000166110 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc180J3QNE4 Gm5594-201ENSMUST00000172712 1429 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc180J3QNE4 Stra6l-202ENSMUST00000107782 4009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc180J3QNE4 Gm14012-201ENSMUST00000136025 677 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc180J3QNE4 Gm3159-201ENSMUST00000164038 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc180J3QNE4 Gm22569-201ENSMUST00000175545 124 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc180J3QNE4 D530049I02Rik-201ENSMUST00000186582 562 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc180J3QNE4 Uts2b-201ENSMUST00000070531 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc180J3QNE4 Arhgef9-209ENSMUST00000181987 6222 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc180J3QNE4 Spag9-203ENSMUST00000075695 6910 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc180J3QNE4 CT025604.1-201ENSMUST00000221111 3436 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc180J3QNE4 Gm38377-201ENSMUST00000193253 3772 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc180J3QNE4 Ryr2-201ENSMUST00000021750 16814 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc180J3QNE4 Gm37875-201ENSMUST00000192101 1498 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc180J3QNE4 Olfr733-202ENSMUST00000214372 3530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc180J3QNE4 Rnf219-201ENSMUST00000022716 3420 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc180J3QNE4 Gm42881-201ENSMUST00000198636 3344 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc180J3QNE4 Igkv4-92-201ENSMUST00000103332 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc180J3QNE4 Tmem27-201ENSMUST00000015545 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc180J3QNE4 Dnaja1-ps-201ENSMUST00000162103 642 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc180J3QNE4 Vmn2r-ps6-201ENSMUST00000176317 1101 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc180J3QNE4 9330198I05Rik-201ENSMUST00000196846 1095 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc180J3QNE4 Gm35189-201ENSMUST00000219319 789 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc180J3QNE4 AC131745.2-201ENSMUST00000225736 565 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc180J3QNE4 Zp3r-203ENSMUST00000142416 1835 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc180J3QNE4 Vmn1r86-203ENSMUST00000227220 6445 ntAPPRIS P2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc180J3QNE4 Gm43469-201ENSMUST00000196084 4634 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccdc180J3QNE4 Arpp21-231ENSMUST00000178410 3419 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccdc180J3QNE4 Igkv5-37-201ENSMUST00000103372 359 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccdc180J3QNE4 Hmgn2l6-201ENSMUST00000115986 267 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccdc180J3QNE4 Olfr753-ps1-202ENSMUST00000174673 919 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccdc180J3QNE4 1700065J11Rik-201ENSMUST00000201560 424 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccdc180J3QNE4 Gm44516-201ENSMUST00000208794 833 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccdc180J3QNE4 Gm1715-201ENSMUST00000213681 1018 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccdc180J3QNE4 Gm6104-201ENSMUST00000078030 603 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccdc180J3QNE4 Gm13119-201ENSMUST00000094526 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccdc180J3QNE4 Catsperg1-212ENSMUST00000169143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccdc180J3QNE4 Gm21781-201ENSMUST00000178920 4838 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccdc180J3QNE4 Gm37482-201ENSMUST00000194899 2791 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccdc180J3QNE4 Fmn1-202ENSMUST00000099576 11817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
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