Protein–RNA interactions for Protein: F6U8V3

H2-M11, Histocompatibility 2, M region locus 11 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M11F6U8V3 Ehf-202ENSMUST00000111174 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-M11F6U8V3 Smarca2-203ENSMUST00000112637 1962 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-M11F6U8V3 Olfr1152-202ENSMUST00000213308 6201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-M11F6U8V3 Ktn1-207ENSMUST00000186761 3902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-M11F6U8V3 Gm26791-201ENSMUST00000180942 1605 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-M11F6U8V3 Vmn1r90-202ENSMUST00000226264 7796 ntAPPRIS P2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-M11F6U8V3 Olfr733-202ENSMUST00000214372 3530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-M11F6U8V3 Gm11270-201ENSMUST00000117685 471 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-M11F6U8V3 Gm13835-201ENSMUST00000118459 685 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-M11F6U8V3 Gm13702-201ENSMUST00000118542 825 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-M11F6U8V3 Gm11624-201ENSMUST00000118579 1041 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-M11F6U8V3 Gm11699-201ENSMUST00000119016 401 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-M11F6U8V3 Rpl21-ps9-201ENSMUST00000119897 482 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-M11F6U8V3 Gm12110-201ENSMUST00000121601 579 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-M11F6U8V3 Gm15300-201ENSMUST00000122324 279 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-M11F6U8V3 Gm26046-201ENSMUST00000157312 166 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-M11F6U8V3 Esd-ps-201ENSMUST00000170684 847 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-M11F6U8V3 Gm8919-201ENSMUST00000182028 1014 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-M11F6U8V3 Gm18407-201ENSMUST00000192126 790 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-M11F6U8V3 Gm37475-201ENSMUST00000193107 1015 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-M11F6U8V3 Gm38326-201ENSMUST00000194030 686 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-M11F6U8V3 Ighv8-5-201ENSMUST00000194257 358 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-M11F6U8V3 Gm37774-201ENSMUST00000194401 245 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-M11F6U8V3 Gm37386-201ENSMUST00000194755 72 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-M11F6U8V3 Gm34350-201ENSMUST00000208898 481 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-M11F6U8V3 Gm45326-201ENSMUST00000209234 721 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-M11F6U8V3 Gm4012-201ENSMUST00000221504 581 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-M11F6U8V3 AC153794.2-201ENSMUST00000222650 550 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-M11F6U8V3 AC154795.1-201ENSMUST00000225611 364 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-M11F6U8V3 AC164302.1-201ENSMUST00000227036 433 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-M11F6U8V3 Mcts1-201ENSMUST00000000365 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-M11F6U8V3 Fam229b-201ENSMUST00000063204 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-M11F6U8V3 Olfr1254-201ENSMUST00000099764 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-M11F6U8V3 4732496C06Rik-201ENSMUST00000206533 2500 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-M11F6U8V3 Gm4759-201ENSMUST00000183414 6622 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-M11F6U8V3 B530045E10Rik-202ENSMUST00000189035 3138 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-M11F6U8V3 2310002F09Rik-202ENSMUST00000181551 2468 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-M11F6U8V3 Il5-201ENSMUST00000048605 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-M11F6U8V3 Zp3r-203ENSMUST00000142416 1835 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-M11F6U8V3 Zfp644-201ENSMUST00000045466 5569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-M11F6U8V3 Pold3-209ENSMUST00000208670 1716 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-M11F6U8V3 Zscan4-ps2-201ENSMUST00000091440 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-M11F6U8V3 Abcc9-203ENSMUST00000100827 7306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
H2-M11F6U8V3 Hspa9-ps1-201ENSMUST00000119602 1933 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
H2-M11F6U8V3 Vmn1r30-202ENSMUST00000226334 1946 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
H2-M11F6U8V3 Cpa2-201ENSMUST00000096066 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
H2-M11F6U8V3 Ktn1-209ENSMUST00000187262 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
H2-M11F6U8V3 Olfr351-203ENSMUST00000215137 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
H2-M11F6U8V3 AC121942.1-201ENSMUST00000224459 2891 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
H2-M11F6U8V3 Fastkd1-201ENSMUST00000073152 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
H2-M11F6U8V3 Nfia-205ENSMUST00000107062 9239 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
H2-M11F6U8V3 Nlrp4c-204ENSMUST00000208360 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
H2-M11F6U8V3 Gm15293-201ENSMUST00000110754 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
H2-M11F6U8V3 Gm20815-201ENSMUST00000115496 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
H2-M11F6U8V3 Gm7927-201ENSMUST00000118818 880 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
H2-M11F6U8V3 Gm14375-201ENSMUST00000119490 855 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
H2-M11F6U8V3 Gm12281-201ENSMUST00000119536 298 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
H2-M11F6U8V3 Gm9005-201ENSMUST00000119908 607 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
H2-M11F6U8V3 Gm13363-201ENSMUST00000122008 522 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
H2-M11F6U8V3 Scgb2b23-ps-201ENSMUST00000122094 330 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
H2-M11F6U8V3 Gm12925-203ENSMUST00000140510 665 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
H2-M11F6U8V3 Gm10087-201ENSMUST00000167650 330 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
H2-M11F6U8V3 Olfr92-201ENSMUST00000168659 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
H2-M11F6U8V3 Vmn1r9-201ENSMUST00000171186 1051 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
H2-M11F6U8V3 Gm4221-201ENSMUST00000181538 1232 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
H2-M11F6U8V3 Gm26970-201ENSMUST00000182990 964 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
H2-M11F6U8V3 Gm29124-201ENSMUST00000186576 452 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
H2-M11F6U8V3 Scgb1b4-ps-201ENSMUST00000186920 271 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
H2-M11F6U8V3 Ly6e-206ENSMUST00000187284 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
H2-M11F6U8V3 Gm28080-201ENSMUST00000188552 722 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
H2-M11F6U8V3 Gm21812-202ENSMUST00000188908 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
H2-M11F6U8V3 Gm29587-201ENSMUST00000189898 332 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
H2-M11F6U8V3 Gm21524-201ENSMUST00000190499 696 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
H2-M11F6U8V3 Gm21715-201ENSMUST00000191056 694 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
H2-M11F6U8V3 Gm38122-201ENSMUST00000192679 885 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
H2-M11F6U8V3 4930519H02Rik-202ENSMUST00000198907 968 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
H2-M11F6U8V3 Gm43762-201ENSMUST00000201521 295 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
H2-M11F6U8V3 4933430N04Rik-202ENSMUST00000208031 1146 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
H2-M11F6U8V3 Gm45356-201ENSMUST00000209274 823 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
H2-M11F6U8V3 AC079680.1-201ENSMUST00000218730 649 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
H2-M11F6U8V3 AC124732.4-201ENSMUST00000220930 1274 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
H2-M11F6U8V3 Gm7240-202ENSMUST00000221961 353 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
H2-M11F6U8V3 AC107757.1-201ENSMUST00000226780 357 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
H2-M11F6U8V3 AC166105.1-201ENSMUST00000227512 482 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
H2-M11F6U8V3 Olfr794-201ENSMUST00000059957 963 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
H2-M11F6U8V3 Olfr684-201ENSMUST00000060893 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
H2-M11F6U8V3 Olfr532-201ENSMUST00000073226 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
H2-M11F6U8V3 Gm8412-201ENSMUST00000077493 440 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
H2-M11F6U8V3 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
H2-M11F6U8V3 4930480E11Rik-201ENSMUST00000035626 1486 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
H2-M11F6U8V3 4921524L21Rik-201ENSMUST00000044829 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
H2-M11F6U8V3 Olfr1261-204ENSMUST00000216953 3176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
H2-M11F6U8V3 Kif18a-201ENSMUST00000028527 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
H2-M11F6U8V3 Tmc1-201ENSMUST00000039500 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
H2-M11F6U8V3 Zfp449-201ENSMUST00000101560 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
H2-M11F6U8V3 Gm7919-201ENSMUST00000202043 1389 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
H2-M11F6U8V3 Gm37018-201ENSMUST00000192441 3869 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
H2-M11F6U8V3 4930550C14Rik-203ENSMUST00000215668 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
H2-M11F6U8V3 Vmn1r13-202ENSMUST00000226892 5156 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
H2-M11F6U8V3 Pirb-201ENSMUST00000078451 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms