Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Gm8358-201ENSMUST00000167222 555 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Gm17511-201ENSMUST00000172206 342 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Rps8-ps1-201ENSMUST00000172445 624 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Mdrl-201ENSMUST00000180483 1020 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 1700109K24Rik-201ENSMUST00000181870 1045 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Gm21842-202ENSMUST00000185311 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Gm29285-201ENSMUST00000185500 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Gm21801-202ENSMUST00000185537 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Gm28312-201ENSMUST00000185976 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Gm29213-201ENSMUST00000186199 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Gm21428-201ENSMUST00000186550 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Gm29370-201ENSMUST00000186581 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Gm28604-201ENSMUST00000186629 484 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Gm21633-202ENSMUST00000186630 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Gm28890-201ENSMUST00000186686 173 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Gm28092-201ENSMUST00000186709 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Gm28566-201ENSMUST00000186714 484 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Gm21572-202ENSMUST00000186850 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Gm21916-202ENSMUST00000187044 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Gm29839-201ENSMUST00000187045 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Gm28442-201ENSMUST00000187052 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Gm21780-202ENSMUST00000187110 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Gm29656-201ENSMUST00000187236 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Gm21821-202ENSMUST00000187288 175 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Gm28886-201ENSMUST00000187350 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Gm21599-202ENSMUST00000187381 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Gm28128-201ENSMUST00000187403 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Gm21450-201ENSMUST00000187408 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Gm28194-201ENSMUST00000187412 484 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Gm28689-201ENSMUST00000187441 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Gm28851-201ENSMUST00000187800 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Gm28886-202ENSMUST00000187889 484 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Gm28554-201ENSMUST00000187964 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Gm28984-201ENSMUST00000188202 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Gm21529-202ENSMUST00000188473 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Gm28604-202ENSMUST00000188638 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Gm21588-202ENSMUST00000188721 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Gm21539-202ENSMUST00000188764 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Gm28216-201ENSMUST00000188785 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Gm29645-201ENSMUST00000189117 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
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Clrn2B2RVW2 Gm21413-201ENSMUST00000189224 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Gm21723-202ENSMUST00000189444 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Gm36782-201ENSMUST00000189459 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Gm21419-201ENSMUST00000189495 173 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Gm28566-202ENSMUST00000189532 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
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Clrn2B2RVW2 Gm21626-202ENSMUST00000189751 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
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Clrn2B2RVW2 Gm28656-201ENSMUST00000190017 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
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Clrn2B2RVW2 Gm21562-202ENSMUST00000190314 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Gm28517-201ENSMUST00000190343 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
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Clrn2B2RVW2 Gm28194-202ENSMUST00000191217 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Gm28461-202ENSMUST00000191406 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Gm37927-201ENSMUST00000192238 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
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Clrn2B2RVW2 Gm21809-202ENSMUST00000194072 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
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Clrn2B2RVW2 AC162467.1-201ENSMUST00000220254 621 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Glrx-202ENSMUST00000220523 493 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 AC129085.4-201ENSMUST00000224536 570 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Thoc7-209ENSMUST00000225325 765 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Clec2j-201ENSMUST00000032517 515 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Fpr3-201ENSMUST00000054871 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
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Clrn2B2RVW2 Stxbp3-ps-201ENSMUST00000090527 758 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
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Clrn2B2RVW2 Vmn1r52-204ENSMUST00000227578 2370 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Gm37342-201ENSMUST00000194588 4965 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Olfr1504-202ENSMUST00000209192 1514 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 AC154576.1-202ENSMUST00000223966 3320 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Sytl5-202ENSMUST00000086165 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Gm35585-201ENSMUST00000195996 1570 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Cavin4-201ENSMUST00000030033 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Vmn2r84-201ENSMUST00000094502 3034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 AY512931-201ENSMUST00000139751 2395 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 AC136019.1-201ENSMUST00000226503 1412 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Stx17-202ENSMUST00000107720 5770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Kdm5d-201ENSMUST00000055032 7974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Olfr780-202ENSMUST00000215503 2910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Asap1-208ENSMUST00000176014 3435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
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